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江苏省临床医学科技专项(BL2012061)

作品数:3 被引量:7H指数:2
相关作者:周国华邹秉杰王勇李思勤刘云龙更多>>
相关机构:南京军区南京总医院中国药科大学南京大学更多>>
发文基金:江苏省临床医学科技专项国家自然科学基金艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
相关领域:医药卫生生物学更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 3篇医药卫生
  • 1篇生物学

主题

  • 3篇基因
  • 1篇荧光
  • 1篇荧光定量
  • 1篇人类白细胞
  • 1篇人类白细胞抗...
  • 1篇人类白细胞抗...
  • 1篇石蜡
  • 1篇石蜡包埋
  • 1篇实时荧光
  • 1篇实时荧光定量
  • 1篇实时荧光定量...
  • 1篇人基因组
  • 1篇转录
  • 1篇位点
  • 1篇基因表达
  • 1篇基因表达量
  • 1篇基因型
  • 1篇基因组
  • 1篇降解
  • 1篇焦磷酸

机构

  • 2篇南京军区南京...
  • 1篇南京大学
  • 1篇南京医科大学
  • 1篇中国药科大学
  • 1篇中国人民解放...

作者

  • 3篇周国华
  • 2篇邹秉杰
  • 1篇刘云龙
  • 1篇李思勤
  • 1篇李桂梅
  • 1篇唐晓闻
  • 1篇初亚男
  • 1篇张婕妤
  • 1篇封利颖
  • 1篇王勇

传媒

  • 2篇分析化学
  • 1篇临床误诊误治

年份

  • 1篇2016
  • 1篇2014
  • 1篇2013
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
用于高度降解mRNA样本的非反转录基因表达量测定方法
2013年
许多生物样本(如石蜡包埋组织样本)中的mRNA易断裂为小片段,利用传统方法检测较困难。为了测定高度降解的mRNA,本研究针对待测mRNA短片段设计一对探针,当探针与待测模板杂交后,通过连接反应将两条探针5'与3'端相连,连接产物作为PCR扩增模板进行实时荧光定量检测,从而对待测mRNA进行定量测定。以人ACTB基因为待测靶标,通过测定不同浓度的待测靶标及与待测靶标序列不同的RNA片段,分别考察方法的灵敏度与特异性,并检测肺癌石蜡切片样本中ACTB基因的表达量,与传统的反转录定量PCR检测结果进行了对比。本方法的检出限为150 fmol/L,定量线性范围为150 fmol/L~300 pmol/L,并且具有良好的特异性。在对石蜡包埋组织样本中的基因表达量检测时,本方法扩增检测CT值比反转录实时定量PCR小,表明本方法更适合对高度降解的mRNA样本进行定量测定。
唐晓闻李桂梅邹秉杰刘敏周国华
关键词:基因表达量实时荧光定量PCR
不同粪便DNA提取试剂盒及样本储存时间对粪便人基因组DNA提取率的影响被引量:4
2014年
目的比较不同粪便DNA提取试剂盒及粪便样本不同储存时间对粪便人基因组DNA提取效率的影响。方法对18例体检健康者使用QIAamp DNA Stool Mini Kit,MO BIO UltraCleanFecal DNA Isolation Kit,E.Z.N.A.Mag Bind Stool DNA Kit 3种粪便DNA提取试剂盒进行粪便DNA提取,通过紫外分光光度法对总DNA产量和纯度进行分析,通过实时荧光聚合酶链反应(PCR)方法对提取产物中结肠腺瘤性息肉病基因进行定量,并比较人基因组DNA提取效率的差异及不同样本储存时间对其影响。结果在3种试剂盒中,QIAamp DNA Stool Mini Kit对人基因组DNA的提取产量最高(平均67.81 ng/g),E.Z.N.A.Mag Bind Stool DNA Kit提取产物纯度最高(A260/A280平均2.07),MO BIO UltraCleanFecal DNA Isolation Kit操作耗时最短(约40 min);粪便样本在-70℃条件下储存30 d内,不同储存时间对总DNA提取效率差异有统计学意义(P<0.01)。结论 QIAamp DNA Stool Mini Kit对粪便人基因组DNA的提取效率最高,且于-70℃储存粪便样本30 d内对人基因组DNA提取效率无影响。
王勇邹秉杰刘云龙李思勤周国华
关键词:DNA粪便
人类白细胞抗原基因HLA-B*58∶01基因型的快速低成本鉴别方法被引量:3
2016年
采用焦磷酸测序技术和改进的全血基因组提取方法,建立了位于6号染色体的银屑病易感基因1候选基因1(Psoriasis susceptibility 1 candidate 1,PSORS1C1)rs9263726位点的焦磷酸测序方法,检出限达到0.4 ng/μL基因组DNA,20例标本的焦磷酸法和Sanger法测序结果完全一致。利用本方法对683例标本的rs9263726位点进行测序,得到中国人群该位点野生型(GG型)分布频率为87.6%,突变的GA型分布频率为11.7%、AA型分布频率为0.7%。通过对随机选取的46例标本rs9263726位点与人类白细胞抗原基因HLA-B*58∶01基因型的连锁关系进行分析,结果表明,该位点预测HLA-B*58∶01基因型的灵敏度为100%、特异性为91.3%。本方法可用于HLA-B*58∶01基因型的检测。
初亚男张婕妤封利颖周国华
关键词:焦磷酸测序基因型
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