国家现代农业产业技术体系建设项目(CARS-42-G03)
- 作品数：23 被引量：108H指数：6
- 相关作者：邹剑敏姬改革束婧婷单艳菊章明更多>>
- 相关机构：江苏省家禽科学研究所江苏立华牧业股份有限公司扬州大学更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程医药卫生更多>>
- 鸡繁殖性能近交衰退相关CpG岛差异甲基化基因的筛选被引量：2
- 2021年
- 鸡繁殖性能近交衰退是地方鸡遗传资源活体保种过程中面临的重要问题之一,本研究旨在探讨全基因组CpG岛(CpG island, CGI)区DNA甲基化在鸡繁殖性能近交衰退中的作用。分别从狼山鸡高近交组和低近交组中各选取健康母鸡3只,即试验分2个组,每组3个重复,然后采用全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)技术,检测分析两组个体性腺轴组织(包括卵巢和下丘脑)全基因组DNA甲基化差异,筛选差异甲基化区域(DMRs),并对CpG岛区差异甲基化基因进行功能注释和富集分析。结果表明,狼山鸡高近交组和低近交组比较,其卵巢和下丘脑基因组整体甲基化水平均不存在显著差异(P>0.05);高、低近交组间差异甲基化区域检测发现,下丘脑和卵巢中分别检测到5 948和4 593个差异甲基化区域,其中1 798和995个差异甲基化区域位于基因组CpG岛区,分别注释到1 020和552个基因;下丘脑中,这些CpG岛区差异甲基化基因显著富集在信号转导、神经系统发育、生殖系统发育和卵母细胞成熟调控等繁殖相关的GO条目,以及转化生长因子β信号通路、乙型肝炎、脂肪酸代谢、胰岛素信号通路等19条KEGG信号通路(P<0.05);卵巢中,CpG岛区差异甲基化基因显著富集于12条信号通路(P<0.05),包括慢性骨髓白血病、流感A、精氨酸和脯氨酸代谢、粘着连接等,一些与卵子发育和性激素分泌相关的信号通路也被富集到,如黄体酮介导的卵母细胞成熟、卵母细胞减数分裂、GnRH信号通路、雌激素信号通路等,其中包含CDC27、ADCY8、AKT3等10个差异甲基化基因。因此,本研究在狼山鸡高、低近交组间检测到了大量差异甲基化区域,并发现大量差异甲基化基因与繁殖性状相关,推测这些基因CpG岛区DNA甲基化可能在狼山鸡繁殖性能近交衰退调控中发挥重要作用,研究结果为进一步深入探索鸡繁殖性能近交衰退调控机制奠定了基础,为物种资源保护�
- 薛倩李国辉殷建玫张会永周成浩朱云芬邢伟杰苏一军邹剑敏韩威
- 关键词：狼山鸡DNA甲基化繁殖性能近交衰退
- 无尾鸡尾部骨骼解剖观察
- 1引言无尾性状是一种珍稀性状,有名的具有无尾性状的动物有澳大利亚的考拉(无尾熊)和英国的曼岛无尾猫(Manx cat),无尾猫不仅是名贵的宠物,而且还是研究椎骨发育的重要模式动物,另外在鸡和鼠上也发现部分无尾突变个体。无...
- 邸超宋迟郭影韩威徐文娟李慧芳
- 关键词：骨骼
- 文献传递
- 不同货架期对冷鲜鸡肉品质的变化及相关性分析被引量：14
- 2017年
- 本试验旨在研究配套系冷鲜鸡保存7 d货架期内肉品质指标变化规律及其相关性分析。选取6块新鲜胸肌分装于聚乙烯(PE)食品保鲜袋中,做好标记,4℃冷藏,测定不同保存时间点(冷鲜保存0、1、2、3、6、7 d)鸡肉的pH、失水率、嫩度、肉色值、肌苷酸含量。结果表明:冷鲜鸡肉的pH随货架期的延长先上升后趋于平稳;失水率随货架期的延长先上升后趋于平稳;剪切力随货架期的延长呈先下降后上升的趋势;不同货架期冷鲜鸡肉的亮度值(L~*)差异均不显著(P>0.05),没有明显的变化规律;红度值(a~*)随货架期的延长呈现下降趋势;黄度值(b~*)随货架期的延长呈上升趋势;肌苷酸随货架期的延长呈降低趋势;冷鲜鸡不同货架期的pH与失水率呈显著正相关(P<0.05),与剪切力呈极显著负相关(P<0.01)。由此可知,7 d货架期对冷鲜鸡的肉色和肌苷酸有影响,冷鲜鸡肉冷鲜保存最长不超过6 d,pH与失水率、剪切力有一定相关性。
- 巨晓军屠云洁邹剑敏章明姬改革单艳菊刘一帆束婧婷
- 关键词：货架期肉品质
- 鸡小肠上皮细胞分离培养及NLRP3在该细胞中的表达被引量：2
- 2016年
- 为了探明NLRP3在鸡小肠上皮细胞中表达情况,为鸡的NLRP3基因在小肠细胞中的功能研究奠定基础。采用18胚龄的鸡胚,分离培养鸡的小肠上皮细胞(intestinal epithelial cells,IEC);采用免疫细胞化学(immunocytochemistry,ICC)和反转录PCR(RT-PCR)方法,检测NLRP3基因在鸡小肠上皮细胞中的表达。结果表明:分离培养出活性较强的IEC;ICC检测显示获得的小肠上皮细胞表面NLRP3抗原阳性,RT-PCR法可扩增出520 bp的目的片段。表明成功分离培养出鸡小肠上皮细胞,并证明鸡NLRP3在鸡小肠上皮细胞中表达。
- 陶志云朱春红徐文娟姬改革李慧芳
- 关键词：小肠上皮细胞NLRP3
- 不同类型鸡趾长伸肌中基因表达谱差异分析被引量：1
- 2016年
- 采用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对生长速度较慢的慢速型地方鸡品种清远麻鸡和生长速度较快的快大型肉鸡科宝500肉鸡趾长伸肌中与肌纤维生长发育相关的候选基因及信号通路进行系统筛查,以期探究其差异机制。结果表明:芯片分析共筛选到差异倍数在2倍及以上的基因1 225个,以科宝肉鸡为参照,清远麻鸡中482个基因上调,743个基因下调。选取7个差异表达基因进行qRT-PCR,对芯片结果进行了验证。基于KEGG Pathway分析发现,差异基因除参与肌纤维生长发育和分化相关信号通路(如Ca2+信号通路和Hedgehog信号通路)外,MAPK信号通路、Wnt信号通路、JAK-STAT信号通路、ErbB信号通路、脂肪酸合成信号通路等一些与能量代谢相关的信号通路也被富集为显著的信号通路。根据GO及KEGG Pathway分析结果,发现了23个基因可能与鸡肌纤维生长发育相关,这些基因在肌纤维生长发育过程中的作用尚有待深入研究。
- 章明束婧婷屠云洁姬改革单艳菊盛中伟张笛邹剑敏
- 关键词：清远麻鸡肌纤维表达谱芯片
- 鸡胚胎期FTO基因在脑和肌肉中的表达研究
- FTO(Fat mass and obesity-associated)基因在动物体中枢神经和多个周边组织中广泛表达,研究表明,FTO参与动物体的能量代谢,但是基因的具体功能还有待研究。本研究的目的是分析鸡胚胎发育过程中...
- 邸超宋迟宋卫涛陶志云朱文奇李慧芳
- 关键词：下丘脑骨骼肌
- 文献传递
- 基于性染色体CHD基因序列差异鉴定鸡的性别被引量：5
- 2013年
- 家禽的性别一般可以通过翻肛法或其他常规方法来鉴定,但只能在出雏之后进行。近年来发展的分子生物学方法可以将家禽的性别鉴定时间提早到胚胎期,而且正确率能够达到100%。家禽性别由性染色体W和Z决定,雌性为ZW型,雄性为ZZ型。CHD基因在性染色体Z和W上均存在,本文根据该基因的某段序列在性染色体Z和W上的大小差异,设计出一对引物。利用该对引物对清远麻鸡鸡胚肉样以及成年鸡血液中提取出的基因组DNA进行扩增,并对扩增产物进行克隆测序验证以及琼脂糖凝胶电泳,结果表明扩增序列为CHD基因的目的片段;电泳条带差异明显,根据条带数的不同可以明确区分鸡的性别。
- 刘宏祥姬改革胡艳束婧婷宋迟宋卫涛
- 关键词：CHD性别鉴定基因型
- 文昌鸡与海赛克斯D系杂交后代体尺和屠宰性能的测定与分析
- 本研究测定了文昌鸡(♂)与海赛克斯D系(♀)杂交后代20周龄和40周龄的体尺和屠宰性能,并进行相关性分析。结果表明:同周龄公母鸡间体尺性状差异极显著(p<0.01);20周龄与40周龄公鸡间,除胫长(p=0.605)与体...
- 汤青萍陈宽维章双杰李慧芳
- 关键词：文昌鸡体尺屠宰性能
- 文献传递
- 文昌鸡肉质相关基因多态性分析
- 2011年
- 为了探究与肉质风味相关基因A-FABP和ADSL基因在文昌鸡群体中的遗传变异情况,本研究运用连接酶检测反应的方法(PCR-LDR)对文昌鸡A-FABP基因C51T变异位点和ADSL基因C3484T变异位点进行基因分型,并分析了这两个位点在文昌鸡群体中的基因型、基因频率和哈-温平衡情况。结果显示,A-FABP基因C51T和ADSL基因C3484T位点均检测到CC、TT和CT3种基因型,A-FABP基因C51T基因型频率(CC、TT和CT)和等位基因频率(C、T)分别为0.11、0.37、0.52和0.37、0.63;ADSL基因C3484T基因型频率(CC、TT和CT)和等位基因频率(C、T)分别为0.40、0.45、0.15和0.63、0.37;文昌鸡在这两个变异位点均处于哈-温平衡状态(P>0.05)。
- 顾华兵李慧芳朱文奇宋卫涛韩威徐文娟陈宽维
- 关键词：文昌鸡
- 基于RAD-seq简化基因组测序的19个地方鸡种遗传进化研究被引量：16
- 2020年
- 旨在基因组水平上揭示地方鸡种的遗传进化,发掘重要种质特性基因。本研究利用简化基因组RAD-seq测序鉴定19个地方鸡种(每个品种按照家系选取30个个体,10公、20母)基因组SNP标记,计算观察杂合度(Ho)、核苷酸多样度(Pi)、近交系数(Fis)、遗传分化系数(Fst)和基因流(Nm)等遗传统计量指标,分析地方鸡种的遗传多样性和遗传结构,并通过选择信号检测鉴定基因组受选择基因。结果表明,在19个地方鸡种中鉴定出400562个SNPs标记。瓢鸡(PJ)和文昌鸡(WC)的遗传多样性最为丰富,观察杂合度(Ho)分别为0.2468、0.2430,核苷酸多样度(Pi)分别为0.2781、0.2655;河南斗鸡(DJ)的遗传多样性相对匮乏,Ho为0.1560,Pi为0.1752;东乡绿壳蛋鸡(DX)和边鸡(BJ)的近交系数最高(Fis>0.1600)。瓢鸡与文昌鸡、惠阳胡须鸡(HX)、藏鸡(ZZ)、大围山微型鸡(WX),惠阳胡须鸡与文昌鸡,藏鸡与茶花鸡(CH)间的遗传分化最低(Fst<0.1000),对应的基因流最高(Nm>0.2400)。河南斗鸡与其它品种间的遗传分化均处于较高水平,与其中15个品种间的Fst>0.2000、Nm<1.0000。遗传聚类分析(2个引入品种做外群)将地方鸡种总体上分为5类,与品种形成历史和地理分布基本吻合。通过选择信号分析,在19个地方鸡种合并群体中检测出9个常染色体上的26个区域受到选择作用,包含31个受选择基因。这些受选择基因广泛参与免疫系统调节、生殖机能调控、应激响应、代谢等生物学过程。利用基因组SNP标记能更全面准确地揭示地方鸡种的遗传多样性和遗传结构,选择作用主要体现在对地方鸡种抗逆抗病特性、配子活力及行为等方面的塑造。
- 韩威朱云芬殷建玫李国辉薛倩张会永沈海玉苏一军窦新红王克华邹剑敏
- 关键词：地方鸡种遗传进化
