国家自然科学基金(81102086)
- 作品数：6 被引量：8H指数：2
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- 发文基金：国家自然科学基金陕西省“13115”科技创新工程重大科技专项国家教育部博士点基金更多>>
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- 大骨节病关节软骨真菌毒素环境反应基因表达谱研究被引量：1
- 2012年
- 目的比较分析真菌毒素环境反应基因在大骨节病（Kashin—Beck disease，KBD）和正常关节软骨中的表达谱差异，探讨真菌毒素环境反应基因与KBD软骨损伤的关系。方法采集9例KBD患者和9例正常对照关节软骨样本，提取总RNA。采用Agilent基因表达芯片评估真菌毒素环境反应基因在软骨样品中的表达量，并计算每个基因在KBD和正常对照软骨中表达量的比率（简称表达率）。采用GSEA软件计算每个基因功能分类表达量的NES指数及P值。结果①T-2毒素、脱氧镰刀菌烯醇、玉米赤霉烯酮、黄曲霉毒素B1、伏马菌素B1和赫曲霉毒素A相关的15个环境反应基因在KBD和正常对照关节软骨中的表达水平存在差异（表达率〉2．0或〈0．5），其中13个基因在KBD软骨中上调，包括BAX、BCL2、COLSA2、FERIL3、GSTT2、IGFBP2、IGFBP4、PDESB、SOCS3、THBS1、TMSL8、VGLL3和TUBB2A（表达率〉2．0）；2个基因在KBD软骨中下调，包括POSTN和FABP4（表达率〈0．5）。上述15个基因功能主要涉及胶原、细胞凋亡、代谢和生长发育等。②真菌毒素相关的4个凋亡基因功能分类和5个生长发育基因功能分类在KBD关节软骨中上调（NES〉0），包括ANTI_APOPTOSIS、REGULATION_OF_PROGRAMMED_CELL_DEATH、APOPTOSIS_GO、EGULATION_OF_APOPTOSIS、ORGAN_MORPHOGENESIS、ANATOMICAL_STRUCTURE_DEVELOPMENT、ORGAN_DEVELOPMENT、SYSTEM_DEVELOPMENT和REGULATl0N_OF_DEVELOPMENTAL_PROCESS（NES〉0且P〈0．05）。结论KBD软骨中存在多种真菌毒素的环境反应基因表达且显著不同于正常对照。提示真菌毒素可能通过影响相关环境反应基因在关节软骨中的表达，诱发软骨细胞功能障碍和关节软骨损伤。
- 张峰王伟卓郭雄武世勋王立新
- 关键词：大骨节病基因表达
- 应用基因表达芯片筛选大骨节病软骨差异表达的基因和基因通路被引量：3
- 2013年
- 【摘要】目的筛选大骨节病（Kashin—Beckdisease，KBD）和正常关节软骨的差异表达基因和基因通路，探讨KBD关节软骨损伤的分子机制。方法KBD组和对照组关节软骨样本各9份，提取总RNA，反转录为eDNA。采用Cy3、Cy5分别对KBD组、对照组进行荧光标记。采用Agilent全基因组表达芯片，比较KBD组与对照组关节软骨的表达谱差异，利用单基因及基因通路表达分析，筛选有统计学意义的差异表达的基因和基因通路。结果①KBD组的关节软骨中29个基因的表达水平显著上调（平均表达率=6．68±1．98，P均〈0．05），功能涉及细胞凋亡、代谢、细胞外基质、细胞骨架与运动等。KBD患者关节软骨中的细胞外基质相关的FBLNl基因表达水平显著下调（表达率=0．14±0．06，P〈0．05）。@KBD组关节软骨中6个凋亡和5个缺氧相关的基因通路的表达水平均高于对照组（P均〈0．05）。结论细胞凋亡和缺氧相关的基因及基因通路在KBD患者与对照关节软骨中的表达水平存在差异，提示缺氧可能在KBD关节软骨细胞凋亡中发挥一定作用，缺氧与KBD关节软骨损伤的关系有待进一步研究。
- 张峰王伟卓郭雄武世勋王立新
- 关键词：大骨节病缺氧基因寡核苷酸序列分析
- 大骨节病多组学研究进展被引量：3
- 2015年
- 大骨节病(Kashin-Beck disease)是一种慢性骨软骨疾病,临床表现主要包括关节疼痛、活动障碍和多关节畸形。大骨节病关节软骨损伤的分子机制迄今不明,严重阻碍大骨节病的防治。近年来,随着高通量组学检测技术的快速发展,多个大骨节病的基因组学、表达组学和蛋白组学研究结果相继发表。研究发现大骨节病的患病风险受易感基因的影响,凋亡、缺氧、氧化应激相关的基因、基因通路和蛋白在大骨节病关节软骨中表达异常,为阐明大骨节病的分子发病机制提供了新的线索。本文总结了近期所获大骨节病多组学的研究进展。
- 张峰肖筱
- 关键词：大骨节病基因组学蛋白组学
- DCC和GALNT5基因多态性与大骨节病关联研究被引量：1
- 2015年
- 目的探讨DCC基因和GALNT5基因6个单核苷酸多态性(SNP)位点与大骨节病的关系。方法采集KBD患者559例,正常对照467例,抽取外周血并提取DNA。采用Sequenom MassARRAY平台对DCC基因的rs12965947、rs11877840、rs12958987、rs17748898和GALNT5基因的rs16841428和rs6659923位点进行分型,采用PLINK软件进行哈迪-温伯格平衡检验,分析6个SNP与大骨节病的关系。结果 6个SNP位点均符合哈迪-温伯格平衡(P>0.05)。校正年龄后,6个SNP位点在KBD组与对照组的基因型分布无统计学差异(P>0.05)。结论DCC基因的rs12965947、rs11877840、rs12958987、rs17748898和GALNT5基因的rs16841428和rs6659923与大骨节病无关联。
- 郭兴郭雄张峰
- 关键词：大骨节病单核苷酸多态性
- 骨质疏松症全基因组多组学整合分析被引量：1
- 2015年
- 目的当前在骨关节疾病研究领域缺乏系统的跨组学研究,现就骨质疏松症全基因组多组学整合分析作一介评。方法该研究利用两个Meta分析的全基因组关联研究(GWAS)数据集,通过DMS算法在人类蛋白质互作网络(PPI)搜索得到影响骨密度的基因模块,然后使用基因表达谱数据对基因模块与疾病相关性进行评价。结果研究发现42个与股骨颈骨密度相关的基因模块和129个与腰椎骨密度相关的基因模块。利用基因表达谱评价候选基因模块与骨密度的相关性,最终得到两个显著相关的基因模块,功能涉及Wnt受体信号转导和成骨细胞分化。结论该研究发现的基因模块在骨量的调节中发挥着重要作用,为阐明骨质疏松症的发病机制提供了重要线索。
- 肖筱张峰
- 关键词：骨密度
- 关节健康、老化及骨关节中细胞自噬和软骨内稳态机制分析
- 2015年
- 骨关节炎是最为常见的关节疾病,但却没有有效的预防措施和治疗该病的药物。由于以患者为对象的药物研究未能成功,人们逐渐开始关注维持关节健康的机制。增强该机制可能成为预防关节炎的新方法。现就维持细胞和组织稳态的机制及其衰退过程做一介评。增强该机制将作为延缓关节衰老以及降低关节炎风险的新方法加以讨论。
- 郝婧灿张峰
- 关键词：关节软骨自噬关节炎
