国家自然科学基金(30800712)
- 作品数：1 被引量：1H指数：1
- 相关作者：李依民董艳玲张岗孙燕飞王晓杰更多>>
- 相关机构：陕西省农业分子生物学重点实验室西北农林科技大学更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 小麦过敏性诱导反应基因TaHIR4的克隆及序列分析被引量：1
- 2010年
- 【目的】克隆条锈菌诱导的小麦过敏性反应(Hypersensitive induced reaction,HIR)基因TaHIR4,分析其编码蛋白的结构、进化与功能。【方法】采用电子克隆、RT-PCR技术,从条锈菌侵染的小麦中,分离过敏性诱导基因TaHIR4,并对其进行克隆和序列分析;利用InterProScan、TMpred、SignalP 3.0、PSORT等在线分析工具,预测TaHIR4蛋白的保守结构域、跨膜结构、信号肽、细胞定位等特征;采用DNASTAR软件分别进行氨基酸序列同源性比对和进化树分析。【结果】分离到小麦过敏性诱导基因,命名为TaHIR4(867bp,GenBank注册号为FJ028663),该基因编码1条由288个氨基酸组成的多肽;TaHIR4蛋白含HIR蛋白家族的保守SPFH(Stomatins,Prohibitin,Flotillins,HflK/C)、PHB(Prohibitin homologues)结构域,有4种典型的motifs(蛋白激酶、酪蛋白激酶Ⅱ、酪氨酸激酶磷酸化和N-豆蔻酰化位点),N末端的19个氨基酸序列内部存在跨膜信号肽结构,可能属于分泌蛋白;TaHIR4与HvHIR4蛋白的亲缘关系最近,同源性最高(98%),其次为OsHIR4,同源性为91%。【结论】分离到1个条锈菌诱导的小麦HIR基因TaHIR4,其编码蛋白可能属于分泌蛋白,在胞外行使功能。
- 张岗孙燕飞李依民董艳玲夏宁王晓杰黄丽丽康振生
- 关键词：小麦条锈菌过敏性反应电子克隆
