广西科技厅资助项目(0991011)
- 作品数：3 被引量：10H指数：2
- 相关作者：李翠萍何敏郑艳燕何晓周颖更多>>
- 相关机构：广西医科大学广西壮族自治区疾病预防控制中心南宁市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：广西科技厅资助项目广西医学科学实验中心开放基金广西高校人才小高地建设创新团队资助计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 利用定量蛋白组学方法发现涂阴肺结核患者血清差异表达蛋白并验证FCN3被引量：1
- 2016年
- 目的:利用定量蛋白组学方法检测涂阴肺结核(SNP-TB)患者血清差异表达蛋白,并验证关键蛋白FCN3。方法:采用iTRAQ标记结合MALDI-TOF/MS筛选30例健康对照者和30例SNP-TB患者血清的差异表达蛋白,并进行生物信息学分析,对关键差异蛋白FCN3进一步ELISA验证,并绘制ROC曲线。结果:3次独立重复实验一共筛选和鉴定到344种蛋白质,其中置信度在95%以上有283种蛋白质;以正常人血清为对照,SNP-TB患者血清中呈显著性差异表达的蛋白有26种(P<0.05);生物信息学分析发现差异蛋白主要定位在细胞外,参与酶抑制剂活性和应激反应过程;蛋白相互作用发现FCN3等9种蛋白处于相互作用网络关键节点;ELISA验证SNP-TB组血清FCN3蛋白表达水平显著低于正常对照组和涂阳肺结核组(P<0.001),与蛋白组学结果一致;ROC曲线下的面积为0.929,灵敏度和特异度分别是81.24%和83.31%。结论:iTRAQ标记结合MALDI-TOF/MS技术能够有效的筛选和鉴定血清差异表达蛋白;FCN3是值得进一步研究的肺结核候选血清标志物。
- 周颖李翠萍何晓李洪涛臧宁郑艳燕何敏
- 关键词：涂阴肺结核差异蛋白
- 蛋白组技术发现和验证耐多药肺结核潜在血清标志物FCN3被引量：2
- 2016年
- 目的利用血清蛋白组学技术筛选和鉴定耐多药肺结核患者血清差异表达蛋白。方法采用i TRAQ标记结合MALDI-TOF/MS筛选健康体检者、肺炎患者和耐多药肺结核患者血清的差异表达蛋白,并进行生物信息学分析;对差异蛋白FCN3进行MRM相对定量验证。结果一共筛选和鉴定到248种蛋白质,其中置信度在95%以上有92种;以正常对照者和肺炎患者血清为对照,在耐多药肺结核患者血清中发现和鉴定出29种差异表达蛋白(P<0.05),其中16种表达显著增高,13种表达显著降低,FCN3在耐多药肺结核患者血清中表达降低(P<0.05);MRM相对定量验证显示,与正常对照组相比,FCN3在肺炎和耐多药肺结核组中积分峰面积分别为0.818 5±0.037 7和0.378 6±0.020 2,FCN3在耐多药肺结核组表达水平明显降低(P<0.005)。结论 MRM验证FCN3的表达水平与血清蛋白组学筛选的结果一致,FCN3可能是耐多药肺结核潜在的血清标志物。
- 黄雪静李翠萍李洪涛周颖何敏
- 关键词：耐多药肺结核基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱标志物
- PCR-膜芯片检测石蜡包埋组织中结核杆菌耐药基因突变被引量：7
- 2012年
- 目的探讨PCR-膜芯片技术检测石蜡包埋组织中结核杆菌耐药基因突变的可行性及其在临床病理中的应用价值。方法采集100例石蜡包埋的肺或淋巴结组织标本(临床诊断为结核患者80例,非结核患者20例),TB膜芯片检测标本中的结核杆菌IS6110基因,阳性者利用12对特异性引物进行多重PCR,扩增产物与含有59个探针的耐药-TB膜芯片反向点杂交检测结核杆菌耐药基因突变并测序验证。结果 TB膜芯片检测石蜡包埋组织标本中的结核杆菌IS6110基因,以临床诊断为标准时,灵敏度为52.5%(42/80),特异度为100%(20/20);以抗酸染色结果为标准时,灵敏度为90.5%(19/21),特异度为61.0%(36/59)。耐药-TB膜芯片检测石蜡包埋组织结核杆菌耐药基因突变,在42例结核杆菌IS6110基因阳性的标本中,检出INH基因突变2例,RFP或SM基因突变各1例,INH、RFP和EMB基因同时突变1例,与测序结果基本符合,提示上述5例可能为耐药结核病。结论应用PCR-膜芯片技术可提高石蜡包埋组织中结核杆菌基因的检出率,耐药-TB膜芯片检测结果可为耐药结核病的病理学诊断提供有价值的参考。
- 谭景尹韦世录李翠萍何晓胡水秀何敏郑艳燕周昌明
- 关键词：结核杆菌石蜡包埋组织耐药基因突变
