国家自然科学基金(20875022)
- 作品数:20 被引量:39H指数:4
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- MOLMAP指数生成及其在化学反应分类和反应性预测中的应用
- 2012年
- 分子MOLMAP指数是通过递交一个分子中所有化学键描述符到Kohonen自组织映射,基于一个特定的算法所生成,其中Kohonen自组织映射已经预先由多种类型化学键所衍生的描述符进行了训练。化学键描述符由化学键的物理化学性质或(和)拓扑性质组成。MOLMAP指数是一个基于化学键类型的分子指数。若2个描述符相似的化学键激活同一个Kohonen自组织映射神经元,则2个化学键为同一类型。进一步,采用反应物与生成物的MOLMAP指数差异性描述化学反应,衍生了化学反应的MOLMAP指数。此指数能够在没有参与化学反应的化学键信息的情况下进行化学反应的相关研究,因而能够广泛地应用。本文从3个方面概述了MOLMAP指数的应用:1)在化学反应分类中的应用,例如:预测生物代谢反应分类;2)在化学反应性预测中的应用,化学反应性是指与化学反应有关的性质,例如:预测物质的变异性和抗氧化性;3)在三维数据处理中的应用,是基于MOLMAP指数算法进行的扩展,例如:预测氯酚类化合物的毒性。
- 龙海林冯秀林索净洁张丹丹李静亚张庆友许禄
- 基于电负性构象独立手性指数及应用
- 2010年
- 为了采用计算方法研究手性化合物,为了通过结构-活性相关性研究预测与手性有关的性质,本文提出了采用σ和π的残余电负性之和作为原子属性的构象独立手性指数。该手性指数衍生于原子径向分布函数,包含分子几何和原子属性的信息,能够区分对映体。将构象独立手性指数应用于1个包含48对手性氨醇对映体的数据集,该数据集为苯甲醛与二乙基锌发生加成反应的催化剂,每个催化剂均产生特定绝对构型的反应主产物。采用相向传输神经网络建立了手性氨醇催化剂的构象独立手性指数与反应主产物绝对构型的相关性模型,得到了满意的预测结果。对于独立的测试集,90.0%的催化剂被正确地预测;对于训练集,89.5%的催化剂被正确地识别。
- 张庆友李静亚郝军峰许禄
- 关键词:电负性
- 手性拓扑电荷指数及其应用被引量:7
- 2010年
- 通过扩展二维拓扑指数,提出了非基于CIP规则的手性拓扑电荷指数.该扩展采用四个原子属性:偏原子电荷、轨道电负性、极化率和空间位阻分别代替CIP规则的原子数来设定手性中心的构型.新的手性指数被用来预测手性仲醇化合物的核磁共振波谱的属性,取得了满意的结果.对于训练集和测试集,96.7%和90.0%被正确的预测.
- 张庆友胡卫平郝军峰刘绣华许禄
- 仲醇化合物的手性指数及其应用
- 在特定催化剂条件下,主产物的绝对构型研究是不对称催化反应的关键问题之一。本文提出采用与手性中心直接键连的原子的类型,例如芳香原子,生成仲醇化合物的手性指数,并将手性指数应用于一个包含50 对手性仲醇对映体的数据集,该数据...
- 李静亚赵谈封张丹丹索净洁张庆友许禄
- CdS-BSA-CTMAB荧光光度法测定食品中蛋白质的含量被引量:2
- 2012年
- 实验以六偏磷酸钠为稳定剂,巯基乙酸为修饰剂水相合成了荧光试剂CdS量子点。结果表明,牛血清白蛋白(BSA)可使CdS的荧光峰增强,而阳离子表面活性剂十六烷基三甲基溴化铵(CTMAB)的加入,可使体系荧光峰显著增敏,并且荧光强度与BSA浓度在8.0×10-5~1.3mg/mL范围内呈良好的线性关系,回归方程为F=1486.94793+937.70328C,相关系数R=0.9957,检出限为7.4×10-5mg/mL。方法已用于食品中蛋白质的测定,与考马斯亮蓝法对照,结果满意。
- 焦嫚董学芝胡卫平王鑫
- 关键词:CDS量子点十六烷基三甲基溴化铵牛血清白蛋白
- 基于MOLMAP指数的光化学反应分类预测被引量:1
- 2012年
- 由反应物和产物的结构衍生了反应物、产物和化学反应的MOLMAP指数,其中化合物的结构由化学键的物理化学性质和拓扑性质所表征.将前述MOLMAP指数应用于一个含七类光化学反应的数据集,通过随机森林建立了三种类型的模型:(1)预测反应物可能发生的反应类型;(2)预测可能合成产物的反应类型;(3)预测整个化学反应的类型.由于无需指定数据集中参与反应的化学键,所以,MOLMAP指数能够得到广泛的应用.所得分类预测结果好于我们此前对同一数据集的研究,表明改进化学键的描述有助于提高MOLMAP指数的预测能力.
- 张庆友冯秀林龙海林索净洁张丹丹许力壮许禄
- LS-SVM模型选择及其在森林火灾预测中的应用被引量:1
- 2011年
- 文章根据森林火灾的实际数据,选取适当的目标函数,利用最小二乘支持向量机(LS-SVM)建立模型,通过对LS-SVM中超参数的联合优化选择出最佳模型,并把用所选模型进行预测的结果与支持向量机(SVM)预测的结果进行比较,结果表明所建立的森林火灾预测模型具有较高的预测精度。
- 李娴
- 关键词:LS-SVMSVM
- 不对称反应的对映体过量值预测被引量:2
- 2012年
- 建立了手性催化剂结构与反应产物对映体过量值的定量结构-活性相关性模型,以辅助苯乙酮不对称氢转移反应的催化剂筛选.手性催化剂由手性氨醇配体与金属络合物合成,故采用构象独立手性指数或构象依赖手性指数描述手性氨醇配体,采用指示变量区分金属络合物,然后合并2个指数来描述手性催化剂.通过遗传算法进行变量选择,采用随机森林法建立数学模型以预测对映体过量值,测试集的相关系数R2=0.769,整个数据集的OOB(Out-of-bag)交叉验证结果为R2=0.785.
- 张庆友张丹丹索净洁李静亚龙海林许禄
- 关键词:对映体过量值手性催化剂
- 二维分子形状和定量手性程度的研究被引量:1
- 2009年
- 以二进制编码描述苯环型化合物分子在二维空间的形状,所得到的编码能够区分二维平面上一对苯环型化合物对映体。由于对映体的二进制编码不同,基于化合物和其镜像的编码计算得到了海明距离,并以其表征1对对映体的定量手性程度。以28对周长为22的手性苯环型化合物对映体为实例,计算苯环型化合物的定量手性程度,其结果仅仅有2个数值,分别为海明距离4和6。具有不同形状的该类化合物很多,为了提高分辨率,分别计算了窗口宽度从1~16时的海明距离,并分别以其来代表定量手性程度。结果显示全部16个窗口的海明距离的加和具有最大的区分能力,共得到17种海明距离。如果将每一窗口的细节引入到计算中,并采用类似的方法计算,则实例中所有的28个苯环型化合物实现了完全的区分,所得到的定量手性程度的区分能力是令人满意的。本研究证明如果用适当的编码来描述二维空间中分子的边界,能够解决分子形状的定量表征。尽管本文的二进制编码衍生于平面系统的苯环型化合物,并以其描述分子的边界来进行手性程度的测量,但是,原则上同样的方法可以应用到所有二维平面上的形状描述。
- 张庆友胡卫平郝军峰许禄
- 关键词:分子形状
- 结晶紫-ZnS-BSA光度法测定蛋白质的含量
- 2012年
- 以乙酸锌为锌源,硫化钠为硫源,巯基乙酸为修饰剂水相合成了纳米粒子ZnS。方法基于ZnS能与结晶紫反应使结晶紫的峰型发生改变,吸光度降低,加入不同量的牛血清白蛋白(BSA)反应后,吸光度逐渐增大,建立结晶紫-ZnS-BSA分光光度法测定蛋白质的新方法。结果表明,体系的吸光度A与BSA浓度在0.010 0 mg/mL~4.40 mg/mL范围内呈良好的线性关系,线性方程为A=2.040 6+0.460 50C(mg/mL),相关系数R=0.996 2,检出限为0.009 15 mg/mL。该法用于肉松、酸奶等食品中蛋白质含量的测定,并与标准方法(考马斯亮蓝法)做对照,结果满意。
- 胡卫平焦嫚董学芝王鑫
- 关键词:ZNS牛血清白蛋白结晶紫