广东省医学科学技术研究基金(WSTJJ20061116440105196211238024)
- 作品数：3 被引量：20H指数：3
- 相关作者：张梅霞李章球陆志刚胡海燕刘顺会更多>>
- 相关机构：南方医科大学暨南大学更多>>
- 发文基金：广东省自然科学基金广东省医学科学技术研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- GPⅡb/Ⅲa抗体的二级结构及T、B细胞表位的预测被引量：5
- 2010年
- 应用SYFPEITHI等七种软件对人、鼠源血小板糖蛋白GPⅡb/Ⅲa抗体蛋白进行HLA-A*0201、HLA-A*1101和HLA-A*2401限制性表位预测,经去除已发表多肽,取前者覆盖后两者多肽为混合CTL表位;再联合predTAP等TAP结合预测软件结果及NetChop等蛋白酶切位点预测软件结果,取包含这两者的多肽为CTL修正表位。用基于肽MHC-Ⅱ结合算法Syfpeithi等软件进行HLA-DR Th表位预测,最后取Th表位覆盖CTL修正表位而得T细胞混合表位。用DNAstar软件子程序Protean软件对两条蛋白链进行二级结构、B细胞表位预测。从1 740条多肽中筛选出人源GPⅡb/Ⅲa抗体5条T细胞混合表位肽:1-15、24-38、50-64、65-81、109-121,7条B细胞表位肽:5-9、22-30、40-46、55-71、80-90、100-105、110-115;鼠源GPⅡb/Ⅲa抗体5条T细胞混合表位肽:1-15、26-40、46-60、68-82、93-107,5条B细胞表位肽:5-10、38-43、58-70、77-84、99-105。
- 李章球张梅霞胡海燕刘顺会陆志刚
- 关键词：特发性血小板减少性紫癜抗原表位生物信息学
- 两种主动免疫特发性血小板减少性紫癜动物模型免疫功能的动态变化被引量：9
- 2010年
- 背景:目前的特发性血小板减少性紫癜模型多为重度,血小板下降显著但持续时间短,与临床患者血小板波动变化的特性拟合不佳。目的:用兔抗小鼠血小板血清及豚鼠抗小鼠血小板血清构建中度特发性血小板减少性紫癜模型,并探讨其适用性。方法:应用不同稀释倍数的抗血小板血清腹腔注射免疫小鼠,筛选出1:32稀释倍数的抗血清制备中度特发性血小板减少性紫癜模型。免疫结束后分8个时间点取血、骨髓及淋巴器官,观察各种细胞、细胞因子及组织结构的改变。结果与结论:两种抗血清免疫后,小鼠血小板数量均下降到正常数目的40%～60%,并能维持7d;骨髓巨核细胞数于免疫后8d明显增加,16d基本恢复正常;红细胞C3b受体花环与红细胞免疫复合物花环率明显下降(P<0.05);白细胞介素2和干扰素γ水平及CD4+/CD8+细胞比例明显升高(P<0.05);脾小巨核细胞增加,胸腺萎缩。说明豚鼠和兔抗小鼠血小板血清制备的慢性特发性血小板减少性紫癜模型存在红细胞免疫功能紊乱,T淋巴细胞亚群比例失调以及细胞因子分泌变化,是一种与临床拟合良好的中度特发性血小板减少性紫癜模型。
- 胡海燕李章球余力姚瑶王国征孙明黄睿张梅霞陆志刚
- 关键词：血小板减少性紫癜动物模型血小板免疫功能
- 生物信息学预测GPIIb/IIIa抗体CTL、Th的混合表位被引量：6
- 2009年
- 背景:GPIIb/IIIa是特发性血小板减少性紫癜患者最常见的血小板糖蛋白,已证实该蛋白独特型抗体结合血小板后会激活补体,破坏血小板。目的:以GPIIb/IIIa抗体为靶抗原,应用生物信息学软件对其CTL、Th细胞表位进行多参数预测。设计、时间及地点:开放性实验,于2008-03/08在珠江医院血液科实验室完成。材料:GPIIb/IIIa抗体的氨基酸序列由GENBANK公司提供。方法:分别应用SYFPEITHI,RANKPEP,BIMAS,SVMHC,PREDEP,MHCPRED,PROPRED软件对人和鼠源的血小板糖蛋白GPIIb/IIIa抗体蛋白进行HLA-A*0201,HLA-A*1101,HLA-A*2401限制性表位预测,经去除能引起自身免疫的已发表的多肽,取前者覆盖后二者的多肽为混合CTL表位,再联合软件predTAP、TAPPred的TAP结合预测结果,以及NetChop、MAPPP、PAProC软件的蛋白酶切位点预测结果,取能包含二者的多肽为CTL修正表位。用基于肽MHC-Ⅱ结合的算法Syfpeithi,RANKPEP,Mhcpred,HLAPRED进行HLA-DR的Th表位预测,最后取Th表位覆盖CTL修正表位,得到CTL、Th细胞混合表位。结果:从1740条多肽中筛选出5条人源抗人血小板糖蛋白GPIIb/IIIa抗体的CTL、Th细胞混合表位肽,即Anti-GPIIb/IIIa-Human的第1-15,24-38,50-64,65-81,109-121位;筛选出5条鼠源抗人血小板糖蛋白GPIIb/IIIa抗体的CTL、Th细胞混合表位肽,即Anti-GPIIb/IIIa-Mice的第1-15,26-40,46-60,68-82,93-107位。结论:根据血小板糖蛋白GPIIb/IIIa抗体预测的CTL、Th细胞优势抗原表位,可用于制备特异性抗体,可成为特发性血小板减少性紫癜新疫苗研究的靶点。
- 李章球胡海燕刘顺会张梅霞陆志刚
- 关键词：抗原表位生物信息学特发性血小板减少性紫癜
