农业部南亚热作财政专项(2007) 作品数:5 被引量:72 H指数:4 相关作者: 王静毅 武耀廷 陈业渊 冀小蕊 郑丽珊 更多>> 相关机构: 中国热带农业科学院 海南大学 广东省农业科学院 更多>> 发文基金: 农业部南亚热作财政专项 国家自然科学基金 海南省自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 经济管理 更多>>
香蕉A基因组品种间遗传关系的SSR检测 被引量:15 2007年 应用SSR技术,对32个香蕉A基因组类型品种(系)的遗传关系进行了检测。40对SSR引物在32个品种(系)中分别扩增带数在3~15个,平均每个SSR座位可检测2.99个多态性带;引物的多态信息量(PIC)在0.00~0.88,平均0.62。依据SSR数据计算的品种间遗传距离在0.00%~34.27%,平均12.45%,大多数品种间的遗传变异非常有限,但也存在着遗传差异突出的品种:FHIA25、Yangambi KM5、Pisang Jari Buaya、Rose和皇帝蕉。依据26%的遗传距离,除了FHIA25和Pisang Jari Buaya单独化成1组外,其它30个品种可以分为2组:品种间遗传差异相对较高的组I和品种间遗传差异相对较低的组Ⅱ。Williams与引进的洪都拉斯3号、M931之间,洪都拉斯1号和洪都拉斯2号之间,高脚青芽蕉和高脚顿地雷分别没有区分开来,这可能是同物异名,也可能是同一品种未能分辨的突变体。 冀小蕊 陈业渊 王静毅 郑丽珊 魏守兴 谢子四 武耀廷关键词:香蕉 A基因 SSR 棉花EST-SSRs在香蕉中的通用性 被引量:20 2008年 香蕉SSR分子标记开发和应用有限,通过对棉花SSR分子标记在香蕉中的通用性研究。用1343对棉花EST-SSR引物对贡蕉(AA)和野蕉(BB)两个材料进行转移扩增,得到226对有效扩增的引物。进一步用该226对引物对20个香蕉品种和4个野蕉材料扩增,得到了157对多态性引物。157对多态性引物共扩增到1188个条带,平均7.6个;引物的多态信息含量范围在0.58~0.91之间。依据获得的SSR数据,应用非加权类平均聚类方法,在相似系数0.60水平上,将24个品种分为两大类群,类群I是以A基因组为主的品种群,类群Ⅱ是以B基因组和A基因组与B基因组杂交的品种群,证明了棉花EST-SSR分子标记在香蕉中具有通用性。 郑丽珊 石玉真 王静毅 黄秉智 冀小蕊 张保才 袁有禄 武耀廷关键词:棉花 香蕉 聚类分析 世界杧果产业发展现状及前景 2007年 杧果Mangifera indica Linn.为漆树科Anaeardiaceae,杧果属Mangifera常绿植物,是世界第二大热带水果,其收获面积及产量仅次于香蕉,被誉为“热带水果之王”。杧果原产于印度、缅甸及马来西亚一带,商业栽培于亚洲、南美洲、北美洲、非洲及大洋洲的100多个国家和地区。杧果产量最多的国家是印度,其次是巴基斯坦、巴西和墨西哥等国家。中国也是世界杧果主产国之一,种植历史悠久,早在唐代即从印度引种。现以台湾省栽培最多,广东、广西、海南及福建、云南、四川等省(区)也有栽培。 梁伟红 李玉萍 董定超 刘燕群 古小玲关键词:热带水果 常绿植物 种植历史 杧果 香蕉EST-SSRs标记的开发与应用 被引量:44 2008年 从NCBI搜索的2282条香蕉EST中,发掘出含有SSR的EST序列110条,共有122个SSR位点,检出率为5.3%。SSR位点可分为37种重复单元,平均长度为20bp,其中二、三核苷酸重复单元的SSR占主导地位,分别占总SSR的33.1%和47.6%。GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的75.7%和36.0%;其他重复类型所占比例均不足10%,而四核苷酸重复类型最少,为4.0%。设计的63对EST-SSRs引物中,有41对EST-SSRs引物对巴西蕉基因组DNA能扩增出产物,占总引物数的65.1%。应用进一步筛选出的重复性好、多态性高的19对引物对49个香蕉品种(系)进行PCR扩增。每对51物扩增的多态性带数目为4~12个,平均7.58个;引物多态信息量变化范围为0.3572.0.8744,平均0.7324。在相似系数为0.63的水平可将49个品种聚为2个类群:一类为含B基因组香蕉品种;另一类为不合B基因组的香蕉品种,表明EST-SSR引物可以应用于香蕉品种资源分类的研究。 王静毅 陈业渊 刘伟良 武耀廷关键词:香蕉 EST EST-SSR 聚类分析 香蕉引进品种遗传关系的微卫星检测 被引量:5 2008年 应用SSR标记技术,对33个香蕉引进品种(系)和1个国内品种的遗传关系进行了检测。40对SSR引物在34个品种(系)中扩增带数在4~17个之间,平均每个SSR座位可检测3.05个多态性带;引物的多态信息量(PIC)在0.21~0.91之间,平均0.78。依据SSR数据计算的品种间遗传距离在0~45.53%之间,平均28.19%,说明引进的香蕉品种之间存在较为丰富的遗传变异。UPGMA聚类分析将34个品种分为A基因组和AB基因组为主的2大品种类群。检测出多个与我国早期引进的主栽品种巴西蕉和Williams遗传差异突出的引进品种,这为筛选鉴定出新的替代品种,以及进一步在不同类群品种之间进行杂交选育新的品种奠定了基础。洪都拉斯3号与M931之间,洪都拉斯1号和洪都拉斯2号之间没有区分开来,它们可能分别是同一克隆,或者是同一克隆的突变体。 冀小蕊 陈业渊 王静毅 郑丽珊 魏守兴 谢子四 武耀廷关键词:香蕉 SSR 聚类分析