四川省教育厅重点项目(08ZA077)
- 作品数：5 被引量：14H指数：2
- 相关作者：王林杰李利张红平李秋杜立新更多>>
- 相关机构：四川农业大学眉山市畜牧局西南民族大学更多>>
- 发文基金：四川省教育厅重点项目四川省科技支撑计划四川省科技创新产业链示范工程更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 山羊不同组织中IGFBP-5 mRNA的发育表达模式
- 2011年
- [目的]探讨IGFBP-5基因在山羊出生后不同组织的发育性表达模式。[方法]采用荧光定量PCR,分析了出生后0、15、30、60、90和120d36只南江黄羊(公、母羔各18只)的心脏、肝脏、脾、肺、背最长肌、半膜肌、臂三头肌和股二头肌样品中IGFBP-5mRNA水平。[结果]母羔的IGFBP-5mRNA表达丰度显著高于公羔。各组织IGFBP-5mRNA表达量呈现肝脏>肺>脾(心脏)>肌肉的趋势(P<0.01),脾与心脏间差异不显著(P>0.01),肌肉的表达值最低。随着日龄的增加,各组织中IGFBP-5mRNA丰度均呈现下降-上调-下降的发育性表达模式,而肝脏和肺中的表达模式具有明显的性别差异。[结论]IGFBP-5mRNA主要在内脏,尤其是肝脏中合成,但在各组织的发育性表达模式一致,性别是一个重要的影响因素。
- 李利李秋欧志国王林杰张红平
- 关键词：山羊RT-PCR
- 山羊IGFBP-5基因克隆及特征分析被引量：1
- 2011年
- 为探讨山羊IGFBP-5基因的特点,进一步研究其在山羊上的表达及生长发育中的作用机制,以初生南江黄羊肝脏组织为材料抽提RNA进行克隆测序,并利用ExPasy、NetPhos、NetO-Glyc、SignalP等生物软件分析IGFBP-5基因CDS区及其编码氨基酸的理化性质、结构特点。结果显示,山羊IGFBP-5基因的CDS全长819 bp,编码272个氨基酸残基,相对分子量为30.392 kD,理论等电点pI=8.56,开始19个氨基酸残基构成信号肽,具有2个疏水区、5个亲水区且总平均疏水性值为-0.619,成熟肽定位于细胞外。二级结构以无规卷曲为主(83.8%),α-螺旋和延伸片段分别为13.6%和2.6%。N-端存在IGFBP信号,C-端有Ⅰ型甲状腺球蛋白结构域,发现3个O-糖基化位点,22个磷酸化位点,主要磷酸化方式有CKⅡ、PKA、PKC、MAPK 4种。山羊与其他物种IGFBP-5基因mRNA及氨基酸序列一致性分别在89%和94%以上,其N-端在几个物种中完全一致。山羊和人IGFBP-5蛋白前体分别有特异性的氨基酸插入(Ala102、Leu3)。山羊IGFBP-5蛋白是位于细胞外且具有信号肽的弱亲水性分泌蛋白,磷酸化是调控其功能的主要因素。
- 李利李秋王林杰张红平
- 关键词：南江黄羊克隆生物信息学分析
- 绵羊瘦素受体基因部分序列测定及其变异位点分析被引量：5
- 2011年
- 试验旨在检测绵羊瘦素受体(leptin receptor,LEPR)基因序列突变位点,为进一步分析LEPR基因多态性与绵羊生长性状的关系奠定基础。选用美利奴羊与阿华西羊杂交群体作为试验材料,利用RT-PCR、测序等方法测定了4只绵羊的LEPR基因cDNA部分序列及内含子7序列,同时利用PCR-RFLP分析两个位点在群体(229只)中的多态性。测定出LEPR基因cDNA序列长2608bp(包含外显子2-16完整序列及外显子1和17的部分序列)和LEPR第7内含子序列全长160bp,共发现5个核苷酸变异位点,第2外显子中2个(T240C和A279G),第10、14外显子中各1个(A1683G,T2373C),内含子7中1个(1285+A73G),外显子中的4个变异位点均未引起编码氨基酸的改变。在研究群体中,A279G与A1683G中A的频率分别为0.415、0.467,后者处于非平衡状态,GG和AA是主要的单倍型。不同物种间序列一致性分值均比较高,但LEPRmRNA区序列一致性比内含子高,基于LEPR mRNA序列构建的系统发育树更符合实际情况,且可靠性值更高。结果表明,绵羊LEPR基因的保守性较强,突变形式主要是转换,A279G和A1683G可能是突变热点。
- 李利欧志国王林杰张红平杜立新
- 关键词：绵羊瘦素受体基因单核苷酸多态性系统发育
- 山羊IGFBP-1基因的克隆及其mRNA丰度在多种组织中的发育性变化被引量：2
- 2011年
- 本研究旨在探讨胰岛素样生长因子结合蛋白1(Insulin-like growth factor-binding protein 1,IGFBP-1)基因在山羊出生后不同组织的发育性表达模式。在出生后0、15、30、60、90和120d共屠宰36只南江黄羊羔羊(公、母羔羊各18只),取心脏、肝脏、脾脏、肺脏、背最长肌、半膜肌、臂三头肌和股二头肌样品以抽提RNA,进行克隆及荧光定量PCR分析。山羊IGFBP-1基因的ORF(Open reading frame)长792bp,共编码263个氨基酸,其核苷酸和氨基酸序列相似性在反刍动物(牛、绵羊)之间远大于其它物种。羔羊肝脏IGFBP-1mRNA表达量最高(P<0.01);肺脏、脾脏、心脏表达水平中等;肌肉中最低且在4种肌肉间表达差异不显著(P>0.05)。出生后尤其是60d内羔羊IGFBP-1mRNA丰度变化很大,且明显呈现持续下降(肝脏)、先升后降(心脏)以及下降-上升-下降(脾脏、肺脏和肌肉)3种模式的变化。结果提示,IGFBP-1基因CDS区在物种间保守性较强,肝脏是山羊合成IGFBP-1mRNA的主要部位,IGFBP-1基因在出生后羔羊的早期生长中发挥着重要的作用且其mRNA发育性表达模式具有组织器官特异性。
- 李利李秋王林杰张红平杜立新
- 关键词：山羊分子克隆实时荧光定量RT-PCR
- 山羊clock和cry1基因的克隆及其在大脑和垂体中表达差异的研究被引量：6
- 2012年
- 本研究旨在探讨生物钟基因clock和cry1在山羊出生后不同时期的大脑和垂体中的表达差异。在出生后30、60、90和120d共屠宰24只南江黄羊羔羊(公母各12只),取其大脑皮质层和垂体组织样品用于抽提RNA,进行分子克隆和实时荧光定量PCR分析。结果,分离克隆得到了山羊clock基因外显子1到外显子8以及cry1基因外显子6到外显子15的CDS区序列,其长度分别为1 479bp和993bp,其中clock基因部分CDS区序列与绵羊、牛、人和小鼠的对应序列相似性分别为99%、90%、94%和92%,cry1基因部分CDS区序列与绵羊、牛、人和小鼠的对应序列相似性分别为99%、98%、94%和87%。组织表达分析结果表明,性别对clock和cry1基因的表达影响不显著(P>0.05),2个基因在垂体中的mRNA表达量极显著高于大脑中的表达量(P<0.01);在不同时期的垂体组织中,clock和cry1基因表达量均呈现先上升后下降的趋势;在不同时期的大脑组织中,clock基因的表达量趋于波动平衡,呈现上升趋势,cry1基因的相对表达量呈细微的上升趋势。结果提示:clock和cry1基因的CDS区在物种间保守性较高。clock和cry1基因在山羊大脑和垂体组织中起到重要的作用,且其mRNA发育性表达模式具有组织特异性。
- 占思远罗万伟程波蒋婧李利王林杰张红平王永龚华斌邓中宝
- 关键词：山羊CLOCK基因分子克隆
