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国家科技重大专项(2008ZXl0001-004)
作品数:
1
被引量:13
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相关作者:
李林
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刘伟
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广西壮族自治区2008—2009年HIV-1流行毒株基因型及其分布
被引量:13
2013年
目的了解广西地区目前HIV-1流行毒株的基因型及其分布。方法收集广西地区13个市294名2008--2009年新诊断的HIV感染者血浆标本和背景信息,感染途径主要为异性性传播(86.1%)。采用RT-PCR法分别扩增HIV-1gag.100i全长基因(分别为1584bp和3147bp)及enV基因的C2V3片段(558bp),序列编辑后用Genotyping及Mega5.03工具确定病毒的基因型,用Simplot和RecombinantHIV-1DrawingTool软件进行病毒基冈的重组分析。结果获得全长gag基因序列270条、全长poZ基因序列246条、eltv基因C2V3区序列22:3条,确定272例标本的基因型。CRF01AE占的比例最高(77.6%),其次为CRF08BC(10.7%)和CRF07BC(7.4%),有4例B(B’)亚型、1例G亚型,还有7例未知重组型。性别、民族间病毒基因型分布的差异无统计学意义。7株新型重组毒株有6株以CRF01AE为母株,嵌入B和/(或)c的片段,还有1株为CRF07BC和CRF08BC的二代重组。结论广西地区目前流行的HIV-1毒株以CRF01AE为主,并出现以CRF01-AE为母株嵌入其他毒株基因片段的新型重组毒株,呈现基因组结构复杂化趋势。
刘伟
梁淑家
杨进业
李剑军
王斌
陈立力
李林
刘永健
李敬云
关键词:
艾滋病病毒1型
分子流行病学
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