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国家重点基础研究发展计划(2011CB100106)

作品数:14 被引量:124H指数:6
相关作者:徐辰武张焕欣翁建峰郝转芳张丹更多>>
相关机构:扬州大学中国农业科学院作物科学研究所江苏沿江地区农业科学研究所更多>>
发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金江苏省农业科技自主创新基金更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 14篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 10篇农业科学
  • 5篇生物学

主题

  • 9篇玉米
  • 8篇基因
  • 6篇性状
  • 4篇数量性状
  • 4篇基因组
  • 3篇自交
  • 3篇自交系
  • 3篇位点
  • 2篇性状基因
  • 2篇育种
  • 2篇数量性状基因
  • 2篇数量性状位点
  • 2篇全基因
  • 2篇全基因组
  • 2篇全基因组关联...
  • 2篇候选基因
  • 2篇QTL
  • 2篇QTL定位
  • 2篇QTL分析
  • 2篇SSR标记

机构

  • 7篇扬州大学
  • 3篇中国农业科学...
  • 3篇江苏沿江地区...
  • 2篇苏州大学
  • 2篇沈阳农业大学
  • 1篇江苏里下河地...
  • 1篇南京农业大学
  • 1篇重庆市农业科...
  • 1篇如皋市农业科...

作者

  • 5篇徐辰武
  • 3篇薛林
  • 3篇郝转芳
  • 3篇翁建峰
  • 3篇张焕欣
  • 3篇张丹
  • 2篇李新海
  • 2篇石明亮
  • 2篇王宏伟
  • 2篇吕香玲
  • 2篇汤在祥
  • 2篇江培顺
  • 2篇李博
  • 1篇刘昌林
  • 1篇张世煌
  • 1篇邓德祥
  • 1篇郝德荣
  • 1篇徐亮
  • 1篇金艳
  • 1篇胡文明

传媒

  • 4篇江苏农业学报
  • 3篇作物学报
  • 2篇Scienc...
  • 1篇中国农业科学
  • 1篇麦类作物学报
  • 1篇作物杂志
  • 1篇江西农业学报
  • 1篇Journa...
  • 1篇2018中国...

年份

  • 1篇2018
  • 1篇2015
  • 2篇2014
  • 4篇2013
  • 5篇2012
  • 2篇2011
14 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
数量遗传学在玉米育种中的应用被引量:1
2012年
阐明了数量遗传学的发展概况以及在当今育种领域应用的重要性,同时通过玉米产量及其相关性状配合力、遗传力的分析,探讨了玉米产量及其相关性状育种的建系和选择方法,特别指出了种植密度在产量鉴定试验中的作用,为更好地开展玉米育种服务。
石明亮薛林程玉静胡加如陈国清黄小兰陆虎华郝德荣冒宇翔
关键词:玉米数量遗传学性状遗传力种植密度
Characterization of the Promoter of a Homolog of Maize MADS-Box Gene m18
2014年
Maize(Zea mays L.) is one of the world's major food crops, and often suffers from tremendous yield loss caused by abiotic stresses. The MADS-box genes are known to play versatile roles in plants, controlling plant responses to multiple abiotic stresses. However, understanding of regulation of their expressions by the conventional loss-of-function approach is very difficult. So far, regulation of MADS-box gene expression is little known. The best approach to retrieve expression regulation of this category of genes is to characterize expression of their promoters. In this study, the promoter of a homolog(Gen Bank accession no. EC864166) of maize MADS-box gene m18 was cloned by way of genome-walking PCR, named Pro66. Predicative analysis indicated that Pro66 contains more than one TATA box and multiple cis-acting environmental conditions-responsive elements(ECREs). Pro66 could drive expression of the β-glucuronidase(GUS)-encoding gene in maize, and heterologous expression of GUS in red pepper stressed by water deficit, salt, copper, iron deficiency, heat, cold, and grown under short and long photoperiods, echoing predicative ECREs. Conclusively, maize MADS-box gene m18 likely plays versatile functions in maize response to multiple abiotic stresses due to the promoter with multiple cis-acting elements. The complex arrangement of multiple cis-acting elements in the promoter features meticulously regulated expression of m18. The results give informative clues for heterologous utilisation of the promoters in monocot and dicot species. The copy of the ECREs and heterologous expression of the promoter in dicot species are also discussed.
QIN Hui-juanPAN HongFAN Xian-weiWU QiaoLI You-zhi
关键词:MADS盒基因同源基因MADS-BOX基因顺式作用元件
玉米抗粗缩病自交系种质的发掘和遗传多样性及其在育种中的应用被引量:25
2011年
玉米粗缩病是近十年来危害我国部分玉米产区的主要病害之一,挖掘抗粗缩病玉米种质,进而培育抗病品种是防治粗缩病危害最经济有效的途径。选用184份常用玉米自交系(包括111份普通玉米和73份糯玉米)于2009—2010年在玉米粗缩病重发区江苏沿江地区农业科学研究所试验田进行田间自然鉴定;同时利用117对SSR引物对供试的玉米自交系进行多态性检测,按UPGMA方法,利用Powermarker 3.0软件对184份自交系进行系统聚类分析。筛选出2份高抗(T877和YJ7)、6份抗病普通自交系和2份糯玉米抗性种质。基于644个SSR多态性位点,结合系谱资料和育种实践,将184份自交系划为9个杂种优势亚群。自交系4S及其衍生系(第VI亚群)和来源于美国杂交种78599的玉米自交系(第VIII亚群)为玉米抗粗缩病育种的重要种质。
薛林张丹徐亮金萌萌彭长俊徐辰武
关键词:玉米自交系粗缩病抗性鉴定
基于R/qtl不同方法对玉米株高QTL定位结果的比较被引量:1
2013年
R/qtl是基于R语言的QTL分析专用作图软件。为了研究R/qtl不同作图方法在分析结果上的差异,采用1个玉米F2∶3家系的株高实际数据,分别按该软件提供的区间作图法(IM)、复合区间作图法(CIM)、二维扫描和多QTL拟合进行数据分析和结果比较。在株高性状上共定位到8个QTL,其中,IM法检测到7个,总共解释表型变异的54.57%,有3个QTL在4种算法中都能检测到,其位置、LOD值、置信区间以及贡献率估计4种算法分析结果基本一致。CIM法共检测到5个QTL,可解释总变异的27.66%,其中,位于第3染色体158 cM和222 cM的2个QTL在所有4种算法中都能检测到,第7染色体36 cM处的QTL首次被检测到,其余4个QTL与IM法检测到的相应QTL一致。二维QTL扫描共检测到7个QTL,累计贡献率达到54.97%,未检测到显著互作的QTL,除第6染色体33.5 cM处的QTL外,其他QTL与IM法检测到的一致。多QTL拟合只检测到3个QTL,累计贡献率为21.52%,也未检测到QTL间显著互作。以上分析结果表明:不同方法检测到的QTL无论在数量上还是在贡献率估计上均存在一定程度上的差异,但一些主要QTL在用不同方法分析中通常都能被发现。此外,本研究群体株高性状的遗传模式仅有主效应QTL,上位性QTL均未检测到。
胡文明汤在祥徐扬邓张泽徐辰武
关键词:QTL
基因组选择方法及其应用研究
【研究背景】基因组选择(genomic selection,GS)是由Meuwissen等(2001)首先提出的,它能够估计全基因组上所有标记的遗传效应,进而实现对品种更加全面、可靠的选择。目前已经在动植物如奶牛、水稻和...
徐扬王欣徐辰武
文献传递
玉米穗位高全基因组关联分析及其候选基因预测被引量:9
2013年
利用41101个SNP标记对159份我国玉米自交系进行全基因组分析。通过控制群体结构和亲缘关系,采取混合线性模型,检测到7个与穗位高显著相关SNP(P<0.0001),并确定7个候选基因,其注释功能有GABA-B受体活性、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性、组蛋白-赖氨酸N-甲基转移酶活性、转运活性、翻译起始因子活性和酰胺基tRNA水解酶活性。利用BioMercator2-1软件将收集的137个穗位高QTL整合至IBM2 2008Neighbors玉米遗传图谱上,确定19个"一致性"QTL,结合分析7个与穗位高显著相关的SNP位点信息,获得2个候选基因。
李博张焕欣杨小艳吕颖颖江培顺郝转芳吕香玲王宏伟翁建峰
关键词:玉米穗位高全基因组关联分析
基于SSR标记的江苏沿江地区糯玉米种质资源遗传多样性研究被引量:19
2011年
为研究江苏沿江地区糯玉米种质的遗传多样性以及江苏省糯玉米的遗传改良和杂种优势利用提供参考,利用93对SSR标记研究55份糯玉米自交系和30份糯玉米单交种的遗传多样性,并利用UPGMA方法对所有自交系材料进行系统聚类。结果表明在自交系中筛选出88对多态性较好的引物,共扩增出350个差异片断,每对引物检测出2~9个差异片段,平均为3.98个;SSR标记的多态性信息量值在0.137与0.832之间,平均为0.520。在单交种中筛选出87对多态性好的引物,扩增出311个差异片断,每对引物可检测出2~9个差异片断,平均3.57个,SSR标记的多态性信息量值在0.064与0.839之间,平均为0.475。利用UPGMA聚类分析方法将所有供试自交系分为4类,划分结果基本符合品系的来源情况,江苏沿江地区糯玉米种质资源主要由通系5群、衡白522群以及突变体材料组成,多样性较为丰富,可为糯玉米遗传改良提供一定的遗传基础。
刘丽君张丹薛林李建徐辰武
关键词:糯玉米自交系单交种SSR标记
江苏主栽小麦品种遗传多样性的SSR分析被引量:5
2015年
为了从分子水平上明确江苏省小麦品种资源的遗传多样性水平,选用138对微卫星分子标记(SSR)对江苏省近40年来的90份主栽小麦品种的遗传多样性进行研究。结果表明,在90份主栽品种中,138个SSR位点共检测到542个等位变异,平均每个住点有3.93个等位变异,变化范围2~11;多态性信息含量(PIC值)变化范围为0.0326~0.8245,平均为0.4151;基因组的平均等位变异及PIC值均为B〉A〉D;对90个品种按照所应用的麦区可分为淮北麦区品种(45个)和淮南麦区品种(45个),淮北麦区品种平均PIC值为0.4287,淮南麦区品种平均PIC值为0.3566,淮南麦区品种基因多样性和PIC值显著低于淮北麦区,并且不同时期淮北和淮南麦区品种的遗传多样性也存在不同的变化趋势。
喻俊杰金艳张勇徐辰武
关键词:小麦SSR标记淮北麦区淮南麦区
基于QTL定位分析策略的一般配合力遗传基础研究被引量:6
2013年
【目的】一般配合力(GCA)是评价亲本利用价值的重要指标。研究GCA的遗传基础及GCA相关QTL(QTLGCA)定位的可行性,为杂交育种提供技术参考。【方法】以双亲杂交衍生的重组自交系(RIL)为被测系、若干个随机选择的纯系为测验系的NCII交配设计以及QTL定位策略,系统研究GCA的遗传组成、影响QTLGCA定位的因素以及QTLGCA与性状本身QTL之间的关系。【结果】若性状受1对等位基因控制,RIL的GCA以及QTLGCA定位均与控制性状本身基因位点的加性效应、显性效应以及测验系等位基因的频率有关;若性状受2对加/显性的等位基因控制,则GCA估计及QTLGCA定位均与基因间是否连锁无关,其影响因素与性状受一个基因控制时相同;若性状受2对互作基因控制,GCA及QTLGCA定位均与测验系等位基因频率和性状本身QTL的主效应以及基因间互作效应有关,此外,GCA效应估计还与基因间是否连锁有关。【结论】无论是GCA效应估计还是QTLGCA定位,测验系等位基因频率和性状本身QTL效应大小都是重要的影响因素。此外,QTLGCA与性状本身QTL的差异还取决于性状的遗传结构以及QTL定位方法的选择。
胡文明徐扬张恩盈徐辰武
关键词:一般配合力QTL定位
玉米产量相关性状Meta-QTL及候选基因分析被引量:21
2013年
借助IBM2 2008 Neighbors高密度玉米遗传图谱整合了1994—2012年文献发表的玉米产量性状(穗行数、行粒数、粒重)584个QTL。采用元分析方法,确定了22个穗行数、7个行粒数和44个粒重Meta-QTL。根据B73基因组序列进行产量相关基因的重定位,在Meta-QTL区段内分别获得10个玉米产量基因和12个与水稻7个产量基因同源的候选基因,分别位于玉米染色体Bins1.04、1.06、1.07、2.04、2.06、3.04、4.05、4.07、4.09、5.03、5.04、5.05、7.02、8.03、9.03、10.06和10.07。玉米产量性状Meta-QTL及相关候选基因分析可以为分子标记辅助育种和基因克隆提供有用的信息。
江培顺张焕欣吕香玲郝转芳李博李明顺王宏伟慈晓科张世煌李新海史振声翁建峰
关键词:玉米产量性状候选基因
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