目的建立食管癌易感基因乙醛脱氢酶2(ALDH2)编码区SNP rs671的LATE(Linear-After-The-Exponential)-PCR非标探针分型技术。方法用Chelex法提取口腔拭子DNA,LATE-PCR技术制备单链,等位基因特异性探针与单链杂交后,在荧光定量PCR仪上通过链融解曲线分析,根据融链峰进行SNP分型。用经PCR-RFLP法分型的已知样本验证本方法的有效性。结果LATE-PCR产物直接链融解曲线分析可以区分GG型和A基因携带者。PCR后加入非封闭探针分析可以鉴别3种基因型。15 bp 3’末端C6氨基修饰的封闭探针,可以在PCR前加入体系,A型、G型任一探针即可准确地鉴别3种基因型。结论LATE-PCR结合非标探针技术,可以实现SNP rs671的简便、快速、闭管分型,可用于食管癌高危个体筛查、法医嫌疑人排查等。
