国家重点基础研究发展计划(G20000161)
- 作品数：45 被引量：812H指数：16
- 相关作者：李宁吴常信邓学梅胡晓湘赵兴波更多>>
- 相关机构：中国农业大学四川农业大学河南农业大学更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 猪肝脏组织表达序列标签(ESTs)的初步分析被引量：10
- 2002年
- 构建了猪肝脏组织cDNA文库 ,并对文库中随机挑选的 4 38个克隆的表达序列标签 (ESTs)进行了研究。结果表明 ,在所研究的 4 38个ESTs中 ,186个在猪种中已有匹配序列 ,37个在人类及其它物种中可以找到同源序列 ,2 15个为未知功能基因。试验还测定了文库中 4 5个cDNA克隆的全长插入序列 ,结果表明 ,19个为已知功能基因 ,11个没有发现开放阅读框 ,其它 15个具有开放阅读框 ,但基因的功能未知。这些结果初步代表了肝脏组织的功能基因表达谱。
- 李宁赵志辉刘兆良赵兴波连正兴吴常信
- 关键词：肝脏组织表达序列标签ESTSCDNA文库功能基因组
- 鸡lmbr1基因内含子多态与趾型的关联被引量：4
- 2007年
- 【目的】多趾是丝羽乌骨鸡的品种特征之一,但其多趾发生的分子机制尚未知。Lmbr1基因是人和鼠轴前多趾的关键候选基因,其同源基因是否是鸡多趾表型的关键候选基因值得研究。【方法】本研究以多趾的丝羽乌骨鸡和四趾的白洛克肉鸡杂交建立的资源家系为研究素材,采用直接测序和PCR-SSCP相结合的方法进行了鸡lmbr1基因内含子13的克隆、多态分析及其在不同物种的序列保守性比较、单体型分析及单核苷酸多态与趾型的关联分析。【结果】从内含子13检测到4个SNPs,发现这些单核苷酸多态构成的单体型在丝羽乌骨鸡和白洛克肉鸡间的分布呈现明显的差异,PCR-SSCP基因型在资源家系亲代和F2代均呈现与趾型的显著关联。【结论】鸡lmbr1基因内含子13变异与调控鸡多趾表型的特异性位点紧密连锁,鸡lmbr1基因应是鸡多趾表型的重要候选基因,今后应进一步加大鸡lmbr1基因全基因组水平和其临近区域基因的检测。
- 黄艳群陈文邓学梅李宁邱祥聘吴常信
- 关键词：内含子单核苷酸多态多趾
- 鸡细胞外脂肪酸结合蛋白基因编码区的单核苷酸多态与腹脂性状的相关研究被引量：28
- 2002年
- 以明星肉鸡和丝毛乌骨鸡杂交产生的F2鸡群为实验材料,以鸡细胞外脂肪酸结合蛋白基因为影响鸡脂肪性状的候选基因,对该基因编码区和部分内含子用PCR—SSCP(单链构象多态)法进行单核苷酸多态性检测.其中在检测的内含子中有3处碱基突变;在第5外显子中有一处沉默突变.对鸡腹脂性状进行最小二乘分析,结果表明第9对引物扩增的具有HH型基因片段的鸡与GG,II型相比有较低的腹脂重和腹脂率(P<0.001),表明该基因对于鸡腹脂蓄积具有很大的影响或与控制腹脂性状的主基因连锁.
- 王启贵李宁邓学梅胡晓湘连正兴李辉吴常信
- 关键词：基因编码区单核苷酸多态性腹脂率
- 利用细菌人工染色体文库(BAC)筛选猪乳蛋白基因
- 2001年
- 利用猪细菌人工染色体文库 (porcineBacteriaArtificialChromosome ,pBAC)的两步—四维PCR(twostep 4 DPCR)方法筛选猪乳清酸性蛋白 (WheyAcidicProtein ,WAP) ,αsl 酪蛋白 ,αs2 酪蛋白 ,β 酪蛋白 ,κ 酪蛋白的基因pBAC克隆 ,并提出了BAC基因文库一步—五维PCR(onestep 5 DPCR)筛选基因的方法。
- 赵兴波铃木恒平李宁吴常信
- 关键词：细菌人工染色体
- 香猪肌肉组织cDNA文库的构建及其EST测序成功率的分析被引量：22
- 2002年
- 以香猪背最长肌为实验材料 ,以LambdaZAPII为载体 ,构建了肌肉组织的cDNA文库。结果表明 ,cDNA文库的滴度在 3.4× 10 7pfu/ml以上 ,重组率在 94%以上 ,插入片段大小平均在 1.5kb以上。同时指出 ,如果从 3′端测序 ,多于 30个碱基T的插入片段是造成ESTs测序成功率低的主要因素。
- 王秀利李宁赵志辉冯继东赵兴波李长绿吴常信
- 关键词：香猪肌肉组织CDNA文库成功率
- 中国地方猪种黑素皮质激素受体1基因(MC1R)的单核苷酸多态性被引量：16
- 2004年
- 以黑素皮质激素受体1基因作为影响猪毛色性状的候选基因,应用PCR-SSCP(单链构象多态)法对11个中国地方猪种该基因的编码区进行单核苷酸多态性检测.作为比较,还研究了3个引入猪种.结果发现11个品种的所有个体都存在3个突变:G284A,T309C和T364C,与以往报道中欧洲大黑猪发生的突变相同,推测中国地方猪种的毛色属于显性黑毛色性状.而3个引入猪种发生的突变为68CC,C492T,G728A,与地方猪种有明显区别,二者分属截然不同的毛色遗传体系.黑素皮质激素受体1基因对于中国地方猪种之间毛色的差异没有起到关键的影响作用,但是它可为猪的分子进化研究提供一定的凭据.
- 师科荣王爱国李宁邓学梅
- 关键词：毛色多态性单核苷酸
- 低氧培养早期胚胎克隆小型猪(Sus Scrofa)被引量：26
- 2006年
- 猪的体细胞克隆在人类的异种器官移植方面有着巨大的应用前景.以中国实验用小型猪胎儿成纤维细胞为核供体,从屠宰场采集初情期前母猪的卵巢,卵母细胞体外成熟后去核构建克隆胚胎,重构卵电融合并激活,在7%O2,5%CO2及88%N2的气相条件下NCSU-23或PZM-3培养基培养.给3头代孕母猪移植230枚克隆胚胎,其中一头妊娠足月并产下3头仔猪,生产克隆猪的效率达到1.3%;其中一头健康状况良好,存活至今,毛色及DNA微卫星遗传分析证实为克隆个体.以上结果表明,利用初情期前母猪的卵母细胞,克隆胚胎培养在低氧条件下,是生产克隆猪的一条有效途径.
- 潘登科张运海孙秀柱张健李旭阳李燕顾志良戴蕴平吴常信李宁
- 关键词：卵母细胞体外成熟核移植胚胎培养低氧
- 鸡下丘脑cDNA文库的构建及部分克隆ESTs序列初步分析被引量：17
- 2001年
- 以鸡下丘脑为实验材料，以λｇｔ１０为载体，构建了鸡下丘脑ｃＤＮＡ文库。结果表明，文库的滴度为３．８×１０６，重组率为８０％，插入片段大小集中在１．０～３．０ｋｂ之间。从ｃＤＮＡ文库中随机挑取１０个克隆，并对其ＥＳＴｓ进行了测定和初步分析。经ＢＬＡＳＴｎ和ＦＡＳＴＡ３分析后发现，４个ＥＳＴｓ在鸡中已有同源序列，４个在人或其他物种中也可以找到同源序列，有两个为未知功能基因。所测１０个ＥＳＴｓ序列均已录入ＧｅｎＢａｎｋ。
- 赵志辉李宁刘兆良张玉静吴常信
- 关键词：下丘脑CDNA文库表达序列标签功能基因
- 体细胞克隆牛和转基因体细胞克隆牛的遗传学分析(英文)被引量：4
- 2004年
- 分析了来自同一细胞系的体细胞克隆牛甜甜、庆庆、浒娃及来源同一培养转基因体细胞系转基因体细胞克隆牛九妹、乐娃和 1个妊娠 8个月转基因流产胎牛 8C2以及随机抽取的 1头鲁西黄牛 (LX)、 1头褐斯坦牛 (HS)在 2 4个微卫星位点标记牛的基因型 .结果表明 2 4个多态位点均表现出多态 ,等位基因数为 1～ 5个 ,平均为 3 17个 .根据网上公布的数据 ,按其最高频率计算 ,甜甜、庆庆、浒娃、九妹、乐娃、 8C2与培养细胞系、转基因细胞系间匹配概率为 1 17× 10 -3 6,根据本研究观察到的数据计算 ,匹配概率为 1 90× 10 -2 3 ;而与随机抽取的 1头鲁西黄牛及褐斯坦牛的基因型分别在 2 3和2
- 黄银花徐公瑾杜志强胡晓湘张磊涂剑锋程雪波李宁
- 关键词：体细胞克隆转基因遗传学等位基因
- 鸡lmbr1部分内含子的克隆及其单核苷酸多态性
- 2007年
- 以丝羽乌骨鸡和白洛克肉鸡的基因组DNA为模板,采用PCR产物直接测序的方法进行鸡lmbr1基因部分内含子的克隆、单核苷酸多态性检测。结果表明,试验克隆了鸡lmbr1基因的10～14及16内含子序列,共计4 610 kb,从丝羽乌骨鸡和白洛克肉鸡中检测到67个单核苷酸多态位点(SNPs)。将提交序列与NCBI上公布的红色原鸡基因组序列比较,在这6个内含子内发现40个变异位点,其中20个为新的SNPs。基因组结构分析表明,鸡lmbr1基因约60 kb,为人类lmbr1基因的28%,内含子外显子的剪接方式符合GT-AG法则。
- 黄艳群邓学梅陈文李宁邱祥聘吴常信
- 关键词：内含子基因组结构单核苷酸多态性
