吉林省科技厅科技发展计划项目(200705492)
- 作品数：4 被引量：28H指数：3
- 相关作者：许松涛许文波刘桂艳周剑惠王爽更多>>
- 相关机构：吉林省疾病预防控制中心中国疾病预防控制中心长春市二道区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：吉林省科技厅科技发展计划项目艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 吉林省2001～2008年麻疹病毒血凝素蛋白基因特征和氨基酸变异分析被引量：11
- 2009年
- 目的研究吉林省2001～2008年麻疹病毒代表株的血凝素蛋白基因(Hemagglutinin,HA)特征和氨基酸变异。方法从吉林省2001～2008年流行的麻疹野病毒中选取5株代表株,提取核糖核酸,用逆转录-聚合酶链反应扩增HA基因片段,对扩增产物进行核苷酸序列分析,并与基因库中的中国麻疹疫苗病毒株沪191以及所有23种麻疹野病毒基因型代表株的H基因序列,进行基因亲缘关系、同源性、氨基酸变异以及糖基化位点变异比较。结果吉林省5株麻疹病毒分离株均属于H1基因型H1a基因亚型,5株病毒H基因之间有6～17个核苷酸差异(0.3%～0.9%),3～9个氨基酸差异(0.5%～1.5%)。与中国现行疫苗病毒株沪191H基因相比,有89～95个核苷酸差异(4.8%～5.1%),25～30个氨基酸差异(4.1%～4.8%)。与H1a基因亚型代表株China93-4H基因相比,有9～17个核苷酸差异(0.5%～0.9%),3～7个氨基酸差异(0.5%～1.2%)。吉林省5株麻疹病毒分离株的H蛋白均保留了4个糖基化位点,第5个糖基化位点在氨基酸第240位由丝氨酸突变成天冬酰胺,导致一个潜在糖基化位点NLS238～240的缺失。结论吉林省2001～2008年流行的5株麻疹病毒,均丢失了一个可能影响抗原性的糖基化位点。5株麻疹病毒的核苷酸、氨基酸差异均不大,但无论与H1a基因亚型代表株China93-4相比,还是与疫苗株S191相比,核苷酸和氨基酸的同源性均呈逐年递减趋势,吉林省麻疹野病毒H基因的变异仍在逐年增加、逐年积累。
- 周剑惠杜占森常新王爽陈超刘桂艳丛宪玲潘希平张燕许松涛许文波
- 关键词：麻疹病毒血凝素蛋白基因
- 中国麻疹病毒疫苗株与野毒株鉴别方法的建立被引量：15
- 2009年
- 目的研究建立一种简便快速的鉴别中国麻疹病毒疫苗株与野病毒的方法。方法在血凝素(Hemagglutinin)蛋白基因(H基因)上,寻找能将中国麻疹病毒疫苗株区别于野毒株的限制性内切酶酶切位点,并在包含此酶切位点的基因片段上设计逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)引物,同时对所建立的RT-PCR方法进行敏感性和特异性实验证明,对RT-PCR产物利用限制性片段长度多态性分析方法(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)进行酶切鉴定。结果该一步法RT-PCR方法比较敏感,至少能够检测4.64TCID50(50%组织培养感染剂量,Median Tissue Culture Infective Dose)麻疹病毒。而非麻疹病毒RT-PCR结果均未见阳性条带,说明RT-PCR方法特异。PCR产物经Af1Ⅱ酶切作用后,中国麻疹病毒疫苗株沪191与长47PCR产物均能被切成两个片段,分别为287bp和151bp,2株麻疹野病毒代表株均不能被Af1Ⅱ酶切。结论新建立的RT-PCR-RFLP是一种快速、简便的鉴别中国麻疹病毒疫苗株与野毒株的方法。
- 周剑惠王爽陈超常新刘桂艳桃育晖潘希平张燕许松涛许文波
- 关键词：麻疹病毒疫苗株野毒株逆转录-聚合酶链反应限制性片段长度多态性分析
- 吉林省2009年麻疹病毒血凝素蛋白基因特征
- 2012年
- 目的研究吉林省2009年麻疹病毒分离株的血凝素(Hemagglutinin,H)蛋白基因特征。方法 从吉林省2009年流行的麻疹野病毒中选取4株,用逆转录-聚合酶链反应扩增H蛋白全基因片段,对扩增阳性产物进行核苷酸序列测定,并利用Mega4.0和Bioedit软件进行基因亲缘关系、同源性以及糖基化位点变异分析。结果吉林省2009年4株麻疹病毒分离株均属于H1基因型H1a基因亚型,并在基因树H1a基因亚型分支中处于相对独立的小分支。2009年4株麻疹病毒分离株之间的核苷酸具有较高的同源性,为99.7%～99.8%;而且,无论与H1a基因亚型代表株China(中国)93-4相比,还是与疫苗株S(Shanghai,上海)191相比,2009年麻疹病毒分离株核苷酸同源性均延续了历年的逐年递减趋势。吉林省2009年4株麻疹病毒分离株的H蛋白均保留了4个糖基化位点,第5个糖基化位点在氨基酸第240位由丝氨酸(Serine,S)突变成天冬酰胺(Asparagine,N),导致一个潜在糖基化位点NL(亮氨酸Leucine,L)S238-240的缺失。结论吉林省2009年的麻疹病毒分离株H蛋白基因的核苷酸变异,与历年相比呈增加趋势。吉林省2009年麻疹病毒分离株第240位糖基化位点的丢失,与中国目前监测到的情况一致。
- 侯祥陈超周剑惠王爽刘桂艳魏雷雷丛宪玲田鑫曹凤瑞许松涛许文波
- 关键词：麻疹病毒血凝素蛋白基因
- 麻疹病毒H_1和H_2基因型快速鉴定方法的改进被引量：5
- 2009年
- 目的简化麻疹病毒H1和H2基因型快速鉴定方法的步骤,使之操作更加简单快速。方法将逆转录-套式聚合酶链反应(Reverse Transcription-Nested Polymerase Chain Reaction,RT-nPCR)改进为一步法RT-PCR,使用原方法中的一对内引物,将扩增后的PCR产物用限制性片段长度多态性分析进行基因型鉴定,同时电泳检测也用较安全的荧光染料GeneFinder代替了有致癌性的溴化乙锭染色。结果该研究中使用的已知为H1基因型的3株麻疹病毒,其核酸全部能被改进的一步法RT-PCR有效扩增,并且PCR产物被内切酶SalⅠ有效切开,而且保持了原方法较好的敏感性和特异性。结论改进的麻疹病毒H1和H2基因型快速鉴定方法是一种更加快速、简便又实用的基因定型方法。
- 周剑惠杜占森王爽陈超常新刘桂艳张晓磊许松涛姬奕昕许文波
- 关键词：麻疹病毒逆转录-聚合酶链反应限制性片段长度多态性分析基因型
