国家自然科学基金(30701090) 作品数:14 被引量:24 H指数:3 相关作者: 詹若挺 何瑞 黄琼林 张晓丽 林超 更多>> 相关机构: 广州中医药大学 教育部 广东医学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省自然科学基金 教育部留学回国人员科研启动基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 更多>>
青天葵PAL基因序列特征和表达分析 被引量:3 2016年 在前期完成的青天葵(Nervilia fordii)转录组测序数据的基础上,采用生物信息学方法对3个青天葵PAL基因家族成员(NfPAL1、NfPAL2和NfPAL3)的c DNA序列及其编码蛋白质的氨基酸序列进行特征分析,并计算这些基因在青天葵叶片和球茎中的表达量。结果表明,从转录组数据中获得的3个青天葵PAL基因家族成员c DNA序列长度为1 743-2 091 bp,编码581-697个氨基酸。这些PAL基因编码包含苯丙氨酸解氨酶多功能域,并且不含跨膜结构域、信号肽和转运肽的亲水性稳定蛋白。3个青天葵PAL基因在青天葵中的表达呈组织特异性,其中,NfPAL1和NfPAL3在球茎中的表达量较高,而NfPAL2在叶片中具有较高的表达水平。 黄琼林 何瑞 詹若挺关键词:苯丙氨酸解氨酶 青天葵 生物信息学 药用植物青天葵的悬浮培养条件优化 被引量:5 2012年 以悬浮细胞干重增加率、酶活力为考察指标,研究不同培养基、光照条件、蔗糖浓度、培养基pH值对药用植物青天葵细胞生长的影响,对青天葵悬浮细胞培养方法进行条件优化。结果表明,1/4MS和1/2MS培养物外观形态最佳,1/2MS组培养物干重增加率最大,MDA含量最低,POD含量最高;暗培养条件有利于愈伤组织干重的增加;蔗糖浓度为1%时愈伤组织干重增加率显著高于其他处理组,pH6.0为青天葵悬浮培养的合适pH值,培养基中添加MES可明显提高干重增加率。 张晓丽 梁凌玲 詹若挺 何瑞关键词:青天葵 青天葵HMGR基因片段的鉴定和生物信息学分析 被引量:1 2015年 采用生物信息学对青天葵转录组测序获取的3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶编码基因片段Nf HMGR及其编码蛋白进行功能鉴定和表达分析。结果表明,Nf HMGR基因片段序列长度为1 563 bp,与其他植物HMGR基因的同源性最高可达88%;编码含有521个氨基酸、分子量约为55.34 ku的亲水性不稳定蛋白。Nf HMGR蛋白具有3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶Ⅰ类酶功能域,归属于3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶超级家族,包含3处跨膜结构域,不含任何信号肽、转运肽,二级结构表现为混合型结构蛋白质。在青天葵不同组织中,Nf HMGR基因在球茎中的表达量高于在叶片中的表达量。 黄琼林 何瑞 詹若挺关键词:青天葵 生物信息学 青天葵甲羟戊酸激酶基因的编码蛋白预测和表达分析 被引量:3 2015年 甲羟戊酸途径(mevalonic acid,MVA)是植物三萜类化合物生物合成的主要途径,而甲羟戊酸激酶(mevalonate kinase,MVK)是MVA途径中的关键限速酶之一。根据前期获得的青天葵[Nervilia fordii(Hance)Schltr.]转录组数据,采用生物信息学方法对青天葵MVK基因编码蛋白的理化特性、功能结构域、二级结构、信号肽、跨膜结构域等进行预测,并采用RPKM法分析该基因在青天葵球茎和叶片的表达量。结果表明,Nf MVK基因编码含有383个氨基酸的稳定型亲水性、酸性蛋白质,与其他植物MVK蛋白同源性可达70%。Nf MVK蛋白分子量为41.29 ku,含有甲羟戊酸激酶功能域,归属于GHMP_Kinase超级家族。该蛋白没有任何信号肽、转运肽和跨膜结构域,二级结构为混合型结构的蛋白质。Nf MVK基因在青天葵中的表达趋势为:球茎>叶片。该结果可为后续利用MVK基因调控青天葵三萜类活性成分的合成提供理论依据。 黄琼林 何瑞 詹若挺关键词:青天葵 生物信息学 表达量 青天葵组培扩繁中的污染控制初探 被引量:3 2010年 目的研究青天葵组织培养中的污染问题,并提出防治措施。方法通过对污染的青天葵材料使用无菌水,生理盐水(0.9%NaCl),0.1%升汞,漂渍液和消毒片(次氯酸钠)清洗,对感染植物消毒效果进行研究,并考察了次氯酸钠的灭菌浓度及灭菌时间。结果青天葵组培物使用5%次氯酸钠清洗10min效果较好,可基本抑制污染,植物材料仍能正常生长;升汞灭菌虽可较彻底抑制污染,但对植物伤害较大,只用于对感染的球茎灭菌。结论通过污染控制研究,能提高青天葵组织培养的成功率。 袁源 何瑞 詹若挺关键词:青天葵 抗污染 青天葵1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶基因片段的鉴定和分析 被引量:1 2015年 1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase,DXS)是植物萜类MEP生物合成途径的第一个限速关键酶,提高其编码基因的表达可提高植物萜类化合物的含量。该研究在青天葵全转录组测序数据中获取青天葵DXS基因片段序列,利用生物信息学方法对其系统发育进化、保守功能域、理化性质、亲/疏水性、跨膜结构域、信号肽等进行分析和预测,并采用RPKM法分析其在青天葵叶片和球茎的表达量,为后期利用DXS基因调控青天葵萜类成分的生物合成提供理论依据。结果表明:NfDXS基因片段序列长度为2 154bp,编码含有718个氨基酸、分子量约为77.45kDa的亲水性蛋白,与其它DXS同源性可达80%。NfDXS具有1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶功能域,没有信号肽和跨膜结构域,二级结构表现为混合型结构蛋白质。NfDXS基因在青天葵中的表达趋势为:叶片>球茎。 黄琼林 何瑞 詹若挺关键词:青天葵 表达量 青天葵显微观察分析 被引量:1 2012年 【目的】比较研究小叶、中叶青天葵叶片、叶柄、走茎和球茎及组培芽、组培球茎的显微特征。【方法】采用石蜡切片法对样品叶片、叶柄等部位进行切片,光学显微镜下拍照记录。【结果】小叶与中叶青天葵形状学差异:小叶青天葵叶肉细胞层数较中叶少,叶片较薄;小叶青天葵叶柄背面有6个钝锥形突起,中叶青天葵有7个突起;在小叶青天葵走茎和球茎分别发现有团状分生组织和胚性细胞团,而中叶青天葵仅在球茎观察到分生组织。青天葵组培物与原植物显微切片的主要区别在于:组培芽横切面明显可见维管束10个,呈不规则环状排列,中部维管束不甚明显,组培芽及球茎中均未发现有草酸钙针晶束;青天葵原植物走茎维管束为6个,维管束与周围薄壁细胞区分不显著,而维管束中的导管清晰可见,部分薄壁细胞含有草酸钙针晶束。【结论】小叶和中叶青天葵的叶片厚度、叶柄维管束数目存在差异,青天葵组培物与原植株比较差异较大。 张晓丽 何瑞 詹若挺 马新业 林超 陈蔚文关键词:青天葵 显微鉴别 药用植物青天葵叶片原生质体的制备与纯化 被引量:3 2011年 [目的]研究青天葵原生质体的制备与纯化方法。[方法]以青天葵新鲜叶片为试验材料,以青天葵叶片原生质体产量及原生质体存活率为考察指标,研究了预处理、酶解方式、酶解温度、离心转速、光照、筛网目数等因素对青天葵原生质体分离纯化效果的影响。[结果]适宜青天葵叶片原生质体游离的条件是用浓度13%甘露醇溶液预处理叶片1 h、酶解温度(25±1)℃、黑暗、静置;原生质体纯化采用离心沉淀法,以200目筛网过滤后离心8 min(800 r/min),操作2次,可得到大量完整清晰、细胞碎片少的原生质体。[结论]该方法获得了制备青天葵原生质体的理想条件与参数,为建立青天葵原生质体再生体系提供了依据。 张晓丽 何瑞 童家赟 詹若挺 林超关键词:FORD 叶片 携带芋兰属LATERAL SUPPRESSOR(LS)-EGFP融合基因植物表达载体的构建 被引量:1 2015年 LATERAL SUPPRESSOR(LS)是GRAS家族参与植物分生组织发育的转录因子,是控制植物分枝的关键基因。增强型绿色荧光蛋白基因(EGFP)是目前应用广泛的分子生物学报告基因之一,为筛选转基因植株提供了简便有效的方法。为了探讨LS基因在青天葵及其同属植物广布芋兰中的功能,本研究利用降落-重叠PCR(Touchdown-Overlap Extension PCR,TD-OE PCR)方法,分别构建了两种芋兰属植物LS基因和EGFP融合基因。通过酶切和连接的方法,将融合基因构建到植物双元表达载体p RI 101-AN DNA中,成功获得了两个携带芋兰属植物LS-EGFP融合基因的植物表达载体p RI 101-LS-EGFP,并成功转化至农杆菌,下一步拟用于转化拟南芥,为深入研究该基因功能提供基础。 陈秀珍 梁凌玲 李俊仁 汤小婷 詹若挺 何瑞关键词:青天葵 青天葵DXR基因编码蛋白的生物信息学分析 2016年 为后期青天葵DXR基因的全长克隆、功能鉴定和调控研究奠定基础,采用生物信息学方法对前期通过转录组测序获得的青天葵DXR基因编码蛋白序列进行分析。结果表明:NfDXR序列包含457个氨基酸,分子量约为49.72Ku,为亲水性、混合结构型蛋白质。NfDXR属于1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶超级家族,含有DXR功能域、2个NAPDH结合基序和2个DXR活性位点基序,不具有跨膜结构域和信号肽结构。NfDXR与其他单子叶植物DXR同源性高,其中与铁皮石斛DXR的序列相似度达90%。 黄琼林 何瑞 詹若挺关键词:青天葵 生物信息学