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国家高技术研究发展计划(2011AA100307-02)

作品数：15 被引量：78H指数：6
相关作者：昝林森杜立新张莉魏彩虹赵福平更多>>
相关机构：西北农林科技大学中国农业科学院北京畜牧兽医研究所国家肉牛改良中心更多>>
发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
相关领域：农业科学生物学医药卫生文化科学更多>>

文献类型

  • 14篇中文期刊文章

领域

  • 9篇农业科学
  • 4篇生物学
  • 1篇医药卫生
  • 1篇文化科学

主题

  • 7篇基因
  • 6篇绵羊
  • 4篇多态
  • 2篇多态性
  • 2篇肉质
  • 2篇品系
  • 2篇重组腺病毒
  • 2篇外显子
  • 2篇腺病
  • 2篇腺病毒
  • 2篇基因组
  • 1篇单核
  • 1篇单核苷酸
  • 1篇单核苷酸多态
  • 1篇杜泊绵羊
  • 1篇多态性分析
  • 1篇多态性研究
  • 1篇新品系
  • 1篇育种
  • 1篇育种值

机构

  • 7篇西北农林科技...
  • 7篇中国农业科学...
  • 4篇国家肉牛改良...
  • 2篇甘肃农业大学
  • 1篇内蒙古大学
  • 1篇内蒙古农牧业...
  • 1篇渭南职业技术...
  • 1篇全国畜牧总站

作者

  • 7篇昝林森
  • 7篇杜立新
  • 6篇赵福平
  • 6篇魏彩虹
  • 6篇张莉
  • 4篇王慧华
  • 3篇王洪宝
  • 3篇付常振
  • 3篇姜碧杰
  • 3篇刘佳森
  • 3篇成功
  • 3篇李耀坤
  • 3篇马晓萌
  • 3篇轩俊丽
  • 2篇郝瑞杰
  • 2篇高建斌
  • 2篇周鑫磊
  • 2篇杨宁
  • 2篇朱光星
  • 2篇王虹

传媒

  • 5篇畜牧兽医学报
  • 4篇中国畜牧兽医
  • 3篇中国农业科学
  • 1篇家畜生态学报
  • 1篇计算生物学

年份

  • 4篇2016
  • 1篇2015
  • 2篇2014
  • 6篇2013
  • 1篇2012
共 15 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
牛SREBP1基因shRNA序列的筛选及其腺病毒载体的构建与鉴定被引量：2
2013年
【目的】筛选可靶向干扰牛的SREBP1基因的有效shRNA,构建相应腺病毒载体并包装重组腺病毒,为在细胞水平上研究SREBP1基因的功能和作用机制提供基础。【方法】以秦川牛SREBP1基因为研究对象,首先靶向其编码区(coding sequence,CDS)序列设计并合成6条干扰和1条阴性对照shRNA,并构建表达载体pENTR-U6-shRNA。然后与载体psiCHECK-Ⅱ-SREBP1共转染293A细胞,筛选有效的pENTR-U6-shRNA。其次将筛选的pENTR-U6-shRNA和阴性对照pENTR-U6-NC分别与腺病毒骨架载体pAd/PL-DEST体外重组,得到腺病毒重组载体,并在293A细胞包装扩繁得到高滴度腺病毒,GFP标记法测定病毒滴度。最后将病毒侵染牛前体脂肪细胞,实时荧光定量法(qRT-PCR)检测干扰效率。【结果】筛选出靶向牛SREBP1基因干扰效率为87.4%的shRNA-1053。构建了pAd-1053和阴性对照pAd-NC重组腺病毒载体并包装得到Ad-1053和Ad-NC高滴度病毒,测定得到的病毒滴度分别为7×108 GFU·mL-1和9×108 GFU·mL-1。Ad-1053和Ad-NC分别侵染牛前体脂肪细胞,qRT-PCR检测结果显示Ad-1053可显著降低SREBP1基因的mRNA水平(干扰率>85%),而Ad-NC对SREBP1基因表达无明显影响。【结论】成功筛选得到靶向干扰牛SREBP1基因的有效shRNA,并包装扩繁获得相应的高滴度重组病毒。
付常振昝林森王虹成功王洪宝李耀坤姜碧杰高建斌杨宁
关键词：SHRNA重组腺病毒
乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态性与生长性状的关联被引量：6
2016年
【目的】基于前期绵羊肉用性状GWAS研究结果,旨在探讨RIPK2基因对乌珠穆沁绵羊生长性状的影响,找到该基因中与绵羊生长性状相关的分子标记,同时对GWAS结果进行验证。【方法】在343只乌珠穆沁绵羊试验群体中,选取其中30个个体的血液DNA样本,以相同浓度组成池DNA,设计引物对RIPK2基因外显子及其上下游1 000bp的调控区进行PCR扩增,PCR产物检测为目的条带后测序。使用DNAMAN和Chromas2软件对测序峰图进行分析,采用飞行质谱方法对检测到的SNP位点及前期GWAS得到的SNP位点进行基因型分型。使用Haploview软件对多态位点构建单倍型及连锁不平衡分析。使用SPSS（22.0）软件进行RIPK2基因SNP位点与生长性状间的关联分析。【结果】共发现了4个多态位点,A5536G的同义突变rs01位于第四外显子内,在该位点检测到三种基因型,AA基因型频率为0.42,AG基因型频率为0.45,GG基因型频率为0.13,优势等位基因为A,其频率为0.65;在第七外显子上检测到T8952C错义突变rs02,在该突变位点检测到3种基因型,其中TT基因型频率为0.82,TC基因型频率为0.16,CC基因型频率为0.02,T为优势等位基因,基因频率为0.9;在第十外显子检测到T2836C的突变rs05,在该位点检测到两种基因型TT和CC,没有检测到杂合子基因型,TT基因型频率为0.25,CC基因型频率为0.75;上游调控区发现一个G5181C的突变rs30,有3种基因型,其中GC基因型频率为0.50,CC基因型频率为0.18,GG基因型频率为0.32,G为优势等位基因,其频率为0.58;GWAS得到的SNP位点是T4456C,在本研究中被命名为rs34,在该位点有3种基因型,其中TT基因型频率为0.49,TC基因型频率为0.37,CC基因型频率为0.14,优势等位基因T的频率为0.68。χ^2适合性检验发现,除rs34位点外,其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P〉0.05）。rs02位点处于低度多态（PIC〈0.25）,
马晓萌轩俊丽王慧华袁泽湖吴明明朱才业刘瑞凿魏彩虹赵福平杜立新张莉
关键词：生长性状多态性
绵羊体重性状全基因组关联分析被引量：9
2014年
本研究旨在利用全基因组关联分析方法(genome-wide association studies,GWAS)挖掘影响绵羊体重性状的遗传标记和功能基因。采用Illumina OvineSNP50BeadChip中密度商业化羊芯片,对3个品种(苏尼特羊、德国肉用美利奴羊和杜泊羊)共计329只绵羊的体重性状(初生重、断奶重、6月龄重、断奶前日增重、断奶后日增重、日增重)进行GWAS分析。统计分析和基因注释基于TASSEL软件、混合线性模型和2012年10月公布的最新版绵羊基因组Ovis_aries_v3.1序列信息。结果表明,有10个SNPs位点在全基因组显著水平上与断奶后日增重相关,部分位点分布在羊注释基因内(MEF2B、RFXANK等);除此之外还检测到22个SNPs在染色体显著水平上与其他体重性状存在相关性,获得一批重要的候选基因。这些基因对绵羊体重性状功能基因的挖掘具有重要的理论意义和参考价值。
张莉刘佳森徐凌洋赵福平陆健张世芳王慧华张晓宁魏彩虹陆国彬郑友民杜立新
关键词：绵羊体重性状全基因组关联分析
秦川牛DKK1基因SNPs检测及其与体尺、肉质性状的关联分析被引量：6
2013年
旨在对秦川牛DKK1基因进行SNPs检测,并研究其与秦川牛体尺、肉质性状的相关性。本研究随机选择相近饲养条件下447头18～24月龄的秦川牛母牛,采用DNA直接测序技术并结合PCR-SSCP方法进行DKK1基因全区段遗传变异检测。运用SPSS16.0程序中最小二乘法拟合线性模型对DKK1基因不同基因型与秦川牛体尺(体斜长、体高、腰高、尻长、腰角宽、胸深、胸围和坐骨端宽)和肉质性状(背膘厚、眼肌面积和肌间脂肪含量)进行关联分析。经DNA测序发现秦川牛DKK1基因存在5个突变位点,分别为第一内含子G523A突变;第二内含子A999G和A1 169G突变;第三内含子C1858T突变;第四外显子A2355G突变,其为第247位氨基酸Cys→Arg的错义突变。PCR-SSCP方法检测得到G523A和A2355G位点仅存在2种基因型;A999G、A1169G和C1858T位点存在3种基因型。卡方检验显示,G523A、A1169G和A2355G位点则处于Hardy-Weinberg极度不平衡状态(P<0.01),而A999G和C1858T位点于检测群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析表明,秦川牛DKK1基因不同突变位点的不同基因型与体斜长、体高、腰高、尻长、坐骨端宽和背膘厚、眼肌面积、肌间脂肪含量差异显著相关(P<0.05或P<0.01)。DKK1基因对秦川牛部分体尺、肉质性状有显著的影响,可以尝试作为秦川肉牛新品系培育的主效候选基因。
高建斌昝林森杨宁李耀坤皇甫一凡郝瑞杰马向辉付常振姜碧杰成功
关键词：SNPSPCR-SSCP体尺性状肉质性状
深度测序鉴定绵羊microRNA转录组被引量：4
2013年
本研究采集的Texel绵羊胎儿的背最长肌样品包括5个发育阶段:70、85、100、120和135 d。通过采用Solexa测序技术对混池样品进行了microRNA(miRNA)深度测序,获得了16532850条原始序列读数。使用ACGT101-miR v4.2分析软件对miRNA测序数据进行了深度发掘;通过与最新的哺乳动物成熟miRNA序列(miRNA数据库:miRBase v17.0)、miRNA前体序列、绵羊基因组序列(绵羊基因组数据库,2010年2月)的比对分析,对绵羊microRNA转录组数据库进行了大幅更新,pre-miRNA(miRNA前体)序列增至1529条,编码的miRNA成熟体序列增至1999条。通过实时荧光定量PCR技术对深度测序获得的5个miRNA在混池样品中进行了验证。绵羊miRNA的研究起步较晚,而miRNA的发现与鉴定将促进基因调控机制及miRNA功能的研究。
张世芳魏彩虹陆健张小宁周鑫磊张淑珍王光凯曹家雪赵福平张莉杜立新
维生素E对小鼠体内精子品质及精子DNA的保护作用被引量：9
2015年
旨在研究维生素E对小鼠精子DNA的保护作用及对精液中抗氧化物酶活性的影响。以小鼠为动物模型,选日龄、大小相同的健康雄性小白鼠50只,随机分成5组,在试验组小鼠的每千克日粮中分别添加4、8、12、16g的维生素E,对照组添加量为0,饲喂30d后,通过颈椎脱臼处死小鼠,解剖后通过附睾和曲精细管获得小鼠精液。通过单细胞凝胶电泳及相关检测试剂盒检测分析各组间精液DNA的完整性、精子活力、密度、畸形率、精浆中的超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH)、谷胱甘肽还原酶(GR)和过氧化氢酶(CAT)的活性。结果表明:每千克日粮中维生素E的添加量为12g时,0级精子百分率与对照组相比差异显著(P<0.05);添加量为8~16g时,精子活力与对照组相比差异显著(P<0.05);GR和SOD酶的活性与对照组相比差异显著(P<0.05)。每千克日粮中维生素E添加量为12~16g时,CAT酶的活性与对照组相比差异显著(P<0.05)。综上表明,在饲粮中添加维生素E浓度为12g·kg-1时可以明显提高小鼠精液中CAT、GR、GSH和SOD酶的活性及精子DNA的完整性。
赵宪林曹少杰赵春平郝瑞杰桂林生昝林森
关键词：小鼠维生素E精子DNA完整性
绵羊季节性繁殖相关基因TSHR外显子多态性研究被引量：6
2016年
旨在研究乌珠穆沁羊与湖羊这两种具有不同繁殖性能和发情周期绵羊的促甲状腺激素受体（Thyroid stimulating hormone receptor,TSHR）基因外显子区遗传变异特性及其构建的单倍型在品种间的分布和对mRNA和蛋白质二级结构的影响,为进一步揭示其对TSHR表达调控的影响及表型效应奠定基础。本研究采用直接测序的方法对中国蒙古系2个绵羊品种共172个个体TSHR基因的遗传变异情况进行分析。共发现了6个突变位点,独立性卡方检验发现SNP1、SNP3、SNP4和SNP5 4个多态位点的基因型在两个绵羊群体间的分布存在极显著差异（P〈0.01）,其中SNP5为错义突变,其余为同义突变;对这4个位点进行连锁不平衡分析发现,SNP3和SNP4两个位点完全连锁,其余位点两两之间存在不同程度连锁关系;生物信息学分析发现不同的单倍型使TSHR基因的mRNA二级结构发生改变,SNP5使受体蛋白的二级结构发生改变。结果提示：（1）TSHR基因外显子区存在4个在两个绵羊品种中具有潜在生物学功能和表型效应的突变位点,可组成H1～H6共6种单倍型,其中H1（CGCC）和H4（TTTG）分别在乌珠穆沁羊和湖羊群体中为优势单倍型,这可能与这两种绵羊不同的发情周期有关。（2）外显子区SNP5位点突变影响mRNA和蛋白质二级结构的稳定性,可能是具有潜在表型效应的重要功能位点。
轩俊丽马晓萌王慧华曹家雪魏彩虹赵福平马友记张莉杜立新
关键词：绵羊季节性繁殖
秦川肉牛新品系公牛肉用性能研究被引量：11
2012年
选取发育正常、健康无病、经标准化育肥、年龄为24月龄的秦川肉牛新品系公牛5头进行屠宰及胴体分割,测定屠宰率、净肉率、胴体产肉率、肉骨比等产肉性能指标,并对里脊、西冷、眼肉、上脑、臀肉、胸肉、黄瓜条、牛腩、肋条肉、牛前10个部位取样进行水分、粗灰分、粗蛋白、粗脂肪、剪切力、失水率、系水力和熟肉率8项指标的测定。结果表明,秦川肉牛新品系公牛日增重、屠宰率、产肉率、胴体产肉率、肉骨比等生产性能较传统秦川牛均有较大幅度提高,经过标准化育肥,24月龄时已具备良好的肉用生产性能,达到国际优质肉牛品种标准;秦川肉牛新品系公牛胴体不同部位间肉品质差别较大,通过对其10个部位牛肉品质评定,西冷、上脑、里脊、眼肉为高档肉,肋条肉、臀肉、黄瓜条为中档肉,牛腩、胸肉、牛前为低档肉。
朱光星昝林森张亚冉辛亚平王洪宝
关键词：产肉性能肉质
BLUP法和主成分分析法在杜泊绵羊商业化品系建立中的应用研究被引量：6
2013年
本研究旨在为以一个初始杜泊绵羊群体为基础,建立适应多样化市场需求的商业化品系,提供可借鉴的实用方法。具体实施步骤包括:(1)用单性状动物模型BLUP法估计杜泊绵羊与品系划分有关性状的育种值;(2)利用主成分分析法,抽取所研究性状的可解释85%以上变异的主成分;(3)依据主成分值表达式的系数大小及符号,解释每个主成分的实际意义,确定各主成分可作为哪个品系的建立依据;(4)根据个体各标准化主成分值的大小及相应的分系标准,对杜泊绵羊群体进行商业化品系划分。本研究依据实际需求将现有杜泊羊群体划分为体长系、体宽系和肥羔系,其结果与依据性状估计育种值进行品系划分相似。在不考虑分系相关性状的经济权重时,BLUP法和主成分分析法适于初始群体的品系建立。
周鑫磊陈华段崇杰佐建明杜立新刘佳森
关键词：杜泊绵羊BLUP育种值主成分分析
苏尼特羊拷贝数变异的基因组分布特征研究被引量：5
2013年
本试验利用Illumina OvineSNP50 Bead Chip芯片对71只苏尼特羊进行了分型,共检测到134个拷贝数变异区域(copy number variation regions,CNVR),大小范围为29.48kb～1.30Mb之间,总长度达到25.95Mb。基因注释及功能分析结果显示,这些基因与嗅觉感官知觉、化学刺激的感官知觉、感官知觉、识别等环境应答有关。选取5个CNVR进行qPCR验证,其中3个CNVR得到验证。通过对苏尼特羊基因组拷贝数变异的分析可以进一步了解绵羊基因组结构的特点,为今后开展绵羊基因组结构变异与重要经济性状的关联研究提供参考。
刘佳森张莉李蕴华赵福平魏彩虹杜立新
关键词：苏尼特羊基因组拷贝数变异单核苷酸多态
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