国家高技术研究发展计划(2001AA211031)
- 作品数：3 被引量：87H指数：3
- 相关作者：高丽锋贾继增李永强李宏伟刘曙东更多>>
- 相关机构：中国农业科学院作物品种资源研究所西北农林科技大学中国农业科学院作物科学研究所更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学轻工技术与工程更多>>
- 用生物信息学技术构建cSSR分子标记开发体系被引量：20
- 2004年
- 存在于基因编码区的简单重复序列(又称cSSR或者EST-SSR),既可用作分子标记又可用于基因功能研究。Internet上大量的EST数据为cSSR标记的开发提供了丰富的资源。生物信息学是cSSR分子标记开发的有力工具。笔者构建的cSSR分子标记开发体系包括自行编制的SSR标记发掘程序SSRFinder,生物学家常用的引物设计程序Primer3和DNAstar, 以及遗传定位程序MapMaker和图形显示程序JgeneMap。根据SSR分子标记发掘中存在的问题,提出了SSR分子标记发掘算法,并用此算法编写了程序SSRFinder。利用该程序不但可以从大量的EST序列中发掘cSSR标记,还能比较准确地进行统计和分析。JgeneMap完善了GeneMap的图形显示功能,增加了图片保存及调整图片大小和字体类型、大小的功能,具有友好的用户图形界面。用此体系已从小麦的37 270条EST中挖掘了1228个精确cSSR(perfect cSSR) 和875个复合型cSSR(compound cSSR);根据1228个精确cSSR标记序列成功设计了597对引物,其中478对为有效扩增引物,在小麦遗传图谱上已经定位了66个标记。
- 汤继凤曹永生高丽锋贾继增
- 关键词：生物信息学SSR分子标记小麦
- 一种同时测定小麦种子中直链淀粉、总淀粉含量的新方法——微量分光光度法被引量：20
- 2005年
- 直链淀粉和总淀粉含量是决定小麦品质的重要指标之一,同时又和小麦的保健功能密切相关,小麦优良品种选育和加工研究都需要快速、简便、微量的测定方法。文中以国标GB7648—1987为基础研究出了一种测定小麦种子中直链淀粉、总淀粉含量的新方法——微量分光光度法(MAS)。直链淀粉含量的测定结果表明,在取样10mg、不脱脂、65℃水浴碱溶12h的情况下,10份小麦样品的组内平行实验误差及与国标法测定结果相比的误差皆<2%,在国标允许的误差范围之内。用可溶性淀粉做标准样品绘制标准曲线,即可同时求得总淀粉含量,组内平行试验误差和与国标法相比的组间误差皆<1%,在国标的允许范围之内。研究结果证明,微量分光光度法具有样品用量少(仅为国标法1/10)、无需样品脱脂、碱溶温度低、环境污染小、省时省力、快捷准确、重复性好、便于样品的批量测定等特点。
- 赵永亮
- 关键词：小麦种子直链淀粉含量小麦样品国标法
- 用EST-SSRs研究小麦遗传多样性被引量：49
- 2005年
- 小麦EST-SSRs是从小麦ESTs序列(表达序列标签)中开发的一种新型SSR标记。研究采用35对小麦EST-SSRs标记检测了 96份小麦材料的遗传多样性。结果表明,这些小麦EST-SSRs引物均可获得清晰的预期产物,共检测到129个等位变异,其中87.6%有多态性,大多数引物有2～4个等位变异;其中部分引物可用于普通小麦及其近缘种属的亲缘关系研究,并可根据特征带谱鉴定部分小麦品种;在相似系数为0.745的水平可将人工合成双二倍体小麦材料和一般小麦品种区分开来。与基因组SSR标记相比,EST-SSRs这种新型分子标记来源于表达基因,将其用于小麦遗传研究可直接反映相关基因在不同小麦品种间的表达差异。
- 李宏伟高丽锋刘曙东李永强贾继增
- 关键词：EST-SSRS等位变异双二倍体表达序列标签近缘种
