国家重点基础研究发展计划(2006CB708512)
- 作品数:17 被引量:36H指数:3
- 相关作者:薄新文赵文娟王新华王正荣康立超更多>>
- 相关机构:新疆农垦科学院石河子大学新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划家畜疫病病原生物学国家重点实验室开放基金新疆生产建设兵团杰出青年创新资金专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生理学更多>>
- 扩展莫尼茨绦虫基因芯片的制作及分析
- 2010年
- 通过EST计划获得1080个基因片段,制备了扩展莫尼茨绦虫cDNA芯片。该芯片一个域有52行、78列,密度为863点/cm2,其中包含1080个靶基因、9个阳性对照、16个阴性对照、8个空白对照,每个基因做3个重复。用扩展莫尼茨绦虫的成节与头颈节总RNA与芯片进行杂交,获得了成节与头颈节基因表达谱,芯片结果分析差异系数为0.1807,共找到91个在扩展莫尼茨绦虫成节高表达基因,幼节高表达基因81个.其他的基因表达差异不大。通过同源性比对分析,成节高表达基因主要有钙调节蛋白、外致密纤维精子尾、富含半胱氨酸蛋白前体和卵黄蛋白原等;头颈节高表达基因主要有果糖-二磷酸盐醛缩酶、皮层细胞蛋白和胶原等。该芯片可以进一步应用于扩展莫尼茨绦虫基因组等方面的研究,对基因表达差异进行高通量检测。
- 张慧赵文娟薄新文王新华李娜
- 关键词:扩展莫尼茨绦虫基因芯片CDNA
- 液相色谱-质谱联用法快速筛选苔类粗提液中双联苄化合物
- 2008年
- 采用电喷雾三重四极杆质谱(ESI-TQ-MS)以负离子扫描方式对15种双联苄对照品进行质谱研究,通过比较质谱碎片信息,对其质谱规律进行解析,并采用液相色谱-电喷雾串联质谱(LC-ESI-MS/MS)法分析地钱(Marchantia polymorphaL.)和花萼苔(Asterella angusta)两种苔类粗提液,快速筛选其中的双联苄类化合物。通过比较色谱和质谱行为特征,并结合紫外吸收光谱数据,分别检测出5/18种和8/16种已知/未知双联苄化合物。该法选择性强、灵敏度高,丰富了对双联苄类化合物裂解规律的研究,并为筛选其他结构类似物提供了参考。
- 吕蓓蓓邢杰谢春锋曲建博娄红祥
- 关键词:苔类植物
- 苔藓植物的化学生态学被引量:5
- 2007年
- 苔藓植物是植物界中的一大类群,其竞争力非常有限,常生长在维管束植物无法生存的环境中。苔藓植物合成的许多次生代谢产物具有调节高等植物生长、抑制微生物、昆虫拒食、抗紫外线辐射以及抗干旱能力,在对抗生态环境中的生物胁迫以及非生物胁迫中发挥重要的作用。
- 吴秀祯娄红祥
- 关键词:苔藓植物化学生态学抗真菌活性植物生长调节
- 扩展莫尼茨绦虫蛋白激酶C相互作用蛋白(PICK1)基因的克隆及序列分析
- 2011年
- 【目的】分离和鉴定扩展莫尼茨绦虫(Moniezia expansa)新基因,为进一步研究该基因的功能奠定基础。【方法】构建扩展莫尼茨绦虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行引物步移法测序,获取其全长cDNA序列;采用生物信息学等分析技术对该cDNA序列进行开放阅读框(ORF)的寻找、编码氨基酸的推导、核苷酸和氨基酸同源性比较及蛋白质二级结构的初步预测。【结果】获得了1个扩展莫尼茨绦虫新基因蛋白激酶C相互作用蛋白,全长1 527 bp,编码447个氨基酸,CDS预测存在明显的BAR,PDZ结构域。编码蛋白的理论分子质量为50.173 3 ku,等电点为5.22。【结论】获得了扩展莫尼茨绦虫蛋白激酶C相互作用蛋白的全长cDNA序列,为该基因功能的试验性鉴定工作奠定基础。
- 赵文娟康立超薄新文王新华
- 关键词:扩展莫尼茨绦虫
- 生物信息学对扩展莫尼茨绦虫cDNA文库Cavβ基因分析与B细胞抗原表位预测
- 2012年
- 【目的】分离和鉴定扩展莫尼茨绦虫(Moniezia expansa)电压门控钙通道β亚基(Cavβ)基因,预测蛋白二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨Cavβ在寄生虫病治疗中所起的作用。【方法】构建扩展莫尼茨绦虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行引物步移法测序,获取全长cDNA序列;采用生物信息学方法对其对应的蛋白进行二级结构和B细胞抗原表位的预测。【结果】获得扩展莫尼茨绦虫Cavβ基因,全长946 bp,编码180个氨基酸,理论分子质量为19.788 8 kD,等电点为5.06,属于Cachannel B超家族。二级结构以无规则卷曲为主,结构预测存在4个可能的B细胞抗原表位。【结论】研究对于扩展莫尼茨绦虫Cavβ基因的获得和B细胞抗原表位的预测,为该基因功能的试验性鉴定工作奠定了基础。
- 赵文娟康立超王正荣薄新文王新华
- 关键词:扩展莫尼茨绦虫B细胞抗原表位
- 扩展莫尼茨绦虫DAZ基因的分离和cDNA序列分析被引量:2
- 2010年
- 为进一步研究扩展莫尼茨绦虫并以其作为模式生物提供基础。通过构建的扩展莫尼茨绦虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行引物步移法测序,获取其全长cDNA序列;采用生物信息学等技术对该cDNA序列进行开放阅读框(ORF)的寻找、编码氨基酸的推导、核苷酸和氨基酸同源性比较以及蛋白质结构的初步预测。结果显示:获得了1个扩展莫尼茨绦虫新基因DAZ基因,cDNA全长1905bp,包含1个完整的ORF,编码562个氨基酸,登录号为:GH291478。蛋白理论分子量为61.3169kD,等电点为4.77,不稳定系数50.27,脂肪系数65.04,总平均亲水性-0.472。二级结构预测该蛋白有1个跨膜区域,以无规卷曲(L)为主,没有二硫键结合位点。本研究成功分离扩展莫尼茨绦虫DAZ基因。
- 赵文娟朱建军吕廷德薄新文王新华
- 关键词:扩展莫尼茨绦虫
- 绦虫成虫制片方法的改进被引量:12
- 2007年
- 目的 制作结构清晰、颜色鲜亮、不易褪色的莫尼茨绦虫成虫染色标本。方法 采用德氏(Delafield)苏木素染色液、盐酸卡红染色液和硼砂卡红染色液等3种染色液分别对莫尼茨绦虫成虫进行染色。结果 用德氏(Delafield)苏木素染色液1:15稀释液,室温染色12h,盐酸酒精分色5~10min,染色效果最好。结论 德氏(Delafield)苏木素染色法,适用于各种大型绦虫成虫的染色标本的制作,在寄生虫学教学科研及动物检疫等方面有很大的使用价值。
- 王运宏薄新文孙延鸣刘继荣郭燕陈琛荣光夏伦斌
- 关键词:莫尼茨绦虫制片方法
- 衣原体属及支原体属阳性与宫颈糜烂相关性研究被引量:3
- 2015年
- 目的探讨衣原体属及支原体属阳性与宫颈糜烂存在的相关性,并研究不同程度宫颈糜烂患者感染衣原体属及支原体属的阳性率。方法于2012年12月-2013年12月收治的326例宫颈糜烂患者中,在排除假丝酵母菌阴道炎患者后,按照数学随机选取的方法抽取180例患者作为试验组,根据临床症状以及血样检测判断其患病程度,并以此将患者分为重、中、轻度患者3组,选取180名宫颈健康者作为对照组,分别对宫颈糜烂患者及宫颈健康者进行宫颈分泌物采样,并检测其衣原体属、支原体属阳性率,数据采用SPSS12.0软件进行统计分析。结果试验组病原体阳性率70.56%,明显高于对照组的20.00%,差异有统计学意义(P〈0.05);试验组20-40岁的性活跃期患者病原体阳性率较高,其中30-39岁年龄段病原体阳性率最高为83.56%,〈20岁患者2例,〉50岁患者4例,判定为阳性者分别为2例和1例,但由于样本数量过少,阳性率差异无统计学意义;试验组患者宫颈糜烂程度的不同其病原体阳性率不同,宫颈糜烂程度越深、阳性率越高。结论衣原体属及支原体属阳性与宫颈糜烂关系密切,宫颈糜烂程度的不同其衣原体属及支原体属的阳性率不同,总体表现为宫颈糜烂程度越深,阳性率越高。
- 张冬梅蔺香云娄红祥
- 关键词:宫颈糜烂衣原体属支原体属
- DAZ基因家族生物学功能的研究进展被引量:1
- 2012年
- 雄性不育是医学界关注的重要问题之一,其病因多种多样,其中精子质量和无精子症基因(DAZ)是2个重要因素。后者即DAZ基因家族,包括DAZ、DAZL和BOULE基因,是精子生成的重要调控因子。DAZ基因家族成员只在生殖细胞中表达,并且它们的蛋白产物均含有一个高度保守的RNA结合序列。DAZ基因家族的无义突变影响雄性或雌性的生殖,DAZ和DAZL基因在生殖细胞的整个生命过程中都有表达,是原始生殖细胞发育以及生殖细胞分化、成熟所必需的;BOULE基因仅在减数分裂期表达,具有特定的生物学功能。DAZ蛋白在体内和体外都可与RNA结合,并有可能参与了mRNA转录后的表达调控,文章仅就近年来DAZ基因家族生物学功能的研究状况作一综述。
- 王正荣薄新文赵文娟
- 关键词:雄性不育
- 用SMART技术构建扩展莫尼茨绦虫成虫全长cDNA文库被引量:3
- 2009年
- 利用SMART(switching mechanismat 5′end of RNA transcript)技术,采用Clontech公司的SMARTTMcDNALi-brary Construction Kit构建扩展莫尼茨绦虫成虫全长cDNA文库。用Trizol Reagent提取总RNA,用Oligotex mRNA Kits分离mRNA,以逆转录酶PowerScriptTM合成第一链cDNA,通过LD-PCR合成并扩增双链cDNA;扩增产物经蛋白酶K消化、SfiⅠ酶切、过SPIN-400TM柱去除小片段,连接到SfiⅠ消化过的pBluescriptⅡSK*质粒载体中,最后将重组质粒转化到E.coliDH5α内得到原始文库,扩增后,将文库保存于96孔细胞培养板中。经测定,构建的cDNA文库滴度为2.52×105PFU/mL;重组率为94.7%,插入片段长度多在0.5~3kb之间,平均长度约1.2kb。经5′端测序获得2642条有效序列,归并为1081条unigene。结果表明成功构建了扩展莫尼茨绦虫成虫全长cDNA文库,获得了较丰富的扩展莫尼茨绦虫成虫表达基因,为筛选扩展莫尼茨绦虫的功能基因全长序列奠定了基础。
- 张慧赵文娟韩猛立王新华薄新文
- 关键词:扩展莫尼茨绦虫CDNA文库SMART