国家科技基础条件平台建设计划(2005DKA64002)
- 作品数：4 被引量：33H指数：1
- 相关作者：迟学斌朱鹏曹宗雁牛铁赵毅更多>>
- 相关机构：中国科学院中央财经大学中国科学院研究生院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技基础条件平台建设计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术理学电子电信更多>>
- 浅析高性能计算应用的需求与发展被引量：31
- 2007年
- 高性能计算应用在高性能计算技术的支持下为科技创新做出了巨大贡献,并且和高性能计算技术在相辅相成中不断发展.自2004年以来,中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心针对中国科学院在"十一五"期间的高性能计算需求在全院范围内开展了多次调研活动,对中国科学院在"十一五"期间高性能计算的整体需求及各应用领域需求的分布情况有了比较全面的了解,其调研结果对"十一五"中国科学院高性能计算环境建设和高性能计算应用的发展具有良好的借鉴作用.首先介绍了国内外高性能计算应用的发展现状,并结合中国科学院高性能计算环境建设和高性能计算应用的发展情况,分析了"十一五"中国科学院高性能计算的应用需求,最后对我国高性能计算应用的发展前景进行了展望.
- 赵毅朱鹏迟学斌牛铁曹宗雁
- 关键词：高性能计算机网格
- 广义Hermitian特征问题标准化转换的有效并行块算法被引量：1
- 2007年
- 广义Hermitian特征问题并行求解器的性能依赖于所选择的并行算法和矩阵的分布策略等诸多方面.基于块存储和快算法策略,提出了一个新的标准化转化的并行算法,该并行算法将Cholesky分解结合到广义特征问题标准化转换中,降低了已有并行算法的通信开销,并增加了算法的并行性.新算法可显著改善已有并行算法的性能和可扩展性.另外给出了一个有效求解具有多个右端项的三角矩阵方程AX=B的并行块算法.通过自主开发的特征问题并行软件包PSEPS的测试结果表明,并行算法比传统的并行算法快大约1倍,并具有较好的可扩展性.
- 赵永华迟学斌程强
- 关键词：块算法CHOLESKY分解并行计算可扩展性
- TilingArray技术与应用研究进展
- 2008年
- Tiling Array实验技术是从传统的微阵列(microarray)基因芯片技术发展而来,在Tiling Array新技术产生发展的5年间,它已经成为了全基因组生物信息挖掘的主要工具,其高密度、高通量的特性使人们可以从全基因组水平考察生命过程和探索生命奥秘.对Tiling Array技术和应用研究最新进展进行了较为详尽的描述,其中包括Tiling Array技术概述、Tiling Array应用研究、Tiling Array重要的实验和发现以及对这些发现做出所有可能性的预测和解释.除此之外,对Tiling Array表达信号识别算法进行了简明的概述,并对其中3种具有典型意义的算法给出了评价和比较.
- 郎显宇王俊迟学斌
- 关键词：TILINGARRAY生物信息学高通量信号识别
- 药物设计构效关系研究的聚类—判别分析方法被引量：1
- 2007年
- 尝试在药物设计构效关系研究中引入分层聚类与判别分析相结合的数量化方法,并以芳氧基乙酰肼衍生物对单胺氧化酶的抑制率为例,具体说明了该方法的实现步骤和结果分析。该方法所得的结果直观生动,可以在实际实验之前较明显地判别出新样本(化合物)的活性属类,对化合物进行活性预测,以指导新化合物的合成。该方法为药物分子设计中判断未知化合物的生物活性提供了新的思路。
- 胡永宏陆忠华
- 关键词：药物设计构效关系分层聚类
