质检公益性行业科研专项项目(201310126)
- 作品数：13 被引量：48H指数：6
- 相关作者：李丹丹崔丽春莫春生曲敏肖性龙更多>>
- 相关机构：海南出入境检验检疫局辽宁出入境检验检疫局东北林业大学更多>>
- 发文基金：质检公益性行业科研专项项目国家质检总局科技计划项目哈尔滨市科技创新人才研究专项资金项目更多>>
- 相关领域：轻工技术与工程农业科学医药卫生生物学更多>>
- 基于DPO引物的空肠弯曲菌PCR检测方法的建立与初步应用被引量：9
- 2014年
- 为建立特异、快速检测空肠弯曲菌的方法，本研究针对其gyrA基因设计了一对双启动寡核苷酸引物（DPO），建立了空肠弯曲菌DPO-PCR检测方法。试验结果显示，该方法的检测下限为1．2×10^2cfu／mL，在48℃～68℃退火温度范围内均可高效扩增靶基因片段，表明该方法退火温度范围宽，同时DPO引物特异性强，PCR反应过程中不会产生非特异性扩增。利用该方法对采集的184份样品进行检测，共计检出17份空肠弯曲菌阳性样品，经国标法（GB/T 4789．9-2008）复验，两者检测结果一致，显示了良好的实用性。该DPO-PCR方法设计简单、特异性强，为致病微生物的快速准确检测提供了新方法。
- 徐义刚李丹丹刘忠梅吴岩魏冬旭李苏龙
- 关键词：空肠弯曲菌GYRA基因
- 应用DPO-PCR技术检测肠出血性大肠杆菌O157∶H7被引量：11
- 2014年
- 利用双启动寡核苷酸引物(dual-priming oligonucleotide,DPO)聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术检测肠出血性大肠杆菌O157∶H7。根据DPO引物设计原则,以肠出血性大肠杆菌O157∶H7 rfbE基因为靶基因设计一对DPO引物,经过反应体系的优化,建立了肠出血性大肠杆菌O157∶H7 DPO-PCR检测方法,其检测灵敏度约为94 CFU/mL。与常规PCR方法相比,所建立的DPO-PCR方法对退火温度不敏感,在引物设计和实验过程中不需要对引物及其退火温度反复优化,同时基于DPO引物的特殊结构又增强了其特异性。DPO-PCR方法设计简易、特异性强,为致病性微生物的快速准确检测提供了新途径。
- 徐义刚李丹丹崔丽春刘忠梅李苏龙
- 基于双启动引物特异性检测单核细胞增生李斯特氏菌的PCR方法被引量：7
- 2014年
- 以单核细胞增生李斯特氏菌iap基因为靶基因，利用一新型PCR引物设计方法——双启动引物（Dual-primingoligonucleotide，DPO），建立了特异性检测单核细胞增生李斯特氏菌的DPO—PCR方法，测试了DPO—PCR方法退火温度不敏感性、特异性及灵敏度，并在实践检测中进行了初步应用。结果显示：该方法检测单核细胞增生李斯特氏菌的灵敏度为1．51×10^2CFU／mL；退火温度不敏感性测试中，与常规PCR引物相比，DPO引物在48～68℃退火温度范围内均能够高效率地扩增靶基因；特异性测试中，DPO—PCR方法能特异地检测出目标菌，与其他菌株无非特异性扩增反应，比常规PCR方法显示出更强的特异性。实践应用证明，利用DPO—PCR方法对130份样本进行检测，共计检出9份单核细胞增生李斯特氏菌阳性样本，经国标法（GB／T4789．30—2008）复检，两者检测结果一致，显示出良好的实用性，为单核细胞增生李斯特氏菌的快速准确检测提供了新方法。
- 徐义刚李丹丹张柏棋刘忠梅魏冬旭刘新亮李苏龙
- 关键词：单核细胞增生李斯特氏菌
- 霍乱弧菌DPO-PCR特异性检测方法的建立与应用被引量：3
- 2014年
- 采用一种新型的引物设计方法——双启动寡核苷酸引物(dual-priming oligonucleotide,DPO),以霍乱弧菌mdh基因为靶序列,建立了霍乱弧菌DPO-PCR特异性检测方法,分析了DPO引物退火温度不敏感性、检测灵敏度及特异性,并对检测方法进行了初步应用。灵敏度结果显示,DPO-PCR方法对霍乱弧菌的最低检出限为1.07×102 CFU/mL。退火温度不敏感性试验中,与常规PCR引物相比,DPO引物在45～65℃退火温度均能够高效扩增出靶基因片段。特异性结果显示,DPO-PCR方法的特异性比常规PCR方法强,不产生任何非特异性扩增。利用建立的霍乱弧菌DPO-PCR检测方法对采集的550份样本进行检测,检出43份霍乱弧菌阳性样本,经行业标准法(SN/T2425-2010)复检,检测结果相同,表明所建立的DPO-PCR检测方法具有良好的实用性,为霍乱弧菌的快速准确检测提供了新途径。
- 徐义刚李丹丹吴岩刘忠梅魏冬旭李苏龙
- 关键词：霍乱弧菌
- 靶序列富集多重PCR结合DHPLC同时检测5种食源性致病菌被引量：5
- 2015年
- 目的建立同时检测沙门氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌、大肠埃希氏菌O157、金黄色葡萄球菌和志贺氏菌5种食源性致病菌的简便、灵敏的高通量方法。方法根据GenBank公布的5种致病菌的特异性靶基因序列,设计5对特异性引物,与通用引物连接构成复合引物。经过反应条件的优化,建立了5种致病菌的靶序列富集多重PCR(target enriched multiplex PCR,Tem-PCR)扩增方法,扩增产物采用变性高效液相色谱(denaturing high-performance liquid chromatography,DHPLC)技术进行检测。结果采用Tem-PCR-DHPLC方法,检测48株试验菌株,未发现非特异性结果。对5种致病菌检测灵敏度,除金黄色葡萄球菌为620 cfu/mL外,其余都小于100 cfu/mL。对4种样品的检测结果与国家标准方法相符合。结论 Tem-PCR-DHPLC检测方法,相比传统多重PCR方法,能有效地解决引物扩增效率不均衡的问题,不需优化引物浓度,方法特异性强,灵敏度高,具有较好的实用性。
- 刘忠梅曾繁华罗佳徐义刚曲敏莫春生刘新亮李苏龙
- 关键词：变性高效液相色谱沙门氏菌单核细胞增生李斯特氏菌志贺氏菌
- 产肠毒性大肠杆菌DPO-PCR检测方法的建立与应用被引量：6
- 2013年
- 双启动寡核苷酸引物（dual-priming oligonucleotide，DPO）是一种新型的引物设计方法，具有设计简易、特异性强以及退火温度范围宽的特点。以产肠毒性大肠杆菌LT基因为靶基因，设计了一对DPO引物，经过对TaqDNA聚合酶、Mg2＋、dNTP反应体系因子的优化，建立了产肠毒性大肠杆菌DPO-PCR检测方法，测定了该方法的灵敏度、特异性以及退火温度不敏感性。结果显示，该方法检测灵敏度为1．24×10^2CFU／ml，在45℃～65℃退火温度范围内，均可实现靶基因的高效扩增。该方法特异性强，测试菌株中4株产肠毒性大肠杆菌均为阳性结果，其余菌株为阴性结果，且无非特异性扩增发生。与常规PCR方法相比，DPO—PCR方法不需要对引物参数特别是退火温度反复优化，同时DPO引物的特殊结构又增强了检测特异性，为致病性微生物的快速准确检测提供了新方法。
- 徐义刚李丹丹刘忠梅崔丽春李苏龙
- 浊度对PMA-qPCR法检测食品中沙门杆菌活菌的影响被引量：1
- 2015年
- 为了研究食品浊度对叠氮溴化丙锭（PMA）-qPCR法检测食品中沙门杆菌活菌的影响，试验采用PMA—qPCR检测方法对不同浊度的食品进行分析。结果表明：当食品浊度小于23．4FTU时，经PMA处理后，能够实现对食品中沙门杆菌活菌的定量检测；当食品浊度为23．4～2．5×10^4FTU时，会干扰PMA处理效果，但可对食品中沙门杆菌活菌进行定性检测；当食品浊度大于2．5×10^4FTU时，干扰严重，PMA—qPCR法检测结果不可靠。通过增加PMA光照面积以及采用吸附柱法提取样品核酸，可提高PMA—qPCR法检测结果的准确性。
- 程成徐义刚李淑云鞠文东刘忠梅肖性龙李苏龙
- 关键词：食品浊度沙门杆菌
- 单核细胞增生李斯特氏菌实时荧光SPIA方法的建立被引量：2
- 2017年
- 以单核细胞增生李斯特氏菌(Listeria monocytogenes,L.monocytogenes)hly A基因为靶序列,设计5'端为RNA序列,3'端为DNA序列的嵌合引物和链终止Blocker序列,经过优化,建立实时荧光单引物等温扩增(Real-time fluorescence SPIA)方法,进行特异性、检出限实验,并对不同DNA提取方法进行比较。结果显示,确定荧光染料SPIA法的最佳反应温度为58℃,反应30 min,引物特异性良好,只有4株不同来源的L.monocytogenes DNA产生典型的S型荧光扩增曲线。对L.monocytogenes纯培养DNA的检出限为3.6×10~1fg/μL,相应菌液浓度为1.2×10~1CFU/m L;Realtime fluorescence SPIA检测试剂盒法、水煮法、溶菌酶-蛋白酶K法、饱和酚提取法四种方法提取DNA,均产生典型的扩增曲线,Ct值没有明显差异。对人工添加猪肉火腿样品中的L.monocytogenes,采用水煮法提取DNA的检出限为1.1×10~2CFU/g。结果表明,所建立的L.monocytogenes的Real-time fluorescence SPIA新型等温扩增方法,特异性强、灵敏度高、不受DNA纯度的影响、快速、简便。
- 王建昌胡连霞孙晓霞李静
- 关键词：荧光单核细胞增生李斯特氏菌A基因
- 基于内参的志贺氏菌实时荧光定量PCR快速检测被引量：3
- 2016年
- 根据Genbank已公布的志贺氏菌基因组序列,筛选特异性靶基因ipa H,设计特异性引物和探针,优化反应体系,并在体系中加入内参(IAC),通过标记不同荧光基团的Taq Man探针来监测IAC,进而实时监控整个PCR反应过程。按照人工污染样品,以评价所建立反应体系的性能。以志贺氏菌基因组DNA为模板,最低检测限为1 pg/u L;以10倍梯度稀释的菌液用水煮法提取DNA为模板,最低检测限为9×103CFU/m L;以含有ipa H的质粒为模板,最低检测限可以达到103考贝/u L;建立ipa H和ipa H-IAC标准曲线,Ct值与模板拷贝数均呈良好的线性关系(R2=0.999);人工污染初始菌量为20 g中10 CFU的羊肉时,志贺氏菌在增菌6 h后即可检出(水洗加试剂盒法)。作者建立的ipa H-IAC实时荧光定量PCR方法,既能有效检测食品中志贺氏菌,又能实时监测PCR反应过程,有效防止"假阴性"的发生,进一步保证了结果的可靠性,有利于实现样品中志贺氏菌实时荧光定量PCR检测方法的标准化。
- 王建昌王金凤李静孙晓霞陈瑞春
- 关键词：志贺氏菌实时荧光定量PCR内参
- 应用DPO-PCR方法特异性检测志贺氏菌被引量：9
- 2014年
- 本研究利用一种高特异性PCR引物设计方法——双启动寡核苷酸引物（dual-primingoligonucleotide，DPO），以志贺氏菌属侵袭性质粒抗原（ipaH）基因为靶基因，设计DPO引物，建立了特异性检测志贺氏菌属的DPO—PCR方法。结果显不，所建立的DPO-PCR方法检测灵敏度为1．65×10^2CFU／mL；与常规PCR引物相比，DPO引物设计简易，简化了PCR引物设计；DPO引物退火温度范围宽，在50-70℃退火温度内均可对靶基因进行高效扩增；DPO引物结构特殊，具有比常规PCR引物更高的特异性，反应中无非特异性扩增产生。实践检测结果显示，利用该方法对133份冻／鲜肉类、果蔬类、鲜牛奶、鸡蛋和熟食样本进行检测，共检出15份志贺氏菌阳性样本，经国标法（GB／T4789．5-2012）复检，两者检测结果一致，显示出良好的实用性和可靠性，为志贺氏菌快速、准确的检测提供了新手段。
- 徐义刚李丹丹刘忠梅吴岩李苏龙魏冬旭
- 关键词：志贺氏菌
