国家自然科学基金(31071644)
- 作品数：5 被引量：22H指数：3
- 相关作者：王艳丽姜华孙国昌邱海萍毛雪琴更多>>
- 相关机构：浙江省农业科学院杭州师范大学浙江师范大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技重大专项转基因生物新品种培育专项更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 浙江省水稻立枯丝核菌5.8S rDNA-ITS区间多样性被引量：3
- 2014年
- 对浙江省82个水稻立枯丝核菌菌株及13个标准融合群菌株5.8S rDNA-ITS(ITS)区间测序和分析,结果表明,ITS在标准融合群菌株间的差异远大于AG1-IA融合群的水稻菌株间的差异,进化分析表明,ITS的差异可以有效甄别不同标准融合群菌株,但对AG1-IA融合群的水稻菌株区分能力非常有限。单倍型分析表明,这82个水稻菌株可以分为10个单倍型。田间菌株的单倍型多样性(Hd)为0.208 7,核苷酸多样性为0.000 33。其中单倍型H1为优势单倍型,占全部菌株的87.8%,而其他9个单倍型则各只有1株菌株。中性检验结果表明Tajima's D测验值为-2.260 12(P<0.01),Fu和Li's D测验值为-5.208 27(P<0.02),暗示浙江省水稻纹枯菌菌株显著偏离中性假说,在历史上可能出现过种群扩张,并存在很强的选择作用。
- 邱海萍毛雪琴姜华王艳丽孙国昌
- 关键词：立枯丝核菌水稻转录间隔区单倍型
- 立枯丝核菌遗传多样性的研究方法被引量：3
- 2013年
- 立枯丝核菌(Rhizoctonia solani Kühn)是一个集合种,遗传多样性丰富.关于遗传多样性的研究一直是R.solani研究的热点.本文就用于R.solani遗传多样性研究的方法进行了综述.分别解释并阐述了各种方法的优缺点,其中菌丝融合法是研究R.solani遗传多样性的传统方法,该法需借助显微镜且耗时耗力;同工酶法简便、高效、低廉,但常需要与其它方法联用;脂肪酸法操作难度小,价格相对较低,但该法受菌株生长状况和脂肪酸脂化方法的限制;分子标记法方法众多,各有利弊,通过比较发现rDNA-ITS是研究R.solani遗传多样性比较合适的方法.本文还介绍了不同方法在R.solani遗传多样性研究中的具体应用.
- 王利红姜华王艳丽孙国昌
- 关键词：立枯丝核菌菌丝融合同工酶分析脂肪酸分析分子标记法
- 利用rDNA-ITS研究立枯丝核菌的遗传多样性被引量：3
- 2013年
- 立枯丝核菌是一类重要的植物病原菌,具有极为丰富的遗传多样性.已有多种手段用于该菌遗传结构复杂性的研究,其中利用核糖体DNA及转录间隔区的多态性进行遗传多样性的研究因其操作简便、结果稳定而被广泛采用.文章就rDNA-ITS技术的实现、在研究中的实际应用及目前的研究进展进行了综述.
- 王利红姜华王艳丽孙国昌
- 关键词：立枯丝核菌
- 水稻纹枯菌总DNA提取方法的比较被引量：9
- 2011年
- DNA的浓度,尤其是DNA的纯度严重影响后续基因组酶切等结果。为寻找一种高质量的水稻纹枯菌总DNA的提取方法,采用CTAB法、CTAB改良法、SDS法、蜗牛酶法、蛋白酶K法5种方法分别提取水稻纹枯菌总DNA。通过紫外吸光度测定DNA的纯度和浓度、琼脂糖凝胶电泳、PCR扩增、限制性内切酶酶切反应及Southern杂交评价DNA的质量,最终得出蛋白酶K法是获取高质量水稻纹枯菌基因组DNA的最佳方法。
- 任衍春张震毛雪琴邱海萍姜华柴荣耀王艳丽孙国昌
- 关键词：总DNASOUTHERN杂交
- 立枯丝核菌不同融合群菌株GPD基因的克隆及序列特征分析被引量：5
- 2013年
- 利用同源克隆的方法对11个立枯丝核菌标准融合群菌株的GPD基因进行了分离。分析发现不同融合群立枯丝核菌GPD基因在外显子数目、编码蛋白长度及内含子剪切方式等方面存在差异,如AG-2-2ⅢB、AG-2-2Ⅳ、AG-8三个融合群的GPD基因的外显子个数为10个,其他融合群均为11个;AG-8融合群的GPD基因的编码蛋白长度为267个氨基酸,其余融合群的GPD基因的编码蛋白长度约为340个氨基酸。AG-2-2ⅢB、AG-2-2Ⅳ、AG-8三个融合群的GPD基因在98、98、272氨基酸位点的内含子发生了缺失。基于蛋白序列的进化分析表明不同融合群之间GPD基因编码蛋白存在明显差异,可以有效地将不同融合群菌株区分开来;同时,不同物种之间GPD基因在进化上仍具有一定保守性,立枯丝核菌自身的GPD基因蛋白序列归为一类且与担子菌门同源性最高。这些结果表明进行保守基因序列差异分析是进行立枯丝核菌分类分群研究的新思路。
- 王艳丽任衍春张震王教瑜毛雪琴姜华邱海萍柴荣耀杜新法孙国昌
- 关键词：立枯丝核菌克隆进化分析融合群
