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国家自然科学基金(31171234)

作品数:4 被引量:11H指数:2
相关作者:姜成英刘双江刘丽君李小静杨兰更多>>
相关机构:中国科学院西安医学院中国科学院大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划博士科研启动基金更多>>
相关领域:生物学冶金工程更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 4篇生物学
  • 1篇冶金工程

主题

  • 2篇生物冶金
  • 2篇基因
  • 2篇基因组
  • 1篇代谢
  • 1篇蛋白
  • 1篇嗜热
  • 1篇嗜热微生物
  • 1篇嗜酸
  • 1篇酸性
  • 1篇胁迫
  • 1篇耐热机制
  • 1篇耐受
  • 1篇耐受机制
  • 1篇结合蛋白
  • 1篇金属
  • 1篇好客
  • 1篇高温
  • 1篇比较基因组
  • 1篇NACL胁迫
  • 1篇PROTEO...

机构

  • 3篇中国科学院
  • 1篇华东理工大学
  • 1篇河南科技大学
  • 1篇中南大学
  • 1篇西安医学院
  • 1篇中国科学院大...

作者

  • 3篇姜成英
  • 2篇刘双江
  • 1篇刘丽君
  • 1篇尤晓颜
  • 1篇张旭
  • 1篇张巧明
  • 1篇杨兰
  • 1篇李小静

传媒

  • 2篇微生物学报
  • 1篇微生物学通报
  • 1篇Scienc...

年份

  • 1篇2017
  • 1篇2016
  • 2篇2014
4 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
好客嗜酸两面菌W1寡营养酸性热泉环境的适应机制被引量:1
2014年
【目的】从基因组水平揭示好客嗜酸两面菌(Acidianus hospitalis)W1对寡营养酸性热泉环境的适应机制。【方法】使用NCBI非冗余蛋白数据库、Uniport蛋白数据库以及Sulfolobus数据库对好客嗜酸两面菌W1基因组序列进行功能注释,使用KEGG数据库对基因组进行In slico代谢途径重构,在此基础之上,采用比较基因组学方法对代谢途径进行鉴定和完善。【结果】好客嗜酸两面菌W1具备多样化的代谢方式以适应寡营养酸性热泉环境。W1菌株通过3-羟基丙酸/4-羟基丁酸和乙二酸-4-羟基丁酸循环进行CO2固定、通过氧化还原型无机硫化物(Reduced inorganic sulfur compounds,RISCs)获取能量营自养型生长。但W1菌株与模式菌株Acidianus ambivalens的硫代谢方式不同,W1基因组中缺少编码亚硫酸-受体氧化还原酶(SAOR)、腺苷硫酸(APS)还原酶、硫酸腺苷酰转移酶(SAT)和腺苷硫酸:磷酸腺苷转移酶(APAT)的基因。此外,W1菌株可以通过非磷酸化的分支的ED途径和TCA循环进行葡萄糖代谢,糖类和氨基酸转运蛋白以及相应水解酶的存在表明W1能够利用部分有机物营兼性自养型生长。与A.ambivalens不同,W1菌株不能利用H2作为电子供体。【结论】多样化的代谢方式为好客嗜酸两面菌W1更好地适应寡营养酸性热泉环境提供了重要保障,对于W1菌株特有代谢方式的揭示也丰富了对于嗜酸两面菌(Acidianus)属物种代谢多样性的认知。
尤晓颜张巧明郑华军姜成英
关键词:基因组代谢
喜温嗜酸硫杆菌SM-1在不同温度下基因组的可塑性被引量:1
2017年
【目的】驯化得到喜温嗜酸硫杆菌(Acidithiobacillus caldus)SM-1在低于最适生长温度下具有较高生长活力的突变菌株,并认知喜温嗜酸硫杆菌在不同温度下的基因组可塑性。【方法】利用实验室长期进化实验对菌株进行3个温度的驯化:37、40、45°C。运用454测序技术对驯化获得的菌株进行基因组重测序,通过比较基因组分析驯化株基因组单核苷酸位点变化(SNPs),对包含位点变化的基因从功能上进行分类,在此基础上,分析可能与温度适应性相关的基因。【结果】通过不同温度下的长期驯化,得到了在低于最适生长温度下具有较高活力的菌株;重测序结果发现,SM-1基因组具有较好的可塑性,不同温度(37、40、45°C)生长的菌株中,基因组中分别有418、384和347个核苷酸位点发生累计变化,其中3个温度下有20个相同的非同义突变位点,分别分布于编码重金属和毒性抗性系统、DNA甲基化和蛋白乙酰化酶、核酸代谢相关酶类等相关基因上;相比而言,在低于最适生长温度(37、40°C)下生长菌株特有的位点变化涉及能量代谢、信号转导以及DNA/RNA稳定性相关基因;其中,2个低温菌株共同发生位点变化的基因有3个,其中两个编码转座相关的蛋白Atc_1031与Atc_1623,另一个编码假想蛋白Atc_1130,该蛋白分别与外膜蛋白组装因子B和二硫键形成蛋白具有23%和35%的相似性。另外,不同生长温度下相关蛋白中氨基酸的组成也发生变化。【结论】喜温嗜酸硫杆菌SM-1基因组具有较好的可塑性,对于其基因组变化的研究结果为认识微生物温度适应性提供了组学数据。本研究揭示喜温嗜酸硫杆菌(At.caldus)SM-1可能通过多种途径适应向低温过渡生长,既包括微生物通用的环境适应机制,也存在菌株特有的温度适应途径。
李小静江宝塔.穆哈德斯杨兰郑华军彭堂见张旭姜成英刘双江
关键词:生物冶金比较基因组
Proteomic and molecular investigations revealed that Acidithiobacillus caldus adopts multiple strategies for adaptation to NaCl stress被引量:2
2014年
Acidithiobacillus caldus plays an important role in commercial bioleaching.To understand how NaCl stress adaptation occurs in A.caldus,we grew A.caldus strain SM-1 in media containing high NaCl concentrations.SM-1 grew at concentrations of up to 1.0-mol L^(-1)NaCl,but growth was severely inhibited at higher concentrations.Proteomic analysis showed that SM-1 used multiple strategies to respond to NaCl stress.In addition to several heatshock proteins,enzymes involved in proline biosynthesis increased under NaCl stress.In addition,two DNA-binding proteins and a third protein of unknown function(Atc_(1291)),which was subsequently identified as a putative single-stranded DNA-binding protein,were up-regulated in the presence of NaCl stress.These DNA-binding proteins might play a role in response to osmotic stress.Atc_(1291)was cloned and expressed in Escherichia coli.Surprisingly,we found that E.coli BL21/pET28a-atc_(1291)grew to higher cell densities than E.coli BL21/pET28a,regardless of NaCI stress.Homologs to Atc_(1291)were identified in several groups of Proleohacleria.The role of Atc_(1291)in enhancing cell growth needs further investigation.
Xu GuoChengying JiangYuanming LuoMingjiang ZhangAnsgar PoetschShuangjiang Liu
关键词:DNA结合蛋白NACL胁迫
嗜热微生物及在高温生物冶金过程中的应用被引量:7
2016年
嗜热微生物包括中度嗜热微生物和极端嗜热微生物,主要栖息于热泉、火山口、海底热液喷口、高温反应器以及工厂高温废水排放区等自然或人为产生的高温环境中。它们可以生活在40-80°C、甚至更高的温度中,其中有些具备嗜酸性及特殊的代谢类型,在高温生物冶金过程中具有应用潜力。高温生物冶金较传统中温生物冶金更具优势,其能浸出某些难处理矿、解决浸矿过程的钝化问题,以及提高浸出效率等,目前已引起了生物冶金工业的重视。本文概述了应用于生物冶金的主要嗜热微生物的生理特点、耐热机制以及对铁、铜和砷等离子的耐受机制,进一步介绍了嗜热微生物在高温生物冶金中的发展及应用。
刘丽君刘双江姜成英
关键词:嗜热微生物生物冶金耐热机制
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