国家科技重大专项(2008ZX10002-020)
- 作品数：5 被引量：17H指数：3
- 相关作者：余龙陈惠李林国邓庆韩泽广更多>>
- 相关机构：复旦大学上海交通大学医学院附属瑞金医院上海大学更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 中国人类功能基因克隆与鉴定研究的文献与专利分析
- 2011年
- 人类基因组计划于20世纪80年代末启动.与此同时,各国的人类功能基因鉴定和克隆工作也相继开展.中国相关领域的研究人员敏锐地意识到对这一新兴领域的探索必将给生命科学和人类健康带来深远的影响,并于20世纪90年代开始相关的研究.为加快中国在该领域的发展步伐,20世纪90年代中期,中国高技术研究发展计划("863"计划)生物领域专家委员会提出了"两个百分之一"的目标,即测序工作量占人基因组测序总量的百分之一,克隆和鉴定的人类功能基因占人类基因总数的百分之一.近20年来,中国在基因组测序和功能基因组研究领域已取得了长足进步.为人们所熟知的成果就是中国承担的人类基因组计划"百分之一"测序任务的完成.然而,关于中国克隆和鉴定人类功能基因"百分之一"的工作则未见有完整报道.本文利用美国国立生物技术信息中心(NCBI)GenBank数据库、PubMed文献搜索工具和中华人民共和国国家知识产权局专利检索数据库,以中国首先发表文章报道人类新基因的克隆与鉴定及人类基因序列是否获得授权专利为筛选标准进行检索分析,截止2011年6月底,确定的由中国报道的人类功能新基因共589个,并且授权的基因序列专利共159条(http://gene.fudan.sh.cn/introduction/database/chinagene/chinagene.html).本文系统地总结了中国在人类功能基因组学研究上的成果,回答了中国在人类功能基因克隆和鉴定方面"百分之一"的工作是否完成的问题.
- 夏燕唐丽莎姚磊万波杨鲜梅余龙
- 关键词：基因克隆基因鉴定
- NGAL基因在原发性肝癌中的表达及其功能分析被引量：6
- 2012年
- NGAL基因是Lipocalin家族成员,与MMP9的功能密切相关,在乳腺癌、食管癌等多种恶性肿瘤中异常表达,为了研究其在原发性肝癌中的表达及功能,通过荧光实时定量PCR法检测了NGAL基因在23对肝癌组织标本中的表达情况.结果显示:在12例肝癌组织中NGAL显著上调表达,占总样本数的52.17%(P<0.05),提示了NGAL基因的表达水平可能与肝癌的发生发展过程有关.通过构建绿色荧光蛋白融合表达载体,用脂质体法转化肝癌细胞株SMMC-7721进行瞬时表达.细胞周期实验显示NGAL的表达可促使SMCC-7721细胞从G1期向S期转化,转化NGAL的细胞中S期细胞显著增多(P<0.05),提示其可能具有促进肝癌细胞生长的功能;细胞凋亡实验发现NGAL的表达可显著抑制低血清诱导下的细胞凋亡率(P<0.05),提示其可能参与抑制肝癌细胞的凋亡.
- 李林国周同侯永敏
- 关键词：原发性肝细胞癌NGAL荧光实时定量PCR细胞周期
- 二阶HMM算法改进及在miRNA靶基因预测中的应用被引量：5
- 2010年
- 隐马氏模型在语音识别和生物信息学中有重要的应用.本文研究二阶隐马氏模型(HMM2)的基本算法,利用归一化和递推原理,改进模型的前向-后向算法及Baum-Welch训练算法并给予证明,使得该算法更容易理解和机器实现,并保证数值稳定性.将HMM2应用到miRNA靶基因预测的后期过滤处理中取得了较好的结果.
- 高松秦殿刚冯铁男马成荣王翼飞
- 人线粒体蛋白编码基因C2ORF47在细胞增殖与凋亡中的作用初探
- 2013年
- 线粒体在真核细胞中扮演着重要的角色,其功能障碍与许多疾病的发生密切相关.在这项研究中,我们鉴定了一个有Tim44样结构域(Tim44-like domain)的人类线粒体蛋白编码基因C2ORF47(chromosome 2openreading frame 47).该基因是从人的睾丸组织中克隆出来的,在人体各种组织中广泛表达.序列比对和进化分析表明,该蛋白质和其同系物在脊椎动物中是保守的.采用免疫荧光技术,我们发现该基因产物定位于线粒体.过表达C2ORF47可以抑制细胞增殖.使用siRNA敲减内源的C2ORF47能促进细胞增殖.此外,敲减C2ORF47会导致糖和血清饥饿引发的细胞凋亡大幅减少.总之,在细胞增殖和由饥饿引发的细胞凋亡的调控中,该基因可能发挥重要作用.
- 刘国卿黄辉星韩丁丁曹立环季国庆余龙
- 关键词：细胞增殖凋亡
- 用于活体成像的小鼠肝癌移植瘤模型的建立被引量：6
- 2012年
- 目的建立可用于活体成像的小鼠肝癌移植瘤模型。方法利用脂质体将荧光素酶表达载体pGL3(LUC/NEO)转染至人肝癌细胞株SMMC-7721、Huh-7、Hep3B、MHCC-97H、HCC-LM6、PLC/PRF/5中,经G418筛选获得稳定表达荧光素酶的细胞克隆。根据体外生物发光情况及细胞的生长特性,从中挑选合适克隆,进行裸鼠皮下接种,建立肝癌移植瘤模型。利用活体成像系统监测肿瘤的生长转移情况,并对肝脏组织进行HE染色分析肿瘤细胞的生长分布特点。结果建立了6株肝癌细胞株的荧光素酶基因稳定表达的亚克隆,并且体外验证了各种细胞株中的荧光素酶活性情况;裸鼠皮下成瘤实验显示了SMMC-7721^(Luc+)、Huh7^(Luc+)、PLC/PRF/5^(Luc+)、MHCC-97H^(Luc+)稳定细胞具有成瘤特性;裸鼠肝脏原位注射肝癌细胞(SMMC-7721^(Luc+)、MHCC-97H^(Luc+)、HCC-LM6^(Luc+)、PLC/PRF/5^(Luc+)),利用活体成像系统能够有效对活体肿瘤生长情况进行监测;裸鼠脾动脉注射肝癌细胞(MHCC-97H^(Luc+)、PLC/PRF/5^(Luc+)),利用活体成像系统能够监测到小鼠肝癌模型的生长状况,之后处死小鼠,对肝脏组织HE染色发现肝癌细胞局部分布于肝脏中。结论本研究成功地构建了可用于活体成像的小鼠肝癌移植瘤模型,模型稳定可靠、直观、灵敏,为肿瘤生长转移机制的研究及抗肿瘤药物的研发提供了重要工具。
- 陈惠李坤雨陈斐严惠明韩泽广邓庆
- 关键词：荧光素酶肝癌移植瘤活体成像
