国家公益性行业科研专项(201103008) 作品数:24 被引量:142 H指数:6 相关作者: 张文东 赵焕云 张富强 张应国 范泉水 更多>> 相关机构: 云南省动物疫病预防控制中心 成都军区疾病预防控制中心 云南农业大学 更多>> 发文基金: 国家公益性行业科研专项 云南省科技计划项目 云南省农业科技创新工程项目 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 生物学 更多>>
细粒棘球蚴线粒体CO1基因的克隆与序列分析 被引量:6 2015年 目的研究细粒棘球蚴(Echinococcus granulasus)种间遗传标记特点,为该虫种的分子分类学研究提供基础。方法在内蒙古地区从羊肝脏采集细粒棘球蚴,肝包虫病患者手术剥离囊包后,签署知情同意书,采集细粒棘球蚴。提取虫体DNA,扩增线粒体细胞色素氧化酶1(CO1)基因,将其克隆到PGM-T载体后,用PCR技术鉴定阳性菌落,并进行测序,运用DNAstar5.0软件计算序列间的相似性,计算遗传距离,同时,应用MEGA4.0软件的最大似然法(ML-Maximum Likelihood)和邻接法(NJ-Neighbor Joining)构建系统发育树,进行聚类分析。结果细粒棘球蚴DNA扩增出的羊株、人株CO1基因序列片段长度为936bp。同其他亲缘关系较近的属CO1基因序列比对:羊株、人株细粒棘球蚴CO1序列与黄花棘球绦虫的同源性最高,分别为91.9%、91.2%;羊株、人株细粒棘球蚴CO1序列与黄花棘球绦虫位于同一分支,自展值(Boostrap)最高,均为100%。羊株、人株细粒棘球蚴CO1序列所属分支与原头目的 Proteocephalus macrocephalus所属分支相隔较远。结论CO1基因序列稳定保守,无宿主特异性,可作为细粒棘球蚴理想的种间遗传标记。 于晶峰 李滨 刘晓松 常建华 杨晓野 王瑞 杨莲茹 李秀霞 木兰关键词:细粒棘球蚴 克隆 口蹄疫LPB-ELISA抗体滴度、血凝抗体滴度和中和抗体滴度相关性的比较研究 被引量:2 2012年 为了评价口蹄疫液相阻断LPB-ELISA抗体滴度、血凝抗体滴度、中和抗体滴度的关系,本研究对野外采集的38份牛血清分别进行LPB-ELISA、正向间接血凝(IHA)和微量细胞中和试验(VNT),检测各份血清的LPB-ELISA抗体滴度、血凝抗体滴度和中和抗体滴度,并进行相关性分析比较。结果表明LPB-ELISA抗体滴度和中和抗体滴度相关性极显著,相关系数r=0.489(P<0.01);LPB-ELISA抗体滴度和血凝抗体滴度相关系数仅为0.149,血凝抗体滴度和中和抗体滴度相关系数为0.179,相关性均不显著。本研究为利用LPB-ELISA方法进行口蹄疫血清学监测和普查提供了试验依据。 廖德芳 孙强 苗海生 高林 李乐 信爱国 朱明旺 李华春关键词:口蹄疫 抗体滴度 细粒棘球蚴(Echinococcusgranulosus)CO1与ND1基因序列分析 2014年 目的为了明确内蒙古锡林郭勒盟西乌旗羊株和锡林浩特市人株细粒棘球蚴之间的基因型及其遗传变异情况。方法利用分子生物学技术对采自两地区细粒棘球蚴的线粒体CO1基因与ND1基因进行了克隆和测序,并运用DNAStar5.0中的MegAlign工具对已测出的序列进行了分析。结果西乌旗羊株细粒棘球蚴与锡林浩特市人株细粒棘球蚴CO1基因片段和ND1基因片段大小分别均为936bp和895bp。西乌旗羊株细粒棘球蚴CO1基因序列与新疆羊株细粒棘球蚴的CO1基因序列同源性为99.3%;锡林浩特市人株细粒棘球蚴CO1基因序列与新疆人株细粒棘球蚴的CO1基因序列同源性为98.6%;且西乌旗羊株和锡林浩特市人株细粒棘球蚴ND1基因与国内外已报道的G1型ND1基因序列完全相同。结论表明内蒙古上述两地区细粒棘球蚴的同源性很高,且基因型均为G1型,这为内蒙古某些地区细粒棘球蚴流行虫株的确定提供了重要依据,同时也对当地细粒棘球蚴病的预防和控制具有重要意义。 于晶峰 谭伟 李滨 刘晓松 常建华 杨晓野 王瑞 杨莲茹 李秀霞关键词:细粒棘球蚴 基因型 2012年-2013年云南边境禽流感病毒 H5N1亚型血凝素基因分析 被引量:2 2014年 为了解2012年-2013年云南边境禽流感病毒 H5N1亚型血凝素(HA)基因变异及进化特征,在云南边境采集境外家禽和野生鸟类棉拭子样品1500份,经禽流感病毒 H5N1亚型特异性多重 RT-PCR 检测,选择代表性阳性样品,进行病毒 HA 基因扩增、纯化、克隆和测序,并与已知毒株和参考毒株序列进行序列比对及系统遗传进化分析。结果自1500份样品中检出 H5N1亚型阳性样品60份,60份阳性样品病毒 HA基因测序获得23种 HA 序列,可划分为2个不同进化分支(2.3.2,2.3.4),2.3.2进一步可划分为3个进化小分支(Ⅱ-1~Ⅱ-3),在23份代表性阳性样品中,17份样品属于进化小分支2.3.2Ⅱ-1,3份属于2.3.2Ⅱ-2,其余3份属于2.3.4;阳性样品中病毒 HA 裂解位点序列均具有高致病性禽流感病毒分子结构特征,HA受体结合位点、糖基化位点、表位关键性氨基酸位点及其他氨基酸位点存在变异,部分位点的变异具有分支或亚(小)分支特异性。2012年-2013年期间云南边境禽流感病毒 H5N1亚型间具有遗传差异,进化分支2.3.2Ⅱ-1成为当地流行的优势毒株。 刘庆亮 张文东 赵焕云 胡挺松 段博芳 曾伟 胡媛媛 邱薇 范泉水 张应国 宋建领 张富强关键词:禽流感病毒 H5N1亚型 血凝素 分子特征 云南省边境地区口蹄疫3ABC抗体调查 被引量:3 2015年 在云南与缅甸、老挝接壤或邻近的9个边境县(市)散养户、养殖场、交易市场采集牛血清3 129份、猪血清269份,应用口蹄疫病毒非结构蛋白3ABC抗体检测间接ELISA试剂盒进行检测并统计分析。统计分析结果显示,其中四个县(市)牛口蹄疫3ABC抗体阳性率分别为55%、54.44%、56.31%、44.38%,明显偏高;其中黄牛3ABC抗体阳性率为33.83%,水牛和奶牛分别为16.16%、0;放养牛3ABC抗体阳性率为27.65%,圈养牛3ABC抗体阳性率为15.05%;入境水牛和境内水牛口蹄疫3ABC抗体阳性率分别为14.66%和18.22%,差异不显著,入境黄牛和境内黄牛口蹄疫3ABC抗体阳性率分别为54.55%和33.74%,入境黄牛3ABC抗体水平显著偏高,存在口蹄疫传入风险。 陈汝琎 曾顺玉 苗海生关键词:口蹄疫 抗体调查 2013年云南省禽流感病毒H9N2亚型监测及其血凝素基因序列分析 被引量:4 2015年 为了解H9N2亚型禽流感病毒(AⅣ)的变异情况,本研究对2013年云南省16个地区的3 622份家禽临床样品进行AⅣ的鸡胚分离和RT-PCR检测,其中分离鉴定到97份H9N2亚型AⅣ分离株,并选取21个分离株进行HA基因测序及系统进化分析,结果表明:21份H9N2亚型AⅣ分离株的HA基因核苷酸序列同源性为86.0 %~99.4%,均属于欧亚分支的类A/Chicken/BeiJing/1/1994亚分支,而且又进一步划分为Ⅲ-1、Ⅲ-2两个小分支.其中Ⅲ-2分支为云南地区新出现的进化分支.氨基酸比对分析显示,测序的21个HA基因编码蛋白的裂解位点基序均具有低致病性病毒分子特征;与现用疫苗株相比,HA推导氨基酸序列中存在多个氨基酸位点差异;其中,Ⅲ-1与Ⅲ-2分支的AⅣ的HA氨基酸序列多个位点存在各自特有的点突变(氨基酸替换),这种变异具有一定的进化(亚)分支特异性.此外,HA基因多个受体结合位点氨基酸存在变异,其中234位氨基酸全部变为L,呈现了人流感受体结合特性;部分糖基化位点、抗原表位关键性氨基酸也存在变异. 胡媛媛 张文东 宋建领 刘庆亮 曾伟 王锐 郑锦玲 彭洁 保志鹏 张应国 范泉水 赵焕云 张富强关键词:禽流感监测 H9N2亚型 血凝素 云南边境地区禽流感H5N1亚型病毒NS基因进化分析 被引量:1 2013年 目的阐明云南边境地区禽流感H5N1亚型病毒NS1、NS2基因变异特征及遗传进化关系。方法在云南边境地区采集境外家禽和野生鸟类棉拭子样品,经H5N1亚型特异性多重RT-PCR检测,阳性样品对病毒NS基因进行扩增,克隆至pMD18-T载体测序,获得NS1、NS2基因序列,并与已知参考毒株序列进行序列比对及系统发育分析。结果自1240份样品中检出H5N1亚型阳性样品71份,阳性率为5.72%;30份代表性阳性样品病毒NS基因测序获得17种序列,存在3个不同进化(亚)分支(Ⅰ-1、Ⅰ-2、Ⅱ);NS1/NS2基因与病毒血凝素(HA)基因呈现不同进化关系;NS1蛋白涉及核定位信号区、RNA结合区、效应区及其他致病性相关的关键性氨基酸位点存在替代或突变。结论云南边境地区H5N1亚型病毒NS1/NS2基因具有遗传差异,2010年以来NS基因进化分支Ⅰ-2、Ⅱ已成为当地流行的优势毒株。 肖雪 张文东 段博芳 赵焕云 刘庆亮 胡挺松 邱薇 冯子良 郑颖 范泉水 张应国 张富强关键词:禽流感病毒 H5N1亚型 2013年云南省禽流感H9N2亚型病毒神经氨酸酶基因序列分析 被引量:1 2015年 目的了解2013年云南省禽流感H9N2亚型病毒NA基因变异及进化特征。方法对2013年云南省禽流感H9N2监测阳性样品进行NA基因克隆、测序及系统发育分析。结果 2013年云南省禽流感H9N2亚型病毒株NA基因核苷酸序列同源性为84.5%-99.5%,属于欧亚分支的类ADKHKY28097分支和类ACKHKG997分支。类ADKHKY28097分支为目前云南优势分支,且又进一步划分为Ⅰ-1、Ⅰ-2小分支。氨基酸比对分析表明,2013年云南毒株NA蛋白402位糖基化位点存在显著变化,161位新增了一个糖基化位点;唾液酸结合位点、抗原位点存在显著变异;酶活性位点稳定。除上述关键性氨基酸位点外,其余位点与现用疫苗株、参考毒株相比存在显著差异;且Ⅰ-1、Ⅰ-2、Ⅱ分支毒株多个位点存在各自特有的氨基酸替代,这种替代具有一定的进化(亚)分支特异性。结论 2013年云南省H9N2亚型禽流感病毒间具有遗传差异,类ADKHKY28097分支已成为当地流行的优势毒株,NA蛋白存在特异性氨基酸变异位点。 胡媛媛 张文东 宋建领 张应国 赵焕云 张富强关键词:禽流感病毒 H9N2亚型 神经氨酸酶 口蹄疫病毒持续感染的研究进展 被引量:4 2012年 从口蹄疫病毒和其宿主两个方面综合阐述了口蹄疫病毒持续感染形成的原因,旨在为进一步阐明口蹄疫病毒持续感染的机理和降低持续感染对口蹄疫防控存在的威胁提供理论依据。 周强 包慧芳 刘在新关键词:口蹄疫病毒 宿主 相互作用 云南省边境地区口蹄疫抗体检测 被引量:8 2017年 应用口蹄疫O、A、Asia-1型cELISA抗体检测试剂盒和口蹄疫非结构蛋白抗体单抗阻断ELISA试剂盒,对采集自云南省10个边境县的牛和猪血清进行检测。检测结果显示,牛口蹄疫O、A、Asia-1型抗体阳性率分别在9.23%~37.75%、3.00%~23.57%、9.75%~48.67%之间,阳性率偏低,并且地区间差异较大。非结构蛋白抗体阳性率在14.16%~51.00%之间,其中勐海为51.00%、芒市为48.96%,动物带毒风险较大。境内牛与境外入境牛口蹄疫O、A、Asia-1型抗体阳性率基本相当,非结构蛋白抗体阳性率略高于境内牛。由于入境牛免疫率较低,须加大对入境牛的监控。黄牛和水牛口蹄疫O、A、Asia-1型抗体阳性率基本一致,但黄牛非结构蛋白抗体阳性率为36.47%,水牛为26.86%,黄牛阳性率显著高于水牛,这可能是因为云南省边境地区的黄牛主要来自印度、孟加拉国,经缅甸进入我国。猪口蹄疫血清抗体阳性率较低,除芒市O型口蹄疫抗体阳性率达到81.00%外,其余均在0~6.00%之间,这可能与云南省近年来大量免疫合成肽疫苗有关。建议加强云南省边境地区的口蹄疫防控工作,提高口蹄疫免疫密度和抗体水平,严控边境地区口蹄疫易感动物的无序流动。 廖德芳 苗海生 李乐 寇美玲 王文华 沙丽东 李国华 李华春关键词:口蹄疫 边境地区 抗体检测