国家自然科学基金(30200233)
- 作品数：4 被引量：11H指数：1
- 相关作者：周晓明姜庆五陆嘉良汪华潘浩更多>>
- 相关机构：复旦大学江苏省疾病预防控制中心香港中文大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 甲型流感病毒基因变异与生存选择压力相关性分析被引量：10
- 2005年
- 目的研究甲型流感病毒基因变异与生存选择压力的关系,指导保守疫苗靶位点的寻找。方法选择相同血凝素(HA)血清型具有全基因组序列的分化距离较近的多个流感病毒株系,利用Blast2程序计算各株系之间的核酸保守性、蛋白质保守性、变异核苷酸在密码子序位中的频率以及生存选择压力指数,分析与生存选择压力指数的相关性。结果HA基因较其他基因的核酸保守性为显著低;HA抗原蛋白质保守性与NS基因同为较低;HA基因受生存选择压力作用;NS、聚合酶B1(PB1)基因受选择压力较小;NA、核蛋白(NP)基因受选择压力较大;生存选择压力指数与核苷酸第3密码子位点变异频率完全相关。结论流感病毒基因变异受复制机制形成差异和生存选择压力淘汰差异双重作用影响;各基因在流感病毒生物功能中地位不同,NA、NP基因保守性较强,适宜作为疫苗靶位点候选,HA基因相比较具有一定的保守性,有望寻找到保守区段,NS、PB1基因保守性较弱,不宜作为靶位点。
- 周晓明赵慧芳陆嘉良潘浩徐眉赵根明姜庆五汪华俞顺章
- 关键词：流感病毒A型疫苗密码子病毒
- 甲型流感病毒基因变异与生存选择压力研究
- 2010年
- 目的研究甲型流感病毒基因变异与生存选择压力的关系，指导保守疫苗靶位点的寻找。方法选择相同HA血清型具有全基因组序列的分化距离较近的多个流感病毒株系，利用Blast2程序计算各株系之间的核酸保守性、蛋白质保守性、变异核苷酸在密码子序位中的频率以及生存选择压力指数，分析与生存选择压力指数的相关性。结果HA基因较其它基因的核酸保守性为显著低；HA抗原蛋白质保守性与NS基因同为较低；HA基因受生存选择压力作用；NS、PB1基因受选择压力较小；NA、NP基因受选择压力较大；生存选择压力指数与核苷酸第3密码字位点变异频率完全相关。结论流感病毒基因变异受复制机制形成差异和生存选择压力淘汰差异双重作用影响；各基因在流感病毒生物功能中地位不同，NA、NP基因保守性较强，适宜作为疫苗靶位点候选，HA基因相比较具有一定的保守性，有望寻找到保守区段，NS、PB1基因保守性较弱，不宜作为靶位点。
- 周晓明徐眉赵慧芳陆嘉良赵根明姜庆五
- 关键词：甲型流感病毒
- 30只鸭子中甲型流感病毒的检测
- 2003年
- 目的 了解近期禽宰场流感病毒在鸭子中的携带情况。方法 在禽宰场随机选择正常健康状况待宰鸭子 3 0只 ,分别取咽和肛门混合拭子 ,使用鸡胚培养扩增 ,血凝法初筛 ,甲型流感病毒核蛋白 (NP)蛋白保守核酸序列作扩增鉴定。结果 在 3 0份样品中 ,经鸡胚培养扩增 ,1∶5 0的血凝法初筛 5 0 %为阳性 ,经核酸聚合酶链反应扩增鉴定10份样品中 ,9份为甲型流感病毒。结论 用本方法在正常鸭子中甲型流感病毒的可检出携带率约为 45 %。
- 陆嘉良周晓明林玉尊居丽雯姜庆五顾惠心俞顺章潘浩朱凤才
- 关键词：甲型流感病毒PCR反应鸭子血凝法
- SARS病毒Spike蛋白具有中和活性的抗原表位预测和初步鉴定被引量：1
- 2006年
- 目的:预测并合成SARS病毒Spike蛋白中具有中和活性的抗原表位,鉴定其在免疫检测和疫苗设计中的作用。方法:使用二级结构以及基因组对比预测方法,预测Spike蛋白中具有较高抗原活性的肽段序列并人工合成。用直接ELISA法检测在SARS确诊阳性患者血清和健康人血清之间相应抗体的检出差别,确定预测肽段是否为SARS的抗原肽段。结果:预测并人工合成了具有抗原活性的GEVFNATKFPSVYAW多肽,在ELISA检测中,可检测出SARS阳性血清中的针对性抗体,阳性符合率为71.4%,在健康人血清中不能检测出对应的抗体,阴性符合率为92%。结论:预测并合成了具有SARS病毒Spike蛋白的中和表位抗原,其特异性高于全病毒抗原,为SARS的诊断及疫苗的设计奠定了基础。
- 潘浩周晓明朱凤才史智扬李显郭喜玲韩卫宁汪华
- 关键词：SARS病毒SPIKE蛋白多肽中和表位
