国家自然科学基金(30070053)
- 作品数:7 被引量:68H指数:6
- 相关作者:施苏华黄椰林袁长春龚洵章群更多>>
- 相关机构:中山大学暨南大学湛江师范学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金广东省自然科学基金国家杰出青年科学基金更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 用cpDNA matK基因和nrDNA ITS区序列确定我国特有植物四棱草属的系统位置被引量:9
- 2003年
- 测定了我国特有植物四棱草属以及马鞭草科6属和唇形科13属共27个代表种的叶绿体DNAmatK基因和核核糖体DNA ITS区序列。应用相对表观衍征分析方法(RASA)对所测DNA序列的系统发育信号及所选择外类群的有效性进行了统计评价,应用最大简约法(MP)、邻接法(NJ)和最大似然法(ML)对matK和ITS序列进行了独立的和联合的分子系统发育分析。结果表明,四棱草与三花莸为姐妹群;Contino等提出的莸属复合群不构成单系类群,获属4种具有复系演化关系;Contino系统中的筋骨草亚科形成一个单系分支。此外,本文结果支持马鞭草科与唇形科构成复系类群以及白骨壤属从马鞭草科中独立的观点.
- 施苏华杜雅青David Bufford龚洵黄椰林何航航钟扬
- 关键词:四棱草属马鞭草科CPDNAMATK基因
- 用核糖体DNA的ITS序列探讨滇桐属的系统学位置被引量:9
- 2002年
- 采用PCR直接测序方法 ,对来自椴树科、梧桐科、木棉科 17属的 33个种和作为外类群的锦葵科 2属4个种的核糖体DNAITS区 (含 5 8S区 )序列进行了分析。结果表明 ,滇桐属 (Craigia)与椴树属为姐妹群关系 ,二者构成单系类群 ,因而将滇桐属置于椴树科中较为合理 ;刺果藤属和翅子树属有较近的亲缘关系 ,并与蚬木属和柄翅果属构成一个单系类群 ,二者可能与椴树科有更近的亲缘关系 ;榴莲属与椴树科的破布叶属构成单系类群 ;山芝麻属与椴树科、梧桐科和木棉科构成并系关系 ;因此 ,这些属的系统位置尚需进一步确定。综合分析的结果支持将椴树科、梧桐科和木棉科归并到锦葵科中的观点。
- 袁长春施苏华钟扬龚洵
- 关键词:核糖体DNAITS序列系统学位置系统发育姐妹群梧桐科
- 绿绒蒿自然杂交种及其亲本cpDNA trnL-trnF基因的遗传学分析被引量:12
- 2007年
- 对自然杂交种Meconopsis×cookei及其亲本红花绿绒蒿M.punicea和五脉绿绒蒿M.quintuplinervia的叶绿体DNAtrnL-trnF区进行了序列测定,所得序列的长度为957~961bp,其中M.×cookei的序列长度为960bp,红花绿绒蒿为961bp,五脉绿绒蒿为957bp。利用软件Clustal X对所得序列进行排序和碱基比较,排序后的序列长度为964bp,其中trnLintron为512bp,trnL3′exon为50bp,trnL-trn Fintergenic spacer(IGS)为361bp,还包括41bp的trnF5′端片段。整个trnL-trnF区序列共有25个变异位点,其中杂交种M.×cookei与红花绿绒蒿具有相同碱基的位点有21个(占84%),M.×cookei与五脉绿绒蒿具有相同碱基的位点仅有1个(占4%),余下3个位点(占12%)中,M.×cookei的碱基与两个亲本均不相同。分析结果表明,杂交种M.×cookei的叶绿体基因trnL-trnF来自红花绿绒蒿,根据质体细胞质遗传的规律,从而推测红花绿绒蒿为该杂交种的母本,五脉绿绒蒿为其父本。
- 袁长春何雪宝袁秋梅施苏华
- 关键词:五脉绿绒蒿TRNL-TRNF
- 用核糖体ITS区序列验证自然杂交种Meconopsis×cookei G.Taylor被引量:13
- 2004年
- 对被认为是自然杂交种的绿绒蒿植物Meconopsis×cookeiG .Taylor及其可能的亲本红花绿绒蒿(M punicea)和五脉绿绒蒿 (M .quintuplinervia)的核糖体DNAITS区进行了序列测定 ,所得序列的长度为 6 6 7~ 6 6 8bp ,其中红花绿绒蒿的序列长度为 6 6 7bp ,另外两个种的序列长度均为 6 6 8bp。利用软件ClustalX对所得序列进行排序和碱基比较 ,排序后的序列长度为 6 6 8bp ,其中ITS1长度为 2 5 4bp ,5 8S长度为 16 2bp ,ITS2长度为 2 5 2bp。整个ITS区序列共有 16个变异位点 ,占序列总长度的 2 4 0 % ,其中ITS1的变异位点 9个 ,占 5 6 2 5 % ,占整个序列长度的 1 35 % ;ITS2的变异位点 6个 ,占 37 5 0 % ,占整个序列长度的 0 89% ;5 8S的变异位点 1个 ,占 6 2 5 % ,占整个序列长度的 0 15 %。分析结果表明 ,M .×cookei同时具有红花绿绒蒿和五脉绿绒蒿的两种ITS序列 ,也就是说M .×cookei与红花绿绒蒿和五脉绿绒蒿之间在ITS基因上的变化规律符合孟德尔遗传学定律 ,从而从分子水平上证明M .×cookei是红花绿绒蒿和五脉绿绒蒿的杂交后代。
- 袁长春黎培新王燕芳施苏华
- 关键词:杂交种X五脉绿绒蒿ITS
- 金缕梅亚科ITS序列分析及其系统学意义被引量:12
- 2001年
- 根据金缕梅亚科 2 2属 (活塞花属 Embolanthera除外 )代表种的 nr DNA ITS序列数据构建了分子系统树。结合形态解剖证据 ,金缕梅亚科可分为 3个族 ,即 1木族Loropetaleae Zhang trib.nov.,包括蜡瓣花属 Corylopsis、Maingaya、Matudaea、活塞花属、四药门花属 Tetrathyrium和木属 L oropetalum;2 Dicorypheae Zhang trib.nov.,包括毛枝花属 Trichocladus、Dicoryphe、Neostrearia、Ostrearia、N oahdendron、秀柱花属 Eust igma、牛鼻栓属 Fortunearia、山白树属 Sinowilsonia、Molinadendron;3金缕梅族 Hamamelideae,包括Fothergilla、金缕梅属 H amamelis、Parrotiopsis、水丝梨属 Sycopsis、Parrotia、银缕梅属 Sha-niodendron、蚊母树属 Distylium和拟母树属 Distyliopsis。
- 章群施苏华黄椰林张宏达
- 关键词:NRDNAITS系统发育
- 使君子科风车子亚科核糖体DNA ITS区序列分析及系统学意义被引量:3
- 2001年
- 谈凤笑施苏华黄椰林杜雅青王玉国龚洵
- 关键词:使君子科ITS区核糖体DNA
- 连香树科及其近缘植物matK序列分析和系统学意义(英文)被引量:17
- 2003年
- 测定和分析了连香树科(Cercidiphyllaceae)、交让木科(Daphniphyllaceae)、金缕梅科(Hamamelidaceae)代表植物的叶绿体matK序列(5’端31bps除外),以木兰属作为外类群,应用邻接法构建分子系统树,结果表明:连香树科与水青树科的亲缘关系较远。连香树科、交让木科和金缕梅科形成了一个自展数据支持率(bootstrap)为100%的单系类群,其中金缕梅科枫香属(Liquidambar)、红花荷属(Rhodoleia)和金缕梅属(Hamamelis)虽构成了一个单系类群,但自展数据支持率仅为68%;连香树科与交让木科构成的单系分支自展数据支持率仅为53%。由于连香树科、交让木科、金缕梅科之间的进化距离相当短,表明这3个科之间亲缘关系密切,内部分支的自展数据支持率不高,表明它们之间准确的亲缘关系有待进一步研究。本研究结果与rbcL、aptB、18SrDNA序列分析结果相似,但自展数据支持率更高,表明matK序列分析可应用于较高等级分类群系统发育关系的研究。
- 章群聂湘平施苏华黄椰林谈凤笑张宏达
- 关键词:连香树科MATK序列金缕梅科
- 基于nrDNA ITS序列探讨椴树科部分属间的亲缘关系
- 椴树科(Tiliaceae)是锦葵目(Malvales)中一个中等偏小的科,主要分布于热带及亚热带地区。全科共有46~53属,约450~680种,又分为4个亚科、10个族,我国有5族、13 属、约85种。自从椴树科建立以...
- 袁长春郑少华徐景遂李春丽
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