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嗜热蛋白酶PH1704别构中心量子化学计算与突变体动力学被引量：6: 2014年; 通过量子化学计算，确定嗜热菌PyrococcushorikoshiiOT3的PHl704蛋白酶别构位点的关键残基为Argll3，Tyrl20和Asnl29．其中，Argll3及Asnl29与别构抑制剂结合，参与别构调控．Tyrl20残基位于亚基交界面附近，并与亲核残基Cys100之间以氢键相连，可通过影响亚基聚合来影响酶的亲核催化．DJ-1超家族的4种构建蛋白的结构显示，120位点位于亚基交界面处，影响亚基的聚合，进而影响蛋白酶的活力，并间接参与别构调控．分子生物学实验显示，突变体R113T／Y120P／N129D的kcat/km（L·μmol^-1·min^-1）值是野生型kcat/km。值的6倍，h系数由野生型的0．86转变为1．3，负协同效应消失．113和129位点处阴离子别构剂脱离，从而破坏113，120和129位点间的封闭环结构，使AC交界面胡螺旋（124～129，524—529）间聚合度增强；120位点残基由rryr转变为Pro，与Cys100间氢键断裂，亲核进攻的阻力减小，从而使酶活力提高，别构负调控消失．; 詹冬玲高楠韩葳葳冯雁; 关键词：嗜热蛋白酶量子化学计算定点突变

角鲨烯合成酶抑制剂的高通量虚拟筛选被引量：2: 2012年; 以SQS抑制剂CP-320473为先导物,在60%结构相似性的基础上,先通过AutoDockVina软件进行分子对接,再选取结合能量最低的新化合物进行分子对接研究.结果表明:zinc_8442249比先导化合物CP-320473的抑制效果更好;SQS活性位点的Lys52通过与氢键与抑制剂结合,在抑制过程中具有重要作用.; 詹冬玲韩葳葳刘景圣; 关键词：分子对接抑制剂

磷酸三酯酶的同源模建及分子对接理论: 2013年; 利用同源模建和分子动力学模拟方法模建了来源于Thermaerobacter marianensis的磷酸三酯酶样内酯酶(PLLs)三维结构.通过与不同底物的对接可知,Arg44与两种底物(磷酸三酯和内酯)均形成氢键,从而Arg44是两种底物与酶结合时重要的氨基酸残基.; 郑文琦赵丽宋亚伟韩葳葳; 关键词：同源模建分子对接

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吉林省自然科学基金(201015109)