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博士研究生创新基金(2007053)

作品数：2 被引量：0H指数：0
相关作者：陈启龙梁俊毅马文丽吴飞珍姚文娟更多>>
相关机构：上海大学黄山学院南京大学更多>>
发文基金：博士研究生创新基金国家自然科学基金更多>>
相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学
  • 1篇自动化与计算...

主题

  • 2篇英文
  • 2篇同源建模
  • 2篇SOX
  • 2篇MATLAB
  • 1篇东北虎

机构

  • 2篇上海大学
  • 1篇南京大学
  • 1篇黄山学院

作者

  • 2篇陈启龙
  • 1篇郑文岭
  • 1篇姚文娟
  • 1篇吴飞珍
  • 1篇马文丽
  • 1篇梁俊毅

传媒

  • 1篇系统仿真学报
  • 1篇四川动物

年份

  • 2篇2008
共 2 条 记 录，以下是 1-2
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排序方式：
基于SwissPdbViewer和MATLAB对东北虎Sox蛋白三级结构建模及分析(英文)
2008年
SOX蛋白具有一个与DNA特异结合的高保守HMG-box结构域。为研究东北虎SOX蛋白三级结构的分子机理,利用MATLAB的Bioinformatics工具从GenBank中下载东北虎SOX蛋白序列信息,以三级结构已知的SOX2为模板,联合SwissPdbViewer与MATLAB,采用同源建模方法对SOX蛋白HMG-box进行建模、预测;利用MATLAB的Visualization Tool分析预测结果的三维结构。结果显示PtSox蛋白的HMG-box由3个α-螺旋和2个loop区构成;热稳定性分析表明PtSox蛋白loop区的热力学结构不稳定;表面静电分布显示出PtSox蛋白C-端的中间有一个可能与其它小分子或蛋白质的相互作用位点的N/C腔,上述空间结构可能与其活性与功能的调控有关。
梁俊毅陈启龙
关键词：MATLAB同源建模东北虎
基于SwissPdbViewer和MATLAB对人类SOX蛋白三级结构建模及分析(英文)
2008年
SOX蛋白具有一个与DNA特异结合的高保守HMG-box结合域。利用MATLAB的Sequence Analysis工具从Genbank中下载人类SOX蛋白序列信息,二次筛选获得22个有效的序列数据。以三级结构已知的SOX2、SRY、SOX5为模板,联合SwissPdbViewer与MATLAB,采用同源建模方法对SOX蛋白HMG-box进行建模、预测;利用MATLAB的Visualization Tool分析预测结果的三维结构。结果显示SOX蛋白HMG-box的三级结构极为相似,由3个α螺旋和2个热力学结构不稳定的loop区构成;表面静电分析显示SOX蛋白C端有一个可能与其它小分子或蛋白质的相互作用位点的N/C腔。SOX蛋白的上述空间结构可能与其活性与功能的调控有关。
陈启龙郑文岭姚文娟吴飞珍马文丽
关键词：MATLAB同源建模
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