目的调查黎族3个支系Y染色体上3个短串联重复序列基因座及单倍型的遗传多样性,探讨黎族不同支系的起源与关系。方法对所有样本的3个Y-STR位点进行PCR扩增,产物在ABIPRISMTM377 DNA Sequencer上进行电泳,结果用Genotyper2.5软件进行分型。结果在3个Y-STR基因座,3个支系人群共发现15个等位基因,25种单倍型。本地黎12个等位基因,8种单倍型,杞黎10个等位基因,9种单倍型,亻孝黎10个等位基因,20种单倍型。单倍型的遗传多样性分别为0.611,0.677,0.871。结论调查的3个Y-STR基因座的等位基因分布有较好的地区种族差异,对海南岛黎族起源、迁移以及各群体的相互关系研究有重要意义。