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海洋来源小单孢菌MicromonosporarosariaSCSION160中大环内酯类化合物的分离鉴定被引量：2: 2013年; 放线菌SCSIO N160是从南海海底沉积物中分离到的一株小单孢菌。从Micromonospora rosaria SCSIO N160的发酵液中,我们分离纯化了四个大环内酯类抗生素,通过质谱与核磁共振1H、13C NMR谱的解析,确定为rosamicin(1)、6108B(2)、M-4365 A1(3)和M4365-G1(4)。; 张文军李苏梅张海波张庆波张改云张光涛朱义广张长生; 关键词：小单孢菌大环内酯类抗生素

非核糖体肽类化合物的组合生物合成策略研究进展被引量：10: 2012年; 很多微生物能够利用非核糖体肽合酶合成结构复杂、种类繁多、生物活性多样的小分子肽类化合物。组合生物合成是对控制抗生素生物合成的基因簇进行阻断、置换、重组或异源表达等遗传操作,从而达到利用生物技术和环境友好的手段构建化合物衍生物库的目的。组合生物合成在增加天然活性化合物的数量,改良天然化合物的生物学活性,提高天然化合物的产量,开发创新药物和酶制剂等领域都具有重要应用价值。近年来,非核糖体肽的组合生物合成研究取得了重要进展。本文就非核糖体肽合酶的组合生物合成研究策略,从模块定点突变、替换、插入、删除、模块"洗牌"与异源表达等角度进行了综述。; 左佃光马俊英王博黄洪波刘静张云鞠建华; 关键词：组合生物合成功能模块异源表达

浅蓝霉素产生菌海洋异壁放线菌WH1-2216-6遗传操作体系的建立被引量：3: 2011年; 【目的】建立二联吡啶类抗生素浅蓝霉素的产生菌海洋异壁放线菌Actinoalloteichus sp.WH1-2216-6的遗传操作体系,以便对浅蓝霉素的相关生物合成基因进行体内敲除和基因回补等遗传操作。【方法】以整合型质粒pSET152为外源DNA,探索和优化了异壁放线菌WH1-2216-6菌株与大肠杆菌进行接合转移实验的方法和条件,以此为基础,利用PCR-targeting系统在体外构建了一个浅蓝霉素二羟基苯甲酸甲酯AMP连接酶基因敲除的cosmid质粒pCSG2104,并在优化后的条件下通过接合转移将其转入异壁放线菌WH1-2216-6野生型菌株。【结果】获得了异壁放线菌WH1-2216-6菌株的浅蓝霉素二羟基苯甲酸甲酯AMP连接酶基因缺失的双交换突变株,发酵结果显示该突变株失去了产生浅蓝霉素A和浅蓝霉素D的能力。【结论】高浓度的MgSO4对大肠杆菌与异壁放线菌的接合转移有促进作用,介导了异壁放线菌WH1-2216-6菌株的遗传操作体系的成功建立,为进一步研究浅蓝霉素的生物合成基因和对浅蓝霉素结构进行组合生物合成改造奠定了基础,同时也为其他类似放线菌的遗传操作体系的建立提供了借鉴和参考。; 林钦恒张光涛李苏梅张海波鞠建华朱伟明张长生; 关键词：生物合成

友菌素核苷转移酶amiE基因的克隆、表达和功能鉴定: 2012年; 【目的】克隆和表达二糖核苷类抗生素友菌素生物合成基因簇中的核苷转移酶基因amiE,并研究AmiE的体外催化功能。【方法】采用PCR技术将编码257个氨基酸的葡萄糖-1-磷酸核苷转移酶基因amiE克隆到表达载体pET28a上,构建质粒pCSG4001,转化入大肠杆菌E.coli BL21(DE3)中诱导表达;利用亲和层析分离纯化蛋白AmiE,以葡萄糖-1-磷酸和胸腺嘧啶三磷酸(TTP)或尿嘧啶三磷酸(UTP)为底物,利用高效液相检测AmiE的体外酶活;以甘露糖-1-磷酸、半乳糖胺-1-磷酸和半乳糖-1-磷酸和TTP作为底物,进一步研究AmiE对底物的选择性。【结果】N-末端融合组氨酸标签的AmiE蛋白在大肠杆菌中获得了可溶性表达,通过亲和层析纯化出的AmiE能够以TTP(或UTP)和葡萄糖-1-磷酸作为底物,催化形成胸腺嘧啶二磷酸葡萄糖(TDP-glucose)或者尿嘧啶二磷酸葡萄糖(UDP-glucose),但对其他三种底物,无明显催化活性。【结论】大肠杆菌中表达纯化的核苷转移酶AmiE能够体外催化形成TDP-葡萄糖(或UDP-葡萄糖),确证了AmiE作为核苷转移酶的催化功能,同时表明AmiE对底物具有一定的选择性。; 胡涛张光涛朱义广李苏梅张海波张改云杨晓红鞠建华张长生; 关键词：生物合成

海洋源放线菌Streptomyces sp.SCSIO 10428中吩嗪生物碱类抗生素的分离鉴定被引量：4: 2014年; 目的对从广西北海斜阳岛海域沉积物中分离的1株海洋源放线茵Streptomyces sp．SCSIO 10428进行次级代谢产物及活性研究。方法对海洋源放线菌Streptomyces sp．SCSIO 10428的发酵产物进行有机溶剂萃取，利用硅胶、凝胶柱层析等手段纯化次级代谢产物，通过波谱数据分析及文献比较对化合物进行结构鉴定，对化合物进行了抗菌、卤虫致死以及抗氧化活性评价。结果从海洋源放线菌Streptomyces sp．SCSIO 10428发酵产物中分离得到3个生物碱类化合物，其结构分别鉴定为1-甲氧基吩嗪（1），1-羟基吩嗪（2），吩嗪-1-羧酸（3）；活性结果显示化合物1～3对白色念珠菌和苏云金芽孢杆菌具有较强的抑制作用，化合物2具有较强的卤虫致死活性和微弱的抗氧化活性。结论发现了1株能够产生3个不同吩嗪生物碱类抗生素的海洋源放线菌Streptomyces sp．SCSIO 10428。; 吴正超郑六眷陈耀龙李洁陈玉婵章卫民张长生李苏梅; 关键词：链霉菌属吩嗪生物碱

海洋微生物活性先导化合物的发现及其生物活性研究: 目的:从南海海洋放线菌及真菌中分离获得次级代谢产物并筛选具有生物活性先导化合物。方法:运用抗菌、卤虫致死、细胞毒活性、HPLC-PAD等生物与化学组合筛选模型,从南海海底沉积物来源的500多株放线菌及200多株真菌中筛选...; 黄洪波陈子明姚月良罗明和任香梅周俊勇马俊英王博宋永相张长生鞠建华; 关键词：海洋放线菌海洋真菌次级代谢产物抗疟疾; 文献传递

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中国科学院知识创新工程重要方向项目(KZCX2-YW-JC202)