国家杰出青年科学基金(30025003)
- 作品数:5 被引量:16H指数:3
- 相关作者:张勤殷宗俊王春考丁向东白俊艳更多>>
- 相关机构:中国农业大学安徽农业大学更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划国家杰出青年科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 标记辅助导入中不同背景选择方法的比较被引量:8
- 2006年
- 模拟比较了随机选择、标记值选择及BLUP选择3种背景选择方法在标记辅助导入(利用标记辅助将供体群中的一个有利QTL等位基因导入到受体群中)的选择效果。前景选择是借助与目标基因连锁的两侧标记对目标基因进行间接选择。研究结果表明,在背景选择中,利用标记值选择能使受体基因组很快得到恢复,2个世代的回交就能恢复90%以上,4个世代的回交就能完全恢复。利用BLUP选择虽然不能使受体基因组迅速全部恢复,但能使特定的背景性状得到最大的遗传进展。
- 白俊艳张勤丁向东王春考殷宗俊王志鹏
- 关键词:标记辅助导入
- IBD方法精细定位QTL的模拟研究
- 分子遗传标记技术的发展极大地促进了对数量性状基因座(Quantitative Trait Loci,QTL)定位的研究,通过对标记与QTL之间的连锁分析可将QTL定位在一个约10—20cM染色体片段上。进一步提高QTL定...
- 刘会英张勤
- 文献传递
- 利用中国荷斯坦牛定位BTA6上影响产奶性状的QTLs被引量:4
- 2005年
- 为了精细定位牛6号常染色体上55.7cM范围内影响产奶量的QTL,对26个父系半同胞的中国荷斯坦奶牛家系进行了14个微卫星标记的检测,涉及到的女儿牛达2356头.统计分析采用线性回归和方差组分分析两种方法,包括单QTL和双QTL检测.单QTL的线性回归分析发现,作用产奶量、乳脂量、乳蛋白量和乳脂率的QTL均定位于标记BMS470附近,而影响乳蛋白率的QTL则临近标记BMS2460.方差组分法进一步验证了前者有关3个量性状的结论,只是将影响乳脂量的QTL定到了标记BMS1242位置.对于这些QTL置信区间的估计,线性回归法的结果普遍偏大,约在31~53cM的长度范围内,而方差组分法的只有4~5cM.进行双QTL检测时,两种方法均揭示出分别有2个QTL同时存在并制约着3个量性状的表型变化,不过估计出来的QTL位置有所不同.
- 陈慧勇张勤张沅王春考舒娟梅瑰阴层层胡芳徐晶晶公维嘉李何君邱小田
- 关键词:中国荷斯坦牛产奶性状QTLS微卫星标记中国荷斯坦奶牛QTL检测
- 检测cDNA芯片中差异表达基因的非转换方法
- 2006年
- cDNA芯片已经成为生物学试验中一种重要试验手段,与其相应的检测差异表达基因的统计方法也在快速地完善。目前通用的方法是将数据进行对数比转换,并相应进行标准化处理。鉴于对数转换的缺点,本研究提出一种非转换方法,即背景校正后直接进行数据标准化。研究表明:利用这种非转换方法,可以更有效地剔除试验中的“噪音,”提高检测的准确率。本研究利用Apo AI试验的芯片数据进行了效率验证,结果表明:与对数转换方法相比,非转换方法能检测出更多的差异表达基因,可以作为cDNA芯片数据分析的一种简便高效方法。
- 张纪刚殷宗俊张勤
- 关键词:CDNA芯片
- 阈性状QTL定位的系谱传递不平衡检验
- 阈性状是具有一定生物学意义和经济价值的性状,其表型分布不连续,遗传基础又与数量性状相同,由于阈性状的特殊性,传统的数量性状QTL定位方法不能有效地对其进行QTL定位。在人类疾病定位方面广泛采用的是传递不平衡检验(TDT)...
- 丁向东张勤徐如海王雅春
- 关键词:阈性状QTL定位
- 文献传递
- 利用广义线性方法定位家畜抗性等级性状的QTL被引量:3
- 2005年
- 在广义线性模型的框架内模拟研究了家畜抗性等级性状的QTL定位方法,QTL参数的估计采用最大似然方法,比较了阈模型方法与一般线性方法的QTL定位效率,并对影响等级性状QTL定位效率的主要因素(QTL效应、性状的遗传力)进行了模拟研究。试验为多个家系的女儿设计,资源群体大小为500头。结果表明:在QTL位置参数估计及检验功效方面,阈模型方法具有一定的优势,对抗性等级性状QTL定位的功效也高于线性方法。另外,性状遗传力和QTL效应的大小对QTL定位的准确度也有直接的影响,随着性状遗传力QTL效应的增大,2种方法QTL定位的效率均有不同程度的提高。
- 殷宗俊张勤张纪刚丁向东
- 关键词:QTL定位最大似然法
- QTL基因型值对标记辅助导入的影响被引量:2
- 2006年
- 在标记辅助导入QTL的过程中,利用指数法进行背景选择。研究结果表明基因型值的大小对于导入QTL的频率和两个背景QTL的频率以及受体遗传背景的恢复影响很小,对于两个背景性状来说,基因型值较大时要比较小时获得更大的遗传进展。对于前景性状来说,在横交阶段,基因型值较大时要比较小时获得更大的遗传进展;而在回交阶段,结果正好相反。
- 白俊艳张勤丁向东王春考贾小平王志鹏殷宗俊
- 关键词:标记辅助导入