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国家自然科学基金(61033009)

作品数:26 被引量:64H指数:5
相关作者:莫则尧徐云张爱清陈国良孙广中更多>>
相关机构:北京应用物理与计算数学研究所中国科学技术大学中国科学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域:自动化与计算机技术理学天文地球核科学技术更多>>

文献类型

  • 25篇期刊文章
  • 2篇会议论文

领域

  • 20篇自动化与计算...
  • 5篇理学
  • 2篇天文地球
  • 1篇生物学
  • 1篇电子电信
  • 1篇核科学技术

主题

  • 7篇并行计算
  • 4篇进制
  • 4篇二进制
  • 4篇二进制翻译
  • 3篇动态二进制
  • 3篇动态二进制翻...
  • 2篇地下水
  • 2篇地下水流
  • 2篇数值模拟
  • 2篇私有
  • 2篇索引
  • 2篇结构网格
  • 2篇矩阵
  • 2篇缓存
  • 2篇寄存器
  • 2篇QEMU
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  • 2篇值模拟
  • 1篇等式
  • 1篇地下水流动

机构

  • 13篇北京应用物理...
  • 12篇中国科学技术...
  • 4篇中国科学院
  • 3篇安徽省高性能...
  • 1篇中国地质大学...
  • 1篇中国工程物理...
  • 1篇中国工程物理...
  • 1篇国家高性能计...

作者

  • 8篇莫则尧
  • 7篇徐云
  • 4篇陈国良
  • 4篇廖银
  • 4篇张爱清
  • 3篇靳国杰
  • 3篇孙广中
  • 3篇姜海涛
  • 2篇左风丽
  • 2篇潘玮华
  • 2篇刘青凯
  • 2篇肖丽
  • 2篇安恒斌
  • 2篇刘旭
  • 2篇郭红
  • 2篇陈波
  • 1篇刘家兵
  • 1篇程汤培
  • 1篇赵伟波
  • 1篇夏芳

传媒

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  • 5篇计算物理
  • 3篇计算机工程
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年份

  • 2篇2016
  • 1篇2015
  • 6篇2014
  • 7篇2013
  • 8篇2012
  • 3篇2011
26 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
基于JASMIN三维势场快速多极子算法的并行实现被引量:3
2013年
在JASMIN上,基于进程/线程两级并行实现策略,研制三维Laplace核函数FMM(fast multipole method)的解法器模块"JASMIN-3DLapFMM".该解法器已成功应用于三维静电场远场势的并行计算.固定单机问题规模,在上万个处理器核上运行百亿粒子的大规模问题,获得进程级几乎线性的并行可扩展性.固定总的问题规模和1 024个进程,4个线程时,获得大约3倍的加速.
左风丽刘旭张宝印胡晓燕
Parallel Simulation of Groundwater Flow in the North China Plain被引量:1
2014年
Numerical modeling is of crucial importance in understanding the behavior of regional groundwater system. However, the demand on modeling capability is intensive when performing high-resolution simulation over long time span. This paper presents the application of a parallel program to speed up the detailed modeling of the groundwater flow system in the North China Plain. The parallel program is implemented by rebuilding the well-known MODFLOW program on our parallelcomputing framework, which is achieved by designing patch-based parallel data structures and algorithms but maintaining the compute flow and functionalities of MODFLOW. The detailed model with more than one million grids and a decade of time has been solved. The parallel simulation results were examined against the field observed data and these two data are generally in good agreement. For the comparison on solution time, the parallel program running on 32 cores is 6 times faster than the fastest MICCG-based MODFLOW program and 11 times faster than the GMG-based MODFLOW program. Therefore, remarkable computational time can be saved when using the parallel program, which facilitates the rapid modeling and prediction of the groundwater flow system in the North China Plain.
Tangpei ChengJingli ShaoYali CuiZeyao MoZhong HanLing Li
关键词:地下水流动系统MODFLOW时间跨度数值模拟
一种跨平台的并行编程框架设计与实现被引量:1
2014年
并行程序设计的复杂性及并行计算平台的多样性导致程序可移植性较差。为此,设计并实现一种跨平台、分层次的并行编程框架OpenCH。该框架通过两层并行函数库和层次化的API设计,对上层应用程序隐藏并行化细节,为基于不同计算平台的库函数设计了统一的函数接口,使底层平台的变化对上层应用程序透明。根据底层函数库的开发,给出一种填充式的编程方法和任务调度系统。将OpenCH应用于遥感影像分类,实验结果证明,基于该框架开发的并行程序可运行于多种并行计算平台,并具有较高的并行加速比,编程框架本身造成的时间开销低于15%。
李婷徐云聂鹏宇潘玮华
关键词:并行计算跨平台MPI编程
宏基因组分类问题中的特征提取及其降维研究
2015年
宏基因组测序序列分类问题是宏基因组学研究的一个重点问题.影响宏基因组分类性能的主要因素是特征向量的提取问题,如何提取并产生合适的特征向量对于提高宏基因组分类问题的分类精度和运行时间有着重大影响.因此,针对宏基因组分类问题的数据特点,利用三阶马尔可夫模型的性质,提出了一种基于转移概率矩阵的特征提取方法,并采用基于互信息的特征选择算法对提取后的特征向量进行降维处理,最后将新提出的特征向量应用到SVM分类算法中,并与相关算法进行了性能对比.结果显示,新提出的特征向量在不同的宏基因组物种之问有着良好的区分度,特别适用于大规模宏基因组数据的分类问题.
陈波徐云
关键词:宏基因组转移概率矩阵降维SVM算法
面向结构网格并行应用的一类快速通信算法被引量:6
2012年
通信算法需要在相邻子区域间传输数据.通过求解子区域间的相交问题可以寻找相邻区域.针对子区域的求交问题,基于区间树,结合结构网格应用的特点,构造近似线性时间复杂度的算法.数值实验表明该算法具有较高的计算效率和可扩展性,能够支持百万量级矩形子区域的并行计算.
刘旭张爱清肖丽莫则尧
关键词:并行计算结构网格
An efficient block variant of robust structured multifrontal factorization method
2013年
Based on the two-dimensional three-temperature (2D3T) radiation diffusion equations and its discrete system, using the block diagonal structure of the three-temperature matrix, the reordering and symbolic decomposition parts of the RSMF method are replaced with corresponding block operation in order to improve the solution efficiency. We call this block form method block RSMF (in brief, BRSMF) method. The new BRSMF method not only makes the reordering and symbolic decomposition become more effective, but also keeps the cost of numerical factorization from increasing and ensures the precision of solution very well. The theoretical analysis of the computation complexity about the new BRSMF method shows that the solution efficiency about the BRSMF method is higher than the original RSMF method. The numerical experiments also show that the new BRSMF method is more effective than the original RSMF method.
左宪禹莫则尧谷同祥
关键词:变种多波
X86平台上Open64软件流水的设计与实现被引量:2
2013年
由于缺乏相关硬件功能,Open64编译器的软件流水技术没有面向X86处理器的版本。为此,提出一种适用于X86平台的Open64软件流水实现框架。利用软件实现处理器的部分硬件行为,通过循环过滤方法剔除不适用的循环。针对缺乏循环寄存器文件的问题,设计寄存器分配算法达到使用通用寄存器的目的,并添加模变量扩展模块以保证执行的正确性。实验结果表明,与循环展开方案相比,该框架可使系统平均获得9%的性能提升。
刘家兵徐云
关键词:编译器模调度
基于校园卡记录的用户关联性度量
在人们的日常生活中,存在着各种信息系统,记录着用户的日常行为信息。通过对大量用户的日常轨迹信息的分析,可以发现用户之间的行为关联性,度量用户之间的社会关系强度。本文基于中国科学技术大学的校园卡系统数据特点,提出了一种基于...
林翔孙广中周英华
文献传递
数千上万核上模拟结果的并行可视化被引量:4
2012年
在科学与工程计算中,在数千上万核上,模拟包含上亿网格单元的模型通常输出TB量级的时变数据集。这些数据集包含多个时刻的数据,每个时刻的数据分布存储在数千个文件,单时刻的数据量达到几GB甚至几十GB。为了并行地可视化这种时变数据集,本文设计了基于网格片的层次化数据结构,基于该数据结构改进和优化了并行可视化流程和数据通信算法。在集成到可视化软件后,实现了两个应用的模拟结果可视化。实测数据表明,对于单时刻5GB和32GB的数据,在数十上百个处理器核上,从数据读入到获得体绘制结果的时间分别为19秒和80秒,交互操作为2秒到10秒;三维面绘制在数秒钟内,切片分析在2秒以内。
肖丽艾志玮王弘堃
关键词:并行可视化
一种动态二进制翻译中间接分支目标地址查找算法被引量:1
2014年
如何提高性能是动态二进制翻译中的核心研究问题.动态二进制翻译技术以分支指令结尾的基本块是翻译和执行的基本单元,基本块之间的跳转关系由分支指令确定.间接分支的目标地址在运行时才能确定,优化比较困难.已有工作表明间接分支目标地址的处理是影响动态二进制翻译系统性能的重要因素.经过我们的实验分析表明间接分支的目标地址分布具有较好的局部性,在此基础上提出一个带私有缓存的间接分支目标的查找算法,利用私有缓存对间接分支的目标地址进行预测,分支目标良好的局部性带来了高的预测成功率,从而减少了上下文切换的次数,并且使得X86体系结构下SPEC CPU2000 INT测试集程序在龙芯平台上翻译执行时间平均减少了10%-20%.
廖银姜海涛孙广中靳国杰陈国良
关键词:动态二进制翻译
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