国家林业局948项目(2010-C14)
- 作品数：5 被引量：83H指数：4
- 相关作者：张沅张毅丁向东张勤俞英更多>>
- 相关机构：中国农业大学中国奶业协会北京奶牛中心更多>>
- 发文基金：引进国际先进农业科技计划国家奶牛产业技术体系项目国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生生物学更多>>
- 利用SNP标记进行北京地区中国荷斯坦牛亲子推断的研究被引量：10
- 2012年
- 本研究旨在利用SNP标记对北京地区中国荷斯坦牛群进行亲子推断,并分析场、母牛出生年月、公牛家系对系谱错误率的影响,以期为指导奶牛育种和生产管理提供依据。共选取了255个最小等位基因频率大于0.45的高多态SNPs标记,利用似然法,采用Cervus3.0软件对北京地区84头荷斯坦公牛和1 927头母牛进行亲子推断研究。结果显示,试验群体平均系谱错误率为20.9%,不同的场、出生年份和月份的母牛的系谱错误率有显著差异(P<0.05),而各公牛家系间系谱错误率差异不显著(P>0.05)。结果说明,错误系谱的发生主要是由于牛场本身记录不完善造成的。在我国亟需建立利用遗传标记监测、校正系谱准确性的制度,采取措施提高系谱的准确性,加快我国荷斯坦牛遗传改良进程。
- 郭刚周磊刘林李东张胜利刘剑锋丁向东张毅王雅春张勤张沅
- 关键词：中国荷斯坦牛SNP
- 乳房炎奶牛金黄色葡萄球菌毒素基因的检测及PFGE分型研究被引量：20
- 2011年
- 作者针对临床及亚临床乳房炎奶牛乳汁中金黄色葡萄球菌分离株的毒素基因进行检测和脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因分型,比较2种类型乳房炎金黄色葡萄球菌分离株的差异。无菌法采集奶样,采用国际标准方法从中分离金黄色葡萄球菌,用多重PCR方法扩增nuc基因和mecA基因以确证金黄色葡萄球菌(SA)和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)。进一步用PCR方法检测SA的各种毒素基因(SEs、ETs、TSST-1和PVL基因等)。利用限制性内切酶SmaⅠ对SA基因组DNA进行酶切和PFGE分析,最后利用BioNumerics软件进行聚类分析。结果:19.3%(23/119)的临床乳房炎奶样和14.8%(26/176)的亚临床乳房炎奶样确定为金黄色葡萄球菌阳性样品,分别从中分离鉴定出43株和26株金黄色葡萄球菌,其中临床乳房炎分离株中有5株为mecA基因阳性。临床乳房炎奶牛奶样中检测到SA的SEA、SEB、SED、SEJ和PVL毒素基因,检出率分别为3.8%(1株)、11.5%(3株)、19.2%(5株)、7.7%(2株)和31.2%(10株);亚临床乳房炎奶牛乳样中仅检测到SA的SEA和PVL毒力基因,检出率分别为7.0%(3株)和84.1%(37株)。表明临床与亚临床乳房炎奶牛乳汁中SA菌株携带的毒素基因不一样,SEs可能是临床乳房炎菌株的重要致病基因,PVL可能是亚临床乳房炎菌株的重要致病基因。69株SA使用SmaⅠ酶切分型后,可分为7个大簇、50个基因型,来源相同的SA分型后大部分位于同一簇内。临床乳房炎奶牛乳汁中检测到MRSA菌株,PVL基因在亚临床乳房炎中的检出率为临床乳房炎的2.7倍。PFGE方法能较好的区分临床乳房炎和亚临床乳房炎的SA分离菌株。
- 王新韦艺媛张静周婷梁珍娟杨保伟席美丽夏效东孟江洪俞英
- 关键词：奶牛金黄色葡萄球菌MECA基因毒素基因PFGE分型
- 中国荷斯坦种公牛亲子鉴定及个体识别信息库的建立被引量：4
- 2011年
- 为了构建基于微卫星标记的中国荷斯坦种公牛亲子鉴定及个体识别技术平台,本研究选取国际动物遗传学会(ISAG)推荐的12个微卫星标记(BM1824,BM2113,SPS115,ETH10,TGLA122,ETH225,INRA023,TGLA126,TGLA227,BM1818,ETH003和TGLA53),采用荧光标记毛细管电泳方法,对571头荷斯坦种公牛进行基因型检测。统计结果显示,标记的平均多态信息含量为0.700,平均杂合度为0.735,属于高多态性标记;12个标记的累积排除概率大于0.996,累积一致性概率为4.9×10-13,将其运用于亲子鉴定和个体识别具有很强的检测效率。此外,通过分析每个标记的检测信号峰图特征,将检测结果与商业化试剂盒进行比较以及利用ISAG参考DNA样品进行等位基因统一命名等手段,建立了标准化的微卫星等位基因分型方法,并初步建立起中国荷斯坦种公牛遗传检测信息库。
- 杨超张毅石万海陈绍祜张胜利张沅
- 关键词：种公牛亲子鉴定
- 我国荷斯坦种公牛CVM遗传缺陷基因的分子检测被引量：20
- 2010年
- 研究运用引入酶切位点聚合酶链式反应(PIRA-PCR)方法检测牛脊柱畸形综合症(CVM)在我国荷斯坦种公牛中的携带情况。共检测了来自全国14个公牛站的587头种公牛,结果表明:携带者56头,携带率为9.54%。系谱分析确认40头携带者公牛是Carlin-M Ivanhoe Bell的后代。对公牛信息统计显示,2001—2007年各年度出生的种公牛都保持较高的CVM携带率(8.22%～15.56%)。美国、加拿大和澳大利亚是我国引进公牛的主要来源国,进口公牛的CVM携带率分别为11.37%、3.73%和14.29%。此外,本研究还对我国荷斯坦牛CVM遗传缺陷的控制和CVM携带公牛的利用提出建议。
- 范学华张毅公维嘉谢岩孙东晓王雅春俞英张沅
- 关键词：种公牛CVM荷斯坦牛
- 畜禽基因组选择研究进展被引量：31
- 2011年
- 基因组选择是同时对高密度全基因组标记的选择,也是一种标记辅助选择.此方法能够在提高育种值估计准确性的同时,通过早期选种缩短世代间隔、降低近交、加速遗传进展.随着畜禽高密度全基因组SNP芯片的问世,基因组选择方法正在影响着传统的畜禽遗传评估体系.在多数奶业发达国家,基因组选择方法正逐渐取代传统奶牛遗传评估方法,成为奶牛遗传评估的"标准"方法.近年来,针对基因组选择的方法、影响因素、应用策略和育种方案的研究大量涌现.基因组选择已经成为当前动物、植物及水产生物遗传育种领域的研究热点.本文综述了基因组选择的计算方法、准确性的来源及影响因素以及基因组选择在畜禽遗传育种中的应用现状,同时对当前存在的问题进行总结,并对基因组选择的理论发展和应用前景进行展望.
- 张哲张勤丁向东
- 关键词：标记辅助选择畜禽育种
