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国家自然科学基金(30470495)

作品数:7 被引量:7H指数:2
相关作者:邓小元金鹰罗冬梅刘海喻碧英更多>>
相关机构:华南师范大学福建师范大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:生物学医药卫生电子电信机械工程更多>>

文献类型

  • 7篇期刊文章
  • 2篇会议论文

领域

  • 4篇医药卫生
  • 3篇生物学
  • 1篇机械工程
  • 1篇电子电信

主题

  • 2篇冗余
  • 2篇基因
  • 2篇二次谐波
  • 2篇非翻译区
  • 2篇TRADIT...
  • 2篇CELLUL...
  • 2篇INTRON
  • 2篇MODEL_...
  • 2篇成像
  • 2篇AS
  • 2篇PHOTOB...
  • 2篇EXON
  • 1篇选择性剪接
  • 1篇异常基因
  • 1篇人类基因
  • 1篇人类基因组
  • 1篇上皮
  • 1篇上皮细胞
  • 1篇数据库
  • 1篇特征域

机构

  • 5篇华南师范大学
  • 1篇福建师范大学

作者

  • 5篇邓小元
  • 4篇金鹰
  • 2篇刘海
  • 2篇罗冬梅
  • 1篇刘汉平
  • 1篇卓双木
  • 1篇郭周义
  • 1篇吴淑莲
  • 1篇庄正飞
  • 1篇喻碧英

传媒

  • 3篇华南师范大学...
  • 2篇激光生物学报
  • 1篇Chines...
  • 1篇Chines...

年份

  • 3篇2010
  • 2篇2009
  • 2篇2008
  • 2篇2005
7 条 记 录,以下是 1-9
排序方式:
构建非冗余EID的若干技巧
2009年
基于GenBank构建的外显子内含子数据库(EID)含有大量的冗余数据.为了解决冗余问题,构建了基于RefSeq的非冗余EID(non-redundantEID).RefSeq是由NCBI工作人员负责维护和更新的参考序列库,为基因组注释、基因识别、基因突变、多态性分析、表达研究和比对分析提供了重要的参考.该EID可用于大规模分析Exon/Intron结构和内含子剪切(Splicing)的研究,并拥有一些内部机制来控制数据质量和可能出现的错误.同时,它的新的改进是增加了基因序列中非翻译区(UTR)的数据内容.该文对构建基于RefSeq的非冗余EID的一些技巧作出说明.
金鹰邓小元刘海
关键词:剪切非翻译区
人类基因组非冗余Exon/Intron数据库的构建
2010年
以Homo.sapiensRefSeq作为原始数据库来构建EID(Exon/Intron Database)可以克服GenBank所带来的冗余问题.通过分析RefSeq基因组数据库中每个CDS(Coding Sequence,编码序列),获得构建EID的相关的数据(基因的定义、基因标识符、基因序列、蛋白质标识符、蛋白质序列、外显子和内含子的数量、大小、总数、非翻译区(UTR)内含子、内含子相位、内含子剪切位点模式).结果表明,人类24条染色体(22条常染色体和2条性染色体,共计2 870 827355 bps)中含有32 157个基因标识符(gene blocks),其中7 398个基因为假基因,4 014个基因发生了可变剪切(Al-ternative Splicing,AS),15 533个基因含有CDS内含子,765个基因含有UTR内含子,2 585个基因不含有内含子,其他的为异常基因.
罗冬梅金鹰邓小元刘海
关键词:非翻译区
Photobiomodulation as a cellular model of traditional Chinese medicine
<正> Yin-yang concepts of traditional Chinese medicine (TCM) for TCM objects such as whole body, five zangs or ...
刘承宜徐晓阳崔丽萍邓小元刘颂豪
文献传递
Study of van Gieson's picrofuchsin staining on second-harmonic generation in typeⅠcollagen
2008年
Second-harmonic generation(SHG)microscopy is a recently developed nonlinear optical imaging modality for imaging tissue structures with submicron resolution and is a potent tool for visualizing pathological effects of diseases.In this letter,we present our investigation on the influence of van Gieson's(VG) alcoholic picrofuchsin staining on SHG in typeⅠcollagen(from tendon-rich C57BL/6).Multi-channel imaging and spectra analysis show that the strong SHG signal produced in fresh collagen typeⅠfiber has been greatly suppressed after VG staining,which indicates that staining may induce the structural or characteristic changes of SHG-dependent crystal formed by collagen constituents,such as glycine,proline, and hydroxyproline.
刘汉平庄正飞赵羚玲屈军乐邓小元
关键词:光学成像非线性
肿瘤基因组研究进展
2010年
所有的肿瘤都源自于细胞基因组DNA序列的异常。在整个生命过程中,甚至从最初的受精卵开始,人体细胞的基因组就暴露于各种突变诱变因素和自身的复制错误之中,这些不利影响可能导致任何细胞的DNA序列渐进的、细微的突变。过去的25年中,这些突变和基因异常如何调控肿瘤的成长已经越来越多地为人们所认识,在此基础上,大量获得肿瘤基因组的完整DNA序列已经成为可能。这些研究将为人类提供肿瘤发生和成长的重要线索。
罗冬梅邓小元金鹰
关键词:突变异常基因
二次谐波显微成像技术被引量:4
2008年
二次谐波非线性显微成像技术是近年发展起来的一种新型光学成像方法,已广泛应用于生物医学的各个领域。介绍了光学二次谐波产生的原理、成像装置及其技术发展,描述了二次谐波的成像特点和它与双光子荧光成像的异同,并对其在生物医学上的应用及发展前景做出展望。
庄正飞郭周义刘汉平喻碧英吴淑莲卓双木邓小元
关键词:二次谐波成像技术
Photobiomodulation as a cellular model of traditional Chinese medicine
Yin-yang concepts of traditional Chinese medicine (TCM) for TCM objects such as whole body, five zangs or six ...
刘承宜徐晓阳崔丽萍邓小元刘颂豪
文献传递
Second-harmonic generation as a DNA malignancy indicator of prostate glandular epithelial cells被引量:1
2010年
This paper first demonstrates second-harmonic generation(SHG) in the intact cell nucleus,which acts as an optical indicator of DNA malignancy in prostate glandular epithelial cells.Within a scanning region of 2.7 μm×2.7 μm in cell nuclei,SHG signals produced from benign prostatic hyperplasia(BPH) and prostate carcinoma(PC) tissues(mouse model C57BL/6) have been investigated.Statistical analyses(t test) of a total of 405 measurements(204 nuclei from BPH and 201 nuclei from PC) show that SHG signals from BPH and PC have a distinct difference(p < 0.05),suggesting a potential optical method of revealing very early malignancy in prostate glandular epithelial cells based upon induced biochemical and/or biophysical modifications in DNA.
庄正飞刘汉平郭周义卓双木喻碧英邓小元
关键词:二次谐波产生腺上皮细胞DNA
基于CDS..join特征域的Exon/Intron数据库的构建被引量:2
2009年
基因进化的研究和重构通常是在序列水平上进行的,包括比对它们的基因序列或蛋白序列.而对基因外显子/内含子结构的分析能够提供更多有价值的信息,比如绘制更为可靠的系统发生图谱,或更精确地阐明内含子的进化.为此,本文设计了相应的Perl脚本程序来提取、比较和搜索基因说明文档中CDS..join特征域的Exon/Intron结构.通过该方法,可构建相关物种的Exon/Intron数据库(EID),其主要内容包括内含子的相位,Exon或Intron的数量和大小,剪接位点的模式以及选择性剪接(Alternative splicing,AS)的相关信息.
金鹰邓小元
关键词:内含子选择性剪接
共1页<1>
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