国家自然科学基金(40576064) 作品数:4 被引量:52 H指数:3 相关作者: 王军 丁少雄 苏永全 王颖汇 庄轩 更多>> 相关机构: 厦门大学 漳州市水产技术推广站 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 轻工技术与工程 更多>>
利用改良Nest-tetra-primer specific PCR技术对两种石斑鱼的鉴别 2009年 云纹石斑鱼(Epinephelus moara)和褐石斑鱼(E.bruneus)为石斑鱼属内近缘种,外形相似常被混淆.本研究改良建立了Nest-tetra-primer specific PCR方法,获得了云纹石斑鱼和褐石斑鱼线粒体DNAND2基因内的3个特异性条带,分别为内参序列NC1(394bp)、特异性条带ND2-M(268bp)和ND2-B(122bp),以及核基因组中核糖体DNAITS1区的5个特异性条带,分别为内参序列NC2(588bp)、NC3(563bp),特异性条带rDNA-M(426bp)、ITS1-M(488bp)和ITS1-B(304bp).研究结果不仅为两种石斑鱼的鉴别提供了稳定、可靠、快捷的特异性分子标记,而且也为鱼类近缘种的DNA鉴别提供了新的途径. 郭明兰 苏永全 张之文 丁少雄 王军关键词:云纹石斑鱼 SPECIFIC PCR 基于16SrDNA部分序列探讨中国近海30种石斑鱼类的分子系统进化关系 被引量:42 2006年 石斑鱼因其种类繁多、分布广泛及缺乏显著的形体特征,使其系统分类的研究颇为困难。为探讨中国近海石斑鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增获得了石斑鱼亚科(Epinephelinae)6属30个种类的线粒体16SrDNA基因片段序列。采用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析,计算了Kimura2parameter遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数,并结合GenBank石斑鱼属的同源序列,以多纹长尾(Pronotogrammusmultifasciatus)和皮氏叫姑鱼(Johniusbelengerii)为外群构建NJ、MP和ML系统树。根据所得分子依据并结合形态学特征,推论如下:1)在本研究的30种石斑鱼中,鳃棘鲈属(Plectropomus)最先分化,并呈明显单系性;九棘鲈属(Cephalopholis)是一个单系群,并且较石斑鱼属(Epinephelus)原始;侧牙鲈属(Variola)的进化地位介于鳃棘鲈属与九棘鲈属之间;2)宽额鲈(Promicropslanceolatus)可以归入石斑鱼属,而驼背鲈(Cromileptesaltivelis)也与石斑鱼属有很近的亲缘关系,甚至可能是石斑鱼属内的特化类群;3)石斑鱼属内部存在两个平行进化的姐妹分支,分支内部的种类组成与地理分布无关,暗示了石斑鱼属早期的分化模式。 丁少雄 王颖汇 王军 庄轩 苏永全 尤颖哲 李祺福关键词:石斑鱼亚科 RDNA 系统进化 斜带石斑鱼不同地理群体遗传变异的微卫星分析 被引量:8 2009年 筛选5对可分析引物对斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)台湾群体和广东群体的DNA多态性进行分析。根据电泳检测结果,平均每个引物获得4.2个等位基因,未发现群体的特异位点。获得2个群体平均观测杂合度(Ho)分别为0.672 1和0.682 6,平均期望杂合度(He)分别为0.647 9和0.544 4,两群体间的遗传分化系数(FST)为0.011 0。统计结果表明,2个群体有着较高的遗传变异性,群体间的遗传分化程度处于多数海水鱼类的平均水平。 王家祺 郭丰 丁少雄 王军关键词:微卫星