国家转基因植物研究与产业化专项(JY03A-11-01)
- 作品数：2 被引量：12H指数：2
- 相关作者：郭蔼光金伟波吴方丽孔栋李楠楠更多>>
- 相关机构：西北农林科技大学更多>>
- 发文基金：国家转基因植物研究与产业化专项更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 水稻MicroRNA的预测及实验验证被引量：8
- 2007年
- 根据已报道水稻pre-miRNA的序列与结构信息,利用支持向量机(support vector machine,SVM)方法在miRNA前体上预测成熟区,产生一个模型——mature-SVM.它预测水稻成熟区的敏感性和特异性分别为86.7%和100%;然后,用这个模型对从水稻基因组中筛选出的46501条pre-miRNA进行成熟链预测,此外再根据miRNA的作用原理用blast程序所进一步的筛选,得到了127条pre-miRNA及成熟miRNA;除去其中已知的21条,最后得到106条候选的新的水稻miRNA.从中随机挑取10条进行Northern验证,结果有4条miRNA得到确认.
- 金伟波李楠楠吴方丽孔栋郭蔼光
- 关键词：水稻MIRNA支持向量机NORTHERN印迹
- 小麦尿卟啉原Ⅲ合成酶基因克隆及序列分析被引量：4
- 2007年
- 根据水稻已公布的尿卟啉原Ⅲ合成酶(UROS)基因和小麦EST的保守序列,设计特异性引物对小麦尿卟啉原Ⅲ合成酶基因的部分片段进行克隆,得到了364 bp的cDNA(命名为UROS1)。以UROS1作为种子进行电子克隆,得到一段长为1210 bp的cDNA序列,并设计特异性引物克隆到1个1077 bp cDNA序列。对该片段分析结果表明,克隆得到的小麦UROS基因包含了信号肽区和全长的成熟肽区。小麦UROS基因与水稻UROS基因的同源性为86%左右,其推导氨基酸序列与水稻和拟南芥蛋白序列同源性分别约91%和79%。动物、植物以及微生物间核酸序列的保守性较低,氨基酸序列保守性也不高,但都存在UROS保守结构域(Hem D)。进化分析显示,该酶在不同物种间的进化速度差异较大。
- 曹凤王亚红金伟波杜光源郭蔼光
- 关键词：小麦返白系电子克隆
