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直接、快速地从罹病小麦叶片中提取条锈菌基因组DNA的方法被引量：7: 2012年; 小麦条锈菌(Puccinia striiformis f.sp.tritici)是专性程度很高的活体寄生菌,通过分子技术对其进行群体遗传结构研究的过程中,基因组DNA提取是基础之一。本研究利用Chelex-100法和CTAB法直接提取罹条锈病的小麦病叶片上的小麦条锈病菌的基因组DNA,使用PCR对所得到的DNA进行真菌核糖体rDNA-ITS和小麦条锈病菌特异性引物CYR33进行检测,对2种基因组DNA的提取方法进行比较分析,结果表明Chel-ex-100法和CTAB法都能够适合于从罹病组织中直接提取小麦条锈病菌的基因组DNA,但是Chelex-100法较CTAB法所需的样品量少,操作步骤少,操作简单,并且整个过程无需使用有机溶剂进行抽提,对人体比较安全。通过PCR检测DNA提取情况,发现Chelex-100法提取的DNA的PCR结果优于CTAB法,且能够满足基于PCR的群体遗传结构的分析等研究。; 兰茗清刘林杨静武静雯张培花顾中量李成云; 关键词：小麦条锈病菌 DNA提取

小种特异分子标记分析2010-2011年云南省小麦条锈病菌的生理小种组成被引量：1: 2013年; 云南是我国小麦条锈病菌既能越夏,又能越冬的省份之一。对云南省小麦主产区的小麦条锈病菌进行生理小种分析,可了解病菌小种组成及分布频度,年度间变化等信息,为品种布局控制病害流行提供参考。本文用6个小麦条锈病菌生理小种特异分子标记(条中33,条中32,条中31,条中29,条中23和水源型)分析云南省小麦主产区采集的354份罹患小麦条锈病的样品进行生理小种分析。结果表明:云南省各小麦主产区的生理小种组成大致相同,均表现为条中33和条中29的检出率最高,达79.38%和42.09%,为这些地区的优势小种;而条中31和条中23的检出率均较低,仅为0.28%和3.39%。本研究的重要优点是可在较短时间内检测大量样品,能够发现小面积病斑上的多个生理小种,因此对小种组成的分析更具代表性。; 刘林兰茗清张波杨静赵婧顾中量张培花李成云; 关键词：小麦条锈病菌群体遗传结构

小麦EST-SSR的分析及其引物的开发被引量：5: 2012年; 为开发出具有丰富多态性的、新型的小麦EST-SSR标记,利用已公布的1 071 367条小麦表达序列标签(expressed sequence tags,EST)序列,对≥24 bp的微卫星或简单重复序列进行了系统分析。结果表明,在所分析的小麦EST序列中,搜索到长度大于或等于24 bp,基序匹配值大于80%的SSR序列32 350个。在这些SSR中,单碱基SSR最多,数量达18 075个,占SSR总数的55.9%;其次为3核苷酸SSR,共6 106个,占SSR总数的18.7%,重复数大于30次以上的达444个,占所有3核苷酸SSR的7.2%。4核苷酸SSR数量最少,仅有696个,仅占SSR总数的2.2%。研究中收搜索到的6核苷酸SSR共1 562个,其基序组成可分为145类,优势基序为AGCCGC(达214个)。以上结果说明小麦EST序列中含有丰富的SSR,这非常有利于开发多态性较高的EST-SSR标记。; 刘林孙来亮兰茗清杨静查友贵李成云; 关键词：小麦表达序列标签微卫星

小麦条锈病菌EST序列中微卫星的频率和分布被引量：1: 2011年; 研究利用已公布的7 368条小麦条锈病菌表达序列标签(expressed sequence tags,EST)序列,对其EST序列中的微卫星(microsatellite)或简单重复序列(simple sequence repeats,SSRs)进行了系统分析。结果表明,在已公布的7 368条小麦条锈病菌EST序列中,共有2 642个SSR序列(长度大于15 bp,匹配值大于80%),相当于平均3条EST序列中分布有1个SSR序列。在这些SSR中,单碱基SSR最多,数量达2 320个,占SSR总数的87.8%;其次为三碱基SSR,数量为137个,约占SSR总数的5.2%;五碱基重复的SSR数量最少,为34个。且有的SSR的重复数较多,这将有利于小麦条锈病菌SSR分子标记的开发与应用。; 刘林胡燕玲杨静张庆李进斌李成云; 关键词：小麦条锈病菌表达序列标签微卫星

基于多样性种植的小麦条锈菌群体结构分析被引量：1: 2016年; 多样性种植能够有效地控制小麦条锈病。本文通过6对小麦条锈菌生理小种(条中33,条中32,条中31,条中29,条中23和水源型)特异分子标记分析采集自不同种植模式下自然发病的小麦条锈菌生理小种和群体结构。结果表明:川麦107与蚕豆(或者豌豆)间作时单个病斑检出多个小麦条锈菌生理小种的比例略高于川麦107净作,其余种植模式差异不明显。另外,以采集自各小区的小麦条锈菌样品为1个群体,利用POPGENE 1.32分析小麦条锈菌群体间的关系,结果表明:净作靖麦14的3个小区的3个小麦条锈菌群体与净作川麦107的3个小区的3个条锈菌群体分别聚在了2个大的群体中,而且3个小区相同种植模式下的3个群体也几乎聚在一起,说明种植模式可能对小麦条锈菌的群体有一定影响。; 彭莞云杨雅婷王春丽唐永生李锐李成云刘林; 关键词：小麦条锈菌

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公益性行业科研专项(200903035-07)