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橡胶树半胱氨酸蛋白酶基因HbCP3的克隆与表达特性分析被引量：2: 2015年; 半胱氨酸蛋白酶是一类重要蛋白水解酶,其广泛参与植物的生长发育及各种生物与非生物胁迫的应答。根据EST序列信息设计引物,从橡胶树的根中分离到1条1 056 bp的c DNA。该序列包含1个1 023 bp的开放阅读框(ORF),13 bp的5'UTR和20 bp的3'UTR。ORF预测编码340个氨基酸,相对分子质量为37 350,等电点为5.24,属于液泡定位的分泌型蛋白。该蛋白含有1个Inhibitor_I29和1个Peptidase_C1A结构域,可归为木瓜蛋白酶C1家族。该蛋白与蓖麻(Ricinus communis)和杨树(Populus trichocarpa)中同源蛋白的相似性都在80%以上,将基因命名为Hb CP3。表达分析显示,在橡胶树的根、树皮、木质部、芽、叶片、叶柄和乳管等组织中,基因仅在根中表达。; 邹智杨礼富; 关键词：橡胶树半胱氨酸蛋白酶

橡胶死皮相关液泡型水通道蛋白基因TIP1的克隆与序列分析被引量：3: 2013年; [目的]死皮是指橡胶树(Hevea brasiliensis)产排胶过程中出现的一种割线症状,它会造成橡胶减产甚至完全绝收。研究对一死皮相关的水通道蛋白(Aquaporin,AQP)基因进行克隆和序列分析,以探讨AQP在死皮发生过程中的作用。[方法]基于一条在死皮植株中下调表达的EST,研究采用电子克隆和RT-PCR相结合的方法从橡胶树的树皮中扩增出HbTIP1 774 bp的cDNA,在此基础上采用生物信息学对基因的序列特征、编码蛋白的理化特性及进化关系进行了分析。[结果]该cDNA包含759 bp的ORF、8 bp的5’UTR和7 bp的3’UTR;基因预测编码252个氨基酸,理论分子量为25.88 kD,等电点为4.96。生物信息学分析显示,HbTIP1含有1个保守的MIP结构域,6个跨膜螺旋,液泡膜定位,可归为水通道蛋白(Aquaporin,AQP)家族TIP亚族。同源分析显示,HbTIP1与可可(Theobroma cacao)、人参(Prunus persica)、橙子(Citrus sinensis)和蓖麻(Ricinus communis)中同源蛋白的相似性都在90%以上,显示出高度的保守性。[结论]该研究为下一步揭示AQP调控死皮发生机制创造了条件。; 邹智王丹华莫业勇安峰杨礼富; 关键词：橡胶树死皮水通道蛋白

橡胶树AtSAG12同源基因的克隆与表达特性分析被引量：3: 2014年; 本研究以橡胶树为研究对象,采用PCR技术从其根组织中分离到一条长1048 bp的cDNA,并对其进行序列分析。结果表明,该序列包含一1023 bp的开放读码框(ORF),13 bp的5’UTR和12 bp的3’UTR;ORF预测编码340个氨基酸,理论分子量为37.41 kDa,等电点为5.09;蛋白含有1个Inhibitor_I29和1个Peptidase_C1A结构域,与拟南芥SAG12的相似性高达61%,将基因命名为HbSAG12H1。表达分析显示,与AtSAG12在衰老叶片中的特异表达不同,在分析的各种组织中,HbSAG12H1仅在根中被检测到,表现出明显的组织特异性。本研究为下一步的功能研究与利用奠定了基础。; 邹智刘建汀庄美露杨礼富; 关键词：巴西橡胶树拟南芥

橡胶死皮相关水通道蛋白编码基因的克隆与序列分析被引量：4: 2013年; 死皮是指橡胶树(Hevea brasiliensis)产排胶过程中出现的一种割线症状,它是影响橡胶产量的关键因素。研究基于一条在死皮植株中下调表达的EST,采用电子克隆和RT-PCR相结合的方法从橡胶树的树皮中扩增出HbPIP2;2 903 bp的cDNA,该序列包含867 bp的ORF,13 bp的5’UTR和23 bp的3’UTR;基因预测编码288个氨基酸,理论分子量为30.71 kD,等电点为8.20。生物信息学分析显示,HbPIP2;2含有1个保守的MIP结构域,6个跨膜螺旋,细胞膜定位,可归为水通道蛋白(Aquaporin,AQP)家族PIP亚族。同源分析显示,HbPIP2;2与蓖麻(Ricinus communis)、杨树(Populus trichocarpa)、核桃(Juglans regia)和可可(Theobroma cacao)中同源蛋白的相似性都在90%以上,显示出进化的高度保守性。该研究为下一步揭示AQP调控死皮发生的机制创造了条件。; 邹智莫业勇王丹华安锋杨礼富; 关键词：橡胶树死皮水通道蛋白

橡胶树乳管表达多酚氧化酶基因HbPPO1的克隆与分析被引量：1: 2015年; 根据EST序列设计引物,应用RACE和RT-PCR技术从橡胶树的胶乳(乳管细胞的胞质成分)中分离到1条长2 102 bp的c DNA,该序列包含1个1 803 bp的开放读码框(ORF),81 bp的5’UTR和218 bp的3’UTR;ORF预测编码600个氨基酸,其理论分子量为67.88 k Da,等电点为8.56,质体定位;蛋白含有多酚氧化酶特有的Tyrosinase、PPO1_DWL和PPO1_KFDV结构域;蛋白与木薯、蓖麻、麻疯树和胡杨中同源蛋白的相似性分别为85.2%、82.0%、79.8%和78.2%,将基因命名为Hb PPO1。结果表明,在所分析的胶乳、树皮和叶片组织中,基因在胶乳中的表达丰度最高,且其表达水平受乙烯利显著抑制。; 邹智谢贵水莫业勇王丹华杨礼富; 关键词：橡胶树多酚氧化酶乳管胶乳基因

橡胶树Lhcb2基因的克隆与表达特性分析被引量：1: 2015年; 基于从基因组中获得的基因序列,应用RT-PCR技术从橡胶树叶片中分离得到1条849bp的c DNA;该c DNA包含1个798 bp的ORF,编码265个氨基酸,理论分子量为28.66 k D,等电点为5.42,属于叶绿体定位的类囊体膜蛋白;蛋白含有3个跨膜螺旋,2个C端螺旋,1个保守的捕光叶绿素a/b结合蛋白结构域,1个三聚化基序,以及多个类胡萝卜素和叶绿素结合位点,根据进化关系可归为LHCB2亚家族;蛋白与蓖麻、野草莓、可可、葡萄和棉花中同源蛋白的一致性均接近95%,在进化上显示出高度的保守性,将基因命名为Hb Lhcb2.1。表达分析显示,Hb Lhcb2.1倾向于在叶片中表达,且其转录水平随着叶片的成熟而逐渐增加,但随着叶片的衰老而明显下调。; 邹智王丹华戴雪梅朱家立谢贵水; 关键词：橡胶树

橡胶树WRKY家族转录因子HbWRKY75基因的克隆及表达分析被引量：9: 2016年; 从巴西橡胶树无性系PR107的叶片组织中克隆了1个新的WRKY家族转录因子基因,命名为HbWRKY75,其ORF序列长为603 bp,编码201个氨基酸。生物信息学分析表明,HbWRKY75在N端第110-160氨基酸之间含有1个典型的WRKY结构域,属Ⅱ类WRKY转录因子家族成员,与葡萄、大豆、油棕、陆地棉和拟南芥等同类基因序列的同源性分别为92%、85%、71%、63%和57%。实时荧光定量RT-PCR分析表明,HbWRKY75基因在橡胶树叶片组织中的表达量最高,而在叶柄组织中的表达量最低;HbWRKY75基因在橡胶树衰老晚期叶片中的表达量高于其他叶片发育时期;乙烯利、茉莉酸甲酯（MeJA）、聚乙二醇（PEG）、H2O2、NaCl、低温处理及机械损伤均可不同程度地诱导HbWRKY75基因的上调表达;但ABA处理则诱导HbWRKY75基因的下调表达。HbWRKY75可能是与橡胶树叶片衰老和响应乙烯等激素刺激相关的转录因子,并在橡胶树响应NaCl和低温等逆境胁迫中可能发挥调控作用。; 陈晓丽闫栋孙丽娜曾日中杨礼富; 关键词：巴西橡胶树基因表达激素处理逆境胁迫

橡胶树半胱氨酸蛋白酶基因HbCP2的克隆与表达特性分析被引量：3: 2014年; 根据EST和基因组序列设计引物,应用RT-PCR技术从橡胶树的根组织中分离到1条长1056bp的cDNA,该序列包含了1 023 bp的开放读码框(ORF),17 bp的5’UTR和16 bp的3’UTR;ORF预测编码340个氨基酸,理论分子量为37.52 kD,等电点为5.25,属于液泡定位的分泌型蛋白;蛋白含有1个Inhibitor_I29和1个Peptidase_C1A结构域,隶属于木瓜蛋白酶C1家族;蛋白与蓖麻、杨树中同源蛋白的相似性均在80%以上,将基因命名为HbCP2。表达分析显示,在所分析的根、树皮、木质部、芽、叶片、叶柄和乳管等组织中,HbCP2仅在根中被检测到,表现出明显的组织特异性。; 邹智刘建汀庄美露杨礼富; 关键词：橡胶树半胱氨酸蛋白酶

Molecular Cloning and Sequence Analysis of an Aquaporin Gene Related to Tapping Panel Dryness in Rubber Tree( Hevea brasiliensis Muell. Arg. ): 2014年; As a syndrome with tapping incision blocked partly or entirely during latex exploiting in rubber tree( Hevea brasiliensis), " Tapping panel dryness( TPD) " causes great yield losses,thereby becoming the most important factor limiting rubber production. On the basis of an EST down-regulated in TPD-affected rubber trees,a 903 bp cDNA denoted HbPIP2; 2 was isolated from the bark tissue with a combination of in silico cloning and RT-PCR. The cDNA contains an 867bp ORF,13 bp 5'UTR and 23 bp 3' UTR. Sequence analysis indicated that HbPIP2; 2 encodes 288 amino acids with a theoretical molecular weight( Mw) of 30.71 kDa and isolectric point( Pi) of 8. 20. Bioinformatics analysis suggested that the deduced protein is predicted to have six transmembrane helices located to the plasma membrane and harbor one conserved MIP domain that can be grouped into plasma membrane intrinsic proteins( PIPs) of aquaporin( AQP) family. Homology search revealed that the protein shares a similarity of more than 90% with the homologues in Ricinus communis,Populus trichocarpa,Juglans regia and Theobroma cacao,supporting a highly conserved evolution. This study provided basis for further uncovering the regulatory role of AQPs in TPD occurrence.; Zhi ZOUYeyong MODahua WANGFeng ANLifu YANG; 关键词：基因序列分析巴西橡胶树分子克隆水通道蛋白干涸

蓖麻WRKY39基因的鉴别与表达特性分析被引量：2: 2013年; 研究基于已公布的EST数据,采用电子克隆的方法获得了蓖麻WRKY39的基因序列。序列分析表明,该基因包含2个内含子,在释放的基因组中因一碱基G的缺失而被错误注释成2个基因;基因预测编码356个氨基酸,理论分子量为38.95 kD,等电点为9.43;蛋白含有一个保守的WRKY结构域,其基序为WRKYGQK_X13_C_X5_C_X23_H_X1_H,归属于II类d亚类,其保守内含子位于304位的R和305位的G之间;基因的启动子区含有多种激素和胁迫应答相关元件,显示出复杂的转录调控网络及在胁迫应答中的重要功能。基因表达谱分析显示,RcWRKY39在叶片、花、胚乳和种子中都有表达,其中在种子中的表达丰度最高,在叶片和花中次之,在胚乳中最低。; 邹智; 关键词：蓖麻 WRKY转录因子电子克隆生物信息学分析 RICINUS

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