国家自然科学基金(30700514)
- 作品数：3 被引量：23H指数：2
- 相关作者：徐景升阙友雄许莉萍郭晋隆董萌更多>>
- 相关机构：福建农林大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金引进国际先进农业科技计划国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 甘蔗几丁质酶基因的电子克隆与生物信息学分析被引量：19
- 2011年
- 用电子克隆方法获得甘蔗几丁质酶基因SCCHI1,采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明:SCCHI1基因全长1236bp,包含一个完整的990bp的ORF,编码329个氨基酸。SCCHI1基因属于糖苷水解酶19家族,含有N-端信号肽、交连区、催化区,与高粱等其它植物的几丁质酶基因具有高度的相似性。为SCCHI1基因的分子克隆、功能鉴定和应用提供参考。
- 苏亚春李国印阙友雄郭晋隆徐景升许莉萍
- 关键词：甘蔗几丁质酶基因电子克隆生物信息学
- 甘蔗细胞质型苹果酸脱氢酶基因的克隆及其表达分析被引量：4
- 2012年
- 对甘蔗(Saccharum officinarum L.)叶片全长cDNA文库进行测序,获得了1个细胞质型苹果酸脱氢酶(cMDH)基因的全长cDNA序列,命名为Sc-cMDH。生物信息学分析表明,该基因全长1314 bp,开放阅读框为999 bp,编码332个氨基酸。Sc-cMDH与其他植物cMDH的氨基酸序列同源性高达86.5%～97.0%。Sc-cMDH包含典型的NAD+结合基元T11GAAGQI17和催化基元I184WGNH188,还有相当保守的6个半胱氨酸残基,因此推断该基因为细胞质型NAD-MDH。定量PCR分析结果表明,该基因在甘蔗叶片和根中的表达量高于茎。
- 徐景升阙友雄颜克伟唐唯其许莉萍高三基郭晋隆董萌陈如凯
- 关键词：甘蔗实时定量PCR
