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海南省自然科学基金(809009)

作品数:5 被引量:47H指数:4
相关作者:胡静祝斐尹绍武胡亚丽贾一何更多>>
相关机构:南京师范大学海南大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金海南省自然科学基金“十一五”国家科技支撑计划更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 5篇中文期刊文章

领域

  • 3篇农业科学
  • 2篇生物学

主题

  • 5篇波纹唇鱼
  • 2篇地理群体
  • 2篇遗传分化
  • 2篇MTDNA
  • 2篇不同地理群体
  • 1篇序列变异分析
  • 1篇序列对
  • 1篇群体遗传多样...
  • 1篇微卫星
  • 1篇微卫星分子标...
  • 1篇控制区
  • 1篇分子标记
  • 1篇MTDNA_...
  • 1篇MTDNA控...
  • 1篇CO
  • 1篇CYTB
  • 1篇CYTB基因
  • 1篇LOOP
  • 1篇磁珠富集
  • 1篇磁珠富集法

机构

  • 4篇南京师范大学
  • 4篇海南大学

作者

  • 4篇尹绍武
  • 4篇祝斐
  • 4篇胡静
  • 3篇胡亚丽
  • 2篇朱晓平
  • 2篇骆剑
  • 2篇齐兴柱
  • 2篇侯新远
  • 2篇贾一何
  • 1篇彭艳辉
  • 1篇王小军
  • 1篇刘志亮
  • 1篇张国庆

传媒

  • 2篇海洋科学
  • 1篇水生生物学报
  • 1篇海南大学学报...
  • 1篇海洋通报

年份

  • 1篇2017
  • 2篇2014
  • 2篇2012
5 条 记 录,以下是 1-5
排序方式:
波纹唇鱼微卫星分子标记的筛选及适用性分析被引量:7
2012年
采用磁珠富集法及利用生物素标记的(CA)15寡核苷酸探针从波纹唇鱼(Cheilinusundulatus)基因组DNABspl43I酶切位点的400~1000bp片段中筛选CA/GT微卫星位点。洗脱的杂交片段克隆到PMD18.T载体上构建富集微卫星基因组丈库后,通过PCR筛选出阳性克隆进行测序。在120条序列中有88条序列包含有重复次数不少于5次的微卫星位点,阳性序列比例达到73.33%。其中完美型(perfect)类型微卫星最多的重复次数为26次。在88条非冗长序列中,共有28条r31.82%)微卫星重复序列两端有侧翼序列能够进行引物设计。用波纹唇鱼3个个体的混合基因进行引物筛选,其中的24对具有清晰的扩增条带。将筛选的24对引物对波纹唇鱼1个群体的39个个体进行遗传多样性分析,其中4对引物扩增产物为单态,20对扩增产物呈多态性;20对扩增多态的引物在39个个体中扩增出等位基因数为2~12,平均有效等位基因数为3.5。该波纹唇鱼群体的P/C、Ho,He的平均值分别为0.0782、0.8513、0.5667。这20个微卫星位点适于波纹唇鱼群体遗传结构的研究分析。
彭艳辉骆剑尹绍武朱晓平胡静刘志亮祝斐齐兴柱胡亚丽
关键词:微卫星分子标记磁珠富集法
波纹唇鱼mtDNA D-loop序列变异分析被引量:6
2012年
为研究波纹唇鱼(Cheilinus undulatus)线粒体D-loop序列遗传多样性,作者采用聚合酶链式反应和克隆技术对海波纹唇鱼群体(n=25)的mtDNA D-loop序列进行克隆和测序,获得长度大约为1 400 bp的产物。用ClustalX软件进行排序比较,将结果导入MEGA5.0,结果显示出在这25尾个体中,共检测出66个变异位点,包括0个碱基缺失,4个碱基插入,59转换位点,2颠换位点及1个转换和颠换同时存在的位点。并用MEGA5.0软件构建该群25尾个体的NJ和UPGMA系统树。由DNASP软件计算出该波纹唇鱼群体的多态位点数(S)为62,核苷酸多样性(Pi)为0.00606,平均核苷酸差异数为6.907。结果表明波纹唇鱼群体的mtDNA-loop基因个体差异程度不明显。
胡静齐兴柱尹绍武骆剑朱晓平祝斐胡亚丽
关键词:MTDNA
基于mtDNA控制区的波纹唇鱼的4个不同地理群体的遗传多样性被引量:3
2017年
以海南陵水、西沙、南沙以及马来西亚4个地理区域的101尾波纹唇鱼作为研究对象,利用mtDNA控制区序列对波纹唇鱼进行了遗传多样性分析,并通过扩增、克隆与序列测定技术,获得了mtDNA控制区905 bp的序列,其多态性遗传参数的统计显示,在101尾个体中存在110个变异位点和71个单倍型;总群体的单倍型多样性(Hd)为0.981,核苷酸的多样性指数(Pi)为0.005 79,表明其遗传多样性处于较低水平.Tajima’s D中性检测均为负值,Fst值属于较低水平,仅为0.031 95,分子方差分析(AMOVA)和Kimuar 2参数模型的分析表明,这4个不同地理群体的波纹唇鱼是由一个小而高效的种群迅速发展而来的,且其遗传多样性和遗传分化水平较低.
李雨欣王秀英张国庆
关键词:波纹唇鱼MTDNA控制区遗传分化
基于mtDNA ND1基因序列研究不同地理群体波纹唇鱼的遗传多样性和遗传分化被引量:4
2014年
以海南陵水、马来西亚、西沙、南沙4个海域共101尾波纹唇鱼(Cheilinus undulatus)作为研究对象,利用线粒体DNA ND1基因序列对波纹唇鱼进行了遗传多样性分析。通过PCR扩增、克隆与序列测定技术,获得ND1基因序列长度为975 bp,其多态性遗传参数统计显示,101个个体存在13个变异位点,14个单倍型,总群体单倍型多样性(Hd)为0.292,平均核苷酸差异数(K)为0.335,核苷酸多样性指数(Pi)为0.000 35,表现出遗传多样性处于较低水平。Tajima′s D中性检验结果为-1.768 09(P=0.031)表明波纹唇鱼在历史上经历过近期群体扩张或瓶颈效应。分子方差分析(AMOVA)表明遗传变异来自群体内。该结果可为今后波纹唇鱼的种质资源保护工作提供必要的科学依据。
胡静侯新远尹绍武祝斐贾一何胡亚丽
关键词:波纹唇鱼遗传分化
基于mtDNA COⅠ和Cytb基因序列对南中国海不同海域波纹唇鱼群体遗传多样性的研究被引量:37
2014年
研究以海南陵水、马来西亚、西沙、南沙4个海域共101尾波纹唇鱼作为研究对象,通过线粒体DNA的COⅠ和Cytb基因序列分析方法对波纹唇鱼进行了遗传多样性研究。经PCR扩增、克隆与序列测定,分别获得1560 bp COⅠ基因和1141 bp Cytb基因序列。两者多态性遗传参数统计显示,101尾个体分别存在23(COⅠ)和30(Cytb)个变异位点,分别检测出20(COⅠ)和27(Cytb)个单倍型,总群体单倍型多样性(Hd)分别为0.629(COⅠ)和0.755(Cytb),平均核苷酸差异数(K)分别为1.195(COⅠ)和1.424(Cytb),核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.00077(COⅠ)和0.00126(Cytb)。分子方差分析(AMOVA)结果分别为26.26%(COⅠ)和4.22%(Cytb)的变异来自群体间,73.74%(COⅠ)和95.78%(Cytb)的变异来自群体内。同时,两个基因的单倍型网络图呈星状放射结构,不同地理来源的单倍型无明显分支,呈交错分布,没有体现地理差异性。研究初步认为,波纹唇鱼的遗传多样性处于较低水平,遗传分化存在但不显著,该结果可为今后波纹唇鱼的种质资源保护工作提供必要的科学依据。
胡静侯新远尹绍武祝斐贾一何王小军
关键词:波纹唇鱼CYTB
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