国家自然科学基金(39970763) 作品数:5 被引量:13 H指数:3 相关作者: 张小为 郭红燕 韩劲松 王静 熊光武 更多>> 相关机构: 北京大学第三医院 北京大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统研究卵巢癌的血清蛋白表达谱 被引量:6 2008年 目的:应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统分析卵巢癌的血清蛋白质表达谱,寻找具有潜在诊断意义的血清标志物,以利于卵巢癌的早期诊断。方法:收集2组卵巢肿瘤患者(其中卵巢浆液性乳头状囊腺癌20例、卵巢浆液性乳头状囊腺瘤9例)和1组正常人(10例)血清样本,经ClinProt磁珠纯化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析及ClinProTools生物信息学方法研究其血清蛋白表达谱。每组样品重复检测3次。结果:3组血清样品的蛋白丰度的平均变异系数(CV值),分别为0.151、0.246和0.147,证实该试验标准具有良好重复性。质荷比(m/z)为1451和2673的蛋白峰能较好地鉴别卵巢癌和非癌组。结论:液体蛋白芯片飞行时间质谱系统作为研究蛋白表达谱的工具,具有较好的重复性与精度,筛选得到的m/z为1451和2673的蛋白可能为潜在的卵巢癌肿瘤标志物。 王静 张小为 袁杨 郭红燕 熊光武 于中连 张健 胡晓慧 殷汝雷关键词:卵巢肿瘤 蛋白质谱 应用SELDI-TOF-MS技术建立卵巢浆液性乳头状囊腺癌诊断的血浆蛋白质组学模型 被引量:4 2008年 目的:通过蛋白质芯片-质谱技术结合生物信息学的支持向量机方法,筛选卵巢浆液性乳头状囊腺癌患者差异表达的蛋白质峰,探讨建立数学逻辑的卵巢浆液性乳头状囊腺癌诊断模型及其意义。方法:采用表面增强激光解离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术,运用CM10蛋白质芯片(一种弱阳离子芯片)分别检测26例卵巢浆液性乳头状囊腺癌和51例对照组(其中卵巢囊肿12例、子宫肌瘤31例、卵巢良性囊腺瘤8例)的血浆标本,对所得到的质谱数据采用Biomarker Wizard软件分析,初步筛选蛋白质峰,结合生物信息学的支持向量机(support vector machines,SVM)方法建立并测试卵巢浆液性乳头状囊腺癌患者以及对照组的血浆蛋白质谱诊断模型。结果:应用SELDI-TOF-MS在CM10芯片上捕获到的蛋白质,经过Biomarker Wizard软件分析筛选出了卵巢浆液性乳头状囊腺癌患者与对照组的71个差异蛋白质峰(P<0.01),利用SVM方法再次筛选获得7个蛋白质峰组成卵巢浆液性乳头状囊腺癌的蛋白质谱最优化模型,这7个蛋白质中质荷比(m/z)为4099、4477、4123、4081和3938的表达上调,质荷比(m/z)为8785和13783的表达下降。经三倍交叉验证后用盲法测定,所建模型用于卵巢浆液性乳头状囊腺癌患者与对照组鉴别的敏感度和特异度分别为84.62%和96.08%,阳性预测值为92.21%。结论:蛋白质芯片-质谱技术可以快速、有效地筛选出卵巢浆液性乳头状囊腺癌患者血浆差异蛋白质,结合SVM可建立有效的蛋白质质谱诊断模型,对卵巢癌诊断方法的建立具有潜在意义。 葛晓慧 王静 郭红燕 熊光武 韩劲松 张璐芳 张小为关键词:卵巢肿瘤 光谱分析 支持向量机 端粒酶和Ki-67在卵巢上皮性肿瘤中的表达 2008年 目的:研究端粒酶的催化亚基hTERT(human telomerase reverse transcriptase)和Ki-67在卵巢上皮性肿瘤中的表达情况及其意义。方法:采用原位杂交方法检测卵巢恶性肿瘤35例、临界恶性肿瘤(Low-Malignant-Po-tential tumor,LMP)8例和良性上皮源性肿瘤20例hTERT基因的表达,同时用免疫组化检测与细胞增殖相关的核抗原Ki-67的表达。结果:63例卵巢上皮性肿瘤中,良性肿瘤hTERT基因表达阳性率5%(1/20),临界恶性肿瘤阳性率38%(3/8),恶性肿瘤阳性率74%(26/35),良性、临界恶性和恶性肿瘤间hTERT的表达存在着显著性差异(P<0.05)。Ki-67阳性分布为:良性肿瘤均为阴性表达,临界恶性肿瘤表达率25%(2/8),恶性肿瘤表达率49%(17/35),良性、低度恶性和恶性肿瘤间Ki-67核抗原的表达存在着显著性差异(P<0.01)。结论:原位杂交检测hTERT基因的表达对于鉴别诊断良恶性卵巢上皮性肿瘤有参考价值;hTERT表达的上调可能在卵巢上皮性肿瘤的进展中起重要作用;hTERT基因表达与Ki-67核抗原表达有弱正相关性(r=0.274,P<0.05)。 周蕴华 杨池荪 韩劲松 郭红燕 王秀云 高荣莲 张小为关键词:卵巢上皮性肿瘤 HTERT 原位杂交 KI-67 双向凝胶电泳-质谱技术行卵巢癌血浆标志物分析 被引量:3 2009年 目的探索卵巢癌潜在的肿瘤标志物。方法抽取2004年8月至2007年10月在北京大学第三医院就诊的卵巢浆液性乳头状囊腺癌20例血浆与对照组妇女20例血浆,去除血浆中的高丰度蛋白(白蛋白/IgG)后,采用离心超滤对两组血浆蛋白脱盐、浓缩;应用双向凝胶电泳-质谱技术(2-DE/MS)分离两组血浆样品,经图像分析软件对比两组间的差异蛋白后,通过液相色谱-质谱技术(LC-MS/MS)鉴定差异蛋白点,并与蛋白质数据库资料进行对比分析。结果两组共发现11个差异蛋白点(两组间的蛋白表达强度升高或降低200%者定义为差异点),对其中4个分子质量较小的进行了鉴定,与蛋白质数据库对比后,发现为触珠蛋白、血红蛋白β亚基、载脂蛋白C-Ⅲ和甲状腺素运载蛋白,前两者在卵巢浆液性乳头状囊腺癌组血浆中表达上调,后两者表达下调。结论触珠蛋白、血红蛋白β亚基、载脂蛋白C-Ⅲ、甲状腺素运载蛋白可能为卵巢癌潜在的肿瘤标志物,但尚需做深入研究。 王静 张小为 袁杨 彭嘉柔 杨彬 刘丹 邹霞娟 娄雅欣 钟丽君 郭红燕 熊光武 韩劲松 张璐芳 梁华茂关键词:卵巢肿瘤 双向凝胶电泳 质谱 血浆标志物 端粒酶和c-erbB-2在卵巢上皮性肿瘤中的表达 2004年 目的 研究端粒酶的催化亚基hTERT (humantelomerasereversetranscriptase)和癌蛋白c-erbB - 2在卵巢上皮性肿瘤中的表达及意义。方法 采用原位杂交法检测卵巢恶性 (35例 )、临界恶性 (low -malignant -potentialtumor,LMP) (8例 )和良性 (2 0例 )上皮源性肿瘤hTERT基因表达 ,同时用免疫组化检测癌蛋白c -erbB- 2的表达。结果 6 3例卵巢上皮性肿瘤中 ,良性肿瘤hTERT基因表达阳性率 5 % (1 2 0 ) ,临界恶性肿瘤阳性率38% (3 8) ,恶性肿瘤阳性率 74 % (2 6 35 ) ,良性、临界恶性和恶性肿瘤间hTERT的表达差异存在着显著性 (P<0 0 5 ) ;良性肿瘤c -erbB - 2均为阴性表达 ,临界恶性肿瘤表达率 75 % (6 8) ,恶性肿瘤表达率 5 7% (2 0 35 ) ,良性分别和临界恶性、恶性肿瘤间c -erbB - 2癌蛋白的表达差异存在着显著性 (P <0 0 1)。hTERT基因表达与c-erbB - 2癌蛋白表达有弱正相关性 (r=0 2 98,P <0 0 5 )。结论 hTERT基因的表达与卵巢癌恶性程度正相关 ;c-erbB - 2蛋白在卵巢良性肿瘤中不表达 ,在卵巢临界恶性和恶性肿瘤中表达率明显增高。 周蕴华 张小为 杨池荪 韩劲松 郭红燕 赵扬玉 赵文秋 王秀云 高荣莲关键词:表达率 C-ERBB-2 癌蛋白 卵巢上皮性肿瘤 HTERT基因 端粒酶