浙江省自然科学基金(Y306373) 作品数:4 被引量:24 H指数:4 相关作者: 黄有军 周秦 曾燕如 黄银芝 周丽 更多>> 相关机构: 浙江农林大学 浙江林学院 杭州天目山药业股份有限公司 更多>> 发文基金: 浙江省自然科学基金 国家自然科学基金 浙江省森林培育重中之重学科开放基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
山核桃SSR标记的初步开发 被引量:7 2012年 基于山核桃Carya cathayensis脂肪代谢相关cDNA文库的部分测序结果,发现43条cDNA序列具有简单重复序列(SSR)碱基重复特点,用Primer Premier 5设计了34对表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)引物;建立了适用于山核桃的SSR分析体系,并用设计的SSR引物对对天然群体山核桃40个样品进行了初步的应用性试验。结果表明:34对引物中有4对无扩增产物,3对引物的扩增产物超过了设计范围,27对引物在供试的40个山核桃材料中有较清晰且稳定的目标扩增产物,其中有18对引物的扩增产生了22个多态性位点,占总扩增位点数的47.8%。将SSR标记分析结果与山核桃已有的显性标记分析结果进行比较,发现SSR标记多态性位点的比例较高,且能够区分显性纯合位点及显性杂合位点。结论:设计开发山核桃的EST-SSR标记是可行有效的。 宋双 黄银芝 董雷鸣 黄有军 曾燕如 吴智敏关键词:经济林学 山核桃 CDNA文库 山核桃胚和胚乳总RNA的提取与cDNA的合成 被引量:4 2009年 为了快速高效地提取山核桃胚/胚乳的总RNA,满足后续实验的要求,借鉴Jaakola等的总RNA提取方法,针对山核桃种仁富含油脂及次生代谢物质的特点,对山核桃胚/胚乳总RNA提取的方法进行了改良,这种改良的CTAB法与TRIzol试剂盒法相比,虽然消耗时间较长,但得到的总RNA完整性好,纯度高,所提取的总RNA在体外能成功进行反转录。 周秦 黄有军 曾燕如 毛传澡关键词:山核桃 RNA提取 CTAB 反转录 山核桃脂肪代谢相关cDNA文库的构建 被引量:6 2011年 山核桃Carya cathayensis种仁含油量较高,油质多为不饱和脂肪酸。在差异显示反转录-聚合酶链式反应(DDRT-PCR)方法研究山核桃果实成熟时期基因差异表达的基础上,采用SMART(switching mechanism at 5’end of RNAtranscript)技术构建了山核桃脂肪代谢时期的互补脱氧核糖核酸(cDNA)文库。未扩增文库的滴度为5.0×105个噬菌斑形成单位(pfu).mL-1,插入片段大小为0.7~2.5 kb,70.0%的片段超过1.0 kb;扩增文库的滴度为5.0×109pfu.mL-1,cDNA片段大小均在500 bp以上,重组率达94.5%,66.0%的片段超过1.0 kb。文库的构建为研究山核桃脂肪代谢机制、调控网络及相关基因的发现提供了条件。 黄银芝 周秦 黄有军 曾燕如关键词:经济林学 山核桃 CDNA文库 SMART 脂肪代谢 山核桃成花过程基因表达的cDNA-AFLP分析 被引量:7 2009年 为缩短山核桃Carya cathayensis童期,促进成花,探讨木本植物成花机制,以山核桃为材料,采取成花决定前、成花决定期和成花决定后共3个时段的雌花芽,利用互补脱氧核酸扩增片段长度多态性(cDNA-AFLP)技术克隆成花相关的特异基因片段(TDFs)。试验共获得278个TDFs,经测序和序列同源性分析,其中65个TDFs为未知基因序列,213个TDFs具有同源序列,其功能涉及激素合成、酶合成、细胞信号转导、叶绿体合成和光诱导等。 黄有军 周丽 陈芳芳 周秦 黄坚钦 黄敏仁 王明庥关键词:植物学 山核桃 CDNA-AFLP