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霍英东基金(314-14591)
作品数:
1
被引量:4
H指数:1
相关作者:
杨旭夫
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2011
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副猪嗜血杆菌的MLST分析及数据库建立
被引量:4
2011年
对副猪嗜血杆菌86个分离株的7个看家基因,包括ATP合成酶J9链(atpD)、翻译起始因子IF-2(in-fB)、核糖体蛋白口亚基(rpoB)、苹果酸脱氢酶(mdh)、6-磷酸葡萄糖脱氢酶(6pgd)、3-磷酸甘油醛脱氢酶(g3pd)和延胡索酸还原酶B(frdB)进行了PCR扩增;对扩增产物进行了测序;对序列编辑、队列比对、建立MI.ST定义、等位基因序列文件等,与牛津大学动物系KeithJolley合作建立了副猪嗜血杆菌86个分离株的MI。ST数据库。经MLST分析发现所研究的分离株有高度的遗传异源性,86个菌株被分成74个序列类型。基因平均距离为0.674,h-0.804。每个基因位点存在64~76不等数目的等位基因。基因序列多态性位点最大(fedB)达325和(6pgd)219,最小(in,-B)为77;用UPGMA分析确定了5个菌群。
朱必凤
杨旭夫
彭凌
韦昭玉
关键词:
副猪嗜血杆菌
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