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钌(Ⅱ)多吡啶配合物作为DNA分子光开关研究进展(英文)被引量：3: 2010年; 阐述八面体钌(Ⅱ)多吡啶配合物的光物理和光化学性质.当钌(Ⅱ)多吡啶配合物与DNA作用时,配合物的荧光会发生显著变化,使其能够作为DNA的敏感探针.介绍八面体多吡啶钌(Ⅱ)配合物在DNA结构探针、DNA分子光开关及DNA序列选择断裂试剂等生物无机化学领域的研究进展.评述单核及双核钌(Ⅱ)多吡啶配合物作为DNA分子光开关方面的研究前景与方法,对深入研究新型高效的DNA分子光开关提出建议和看法.; 张黔玲史菊英刘剑洪王明良; 关键词：双核过渡金属离子

高分子链坍塌转变动力学过程的动态蒙特卡罗模拟被引量：5: 2009年; 基于键长涨落格子模型和动态蒙特卡罗模拟方法,引入疏水相互作用,对均聚高分子链坍塌转变动力学过程进行了模拟研究.模拟发现,其坍塌时间呈高斯分布,而平均坍塌时间随淬火深度的变化类似于蛋白质折叠,但难以发现局部最小;另外,平均坍塌时间随链长呈指数形式变化.在其坍塌动力学过程中,高分子链构象先由橄榄球状演变为项链状,进而演变为香肠状,最后形成近球状的熔融球;基于团簇数目、团簇大小和非球面参数等参量,对前人提出的动力学过程四阶段划分进行了更为清晰的界定.; 陈彦涛丁建东; 关键词：动力学过程

蛋白质折叠的计算机模拟(英文): ＜正＞A biological membrane model with implicit lipid segments and implicit water molecules has been constructed ...; Yantao CHEN~*,Mingliang Wang,Qianling Zhang,and Jianhong Liu School of Chemistry and Chemical Engineering,Shenzhen University,Shenzhen Key Laboratory of Functional Polymer,Shenzhen 518060,China Room p309,School of Chemistry and Chemical Engineering,Shenzhen University,Nahhai Ave.No.3688, Shenzhen 518060,China; 文献传递

隐式生物膜模型及E蛋白折叠模拟: 2010年; 受计算速度所限,现有生物膜模拟多集中于膜内多肽链片断,对膜两侧的多肽链片断关注较少.通过构建隐式生物膜模型,在格子空间中针对传染性非典型肺炎冠状病毒E蛋白的全序列进行模拟研究.结果表明,E蛋白在折叠过程中存在两个明显的热力学转变:从无规线团开始,生物膜内较强的氢键相互作用促使螺旋形成,导致coil-helix转变;在疏水相互作用下,膜两侧水溶液中的多肽链片断发生坍塌,导致coil-globule转变;最后形成稳定的跨膜构象,且跨膜序列与已有的预测结果基本符合.相关模拟手段体现了很高的计算效率,为后续的膜蛋白聚集体模拟研究提供了可行方法.; 陈彦涛刘剑洪; 关键词：膜蛋白蛋白质折叠

非天然相互作用对均聚多肽链螺旋形成动力学过程的影响的计算机模拟研究被引量：1: 2010年; 以螺旋结构的形成过程为研究对象,基于粗粒化的格子模型和动态蒙特卡罗模拟方法,初步探讨了非天然氢键相互作用对均聚多肽链螺旋折叠动力学过程的影响.研究发现,非天然氢键的引入虽然延缓了其热力学转变的发生,但也从整体上降低了折叠动力学过程的能垒,在某一特定温度之下,反而可以提高折叠速率.对其折叠路径分布的分析表明,非天然氢键可以减少慢速折叠路径的发生,而后者是导致折叠时间增加的主要因素.另一方面,比较特定温度下多肽链链构象及螺旋片断随时间的演化进程,发现非天然氢键在一定程度上影响了天然氢键的形成以及天然态构象的稳定存在,同时也加快了其部分解折叠过程.这说明,非天然相互作用的存在有利于蛋白质构象的快速动态调整,从而行使其相应的生物功能.; 陈彦涛丁建东; 关键词：动力学过程

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国家自然科学基金(20804023)