深圳市科技局立项课题(201203346)
- 作品数:2 被引量:7H指数:2
- 相关作者:王琼瑶陈应坚林琳徐亚军李静媚更多>>
- 相关机构:深圳市龙岗区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:深圳市科技局立项课题更多>>
- 相关领域:医药卫生理学更多>>
- 3种主要呼吸道病毒快速检测方法的研究被引量:3
- 2014年
- 目的建立同时检测鼻病毒(HRV)、人呼吸道合胞病毒(RSV)、人偏肺病毒(HMPV)的三重实时定量RT-PCR技术,为快速诊断呼吸道感染病原体提供支持。方法以HRV的5'UTR、RSV和HMPV的L区为检测靶基因,设计三对引物和相应TaqMam探针,建立三重实时定量RT-PCR检测HRV、RSV、HMPV的方法,评价方法的特异性、灵敏性和重复性,比较其与单重荧光RT-PCR在临床快速诊断应用的差异。结果该方法对HRV、RSV、HMPV的检测下限为10 copies/μl,特异性实验未出现非特异性扩增,重复试验Ct平均值变异系数均<5%,与单重检测方法比较,三重RTPCR检测方法成本低,实验耗时短,2种方法的临床标本阳性检出率无统计学意义。结论三重实时荧光RT-PCR反应体系可同时检测HRV、RSV、HMPV,具有快速、特异性强、灵敏度高等特点。
- 李静媚金玉娟陈应坚李文东杨慧周健明
- 关键词:呼吸道病毒实时荧光定量RT-PCR
- 2010-2012年深圳市龙岗区流感病原学监测分析被引量:4
- 2013年
- 目的分析2010-2012年深圳市龙岗区流感流行特点和流感病毒优势株的情况。方法对区内监测哨点流感标本进行狗肾传代细胞(MDCK)病毒分离与血凝试验鉴定,描述性分析区内流感的流行情况。选取B型流感优势病毒株进行RT-PCR扩增HA1片段并测序。测序结果与WHO流感疫苗株进行同源性比对,绘制系统发生树。结果2010—2012年共采集流感样病例咽拭子1014份,流感病毒分离率为30.6%(310/1014),其中新甲型H1N1亚型80株(25.8%),季节性H1N1亚型I株(0.3%),季节性H3N2亚型85株(27.5%),B型流感Victoria亚型138株(44.5%),Yamagata亚型6株(1.9%)。不同年龄组病毒阳性率差异有统计学意义(X^2=21.194,P〈0.05),以25-岁年龄组阳性率(35.5%)最高。2010—2012年龙岗区流感优势流行株依次为B型流感Victoria型、新甲H1N1型、甲型H3N2型。系统进化树显示2013年WHO推荐流感疫苗与本区流感病毒同处一个分支。结论龙岗区同时存在多种流感病毒交替流行现象,但新预测流感疫苗可有效覆盖本区流感病毒。
- 李静媚徐亚军王琼瑶陈应坚林琳
- 关键词:流感病毒系统进化树