河南省高等教育信息化工程项目(2008xxh011)
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
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- 相关机构：河南农业大学天津大学更多>>
- 发文基金：天津市科技支撑重点项目河南省高等教育信息化工程项目更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 基于半监督支持向量机的并行远同源检测方法被引量：1
- 2009年
- 在生物信息学中,对给定氨基酸序列的蛋白质进行分类,检测细微的蛋白质序列相似性或远同源性对于准确预测蛋白质功能和结构都非常重要。提出一种新的基于半监督支持向量机的远同源性检测方法,通过定义序列概率剖面,充分利用大型数据库的非标记数据,并行构筑支持向量机核函数,并结合最近邻分类器实现对任何数据的全覆盖。实验表明,该方法能够大幅提高蛋白质序列分类器的性能与效率。使用并行技术将总体计算时间控制在一定范围,推动了半监督支持向量机分类器的广泛应用。
- 王栋孙济洲李福超
- 关键词：半监督学习支持向量机并行计算分类器
- 基于并行多类支持向量机的蛋白质结构预测被引量：1
- 2011年
- 在远同源检测的蛋白质结构预测方法中,基于支持向量机的方法取得了优于其他方法的高准确性,但这类方法只能完成对目标蛋白质作出是否属于特定蛋白质结构的判别,而实际应用中常需要直接给出具体的结构预测结果。提出一种基于多类支持向量机的蛋白质结构预测方法,通过采用加权一对多的多类分类方法对标准支持向量机输出结果进行综合评价,获得唯一的结构预测结果;同时为了克服算法复杂性高的弱点,用并行计算的思想对算法进行了优化。实验表明,基于并行多类支持向量机的蛋白质结构预测取得了更高的准确性,并行化的处理提高了多类支持向量机分类器的性能。
- 王栋孙济洲李福超宋婷
- 关键词：蛋白质结构预测多类支持向量机并行计算
