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A Novel Protein Found in Selenium-rich Silkworm Pupas: 2005年; A novel protein was isolated and characterized in selenium-rich silkworm pupas. The peptide mass fingerprint of the protein was found to be new. Partial amino acid sequencing also confirmed to be a new protein. The novel protein had a molecular mass of about 80 kDa in the SDS-PAGE.; De Cong HUQiong LIUHui Bi XUHai Rong CUISi Wang YUXiao Da YANGKui WANG; 关键词：蚕蛹硒 PMF 氨基酸

疟蚊基因组中新硒蛋白的计算机识别被引量：5: 2006年; 硒蛋白的生物合成取决于硒代半胱氨酸插入蛋白质的过程.TGA码既是终止码、又可翻译成硒代半胱氨酸,这使普通基因注释软件无法正确预测硒蛋白,导致现有数据库中许多物种的硒蛋白被错误注释或丢失.本研究基于已公布的疟蚊基因组预测信息、采用PERL语言编程,对疟蚊基因组中的硒蛋白进行了计算机检索与分析.结果表明:以TGA码终止的基因有11365条,其中具有SECIS结构的基因有918条,同时具有半胱氨酸同源类似物的基因58条.再经Sec侧翼序列比对,最终检索到具有硒蛋白全部特点的基因7条.从硒蛋白的基本生物功能推测,冈比亚疟蚊基因组中存在的新硒蛋白可能与疟蚊的氧化耐受特性及其相关蛋白的调控相关联.因此,研究疟蚊硒蛋白将为干涉疟蚊带菌能力、从蚊媒传播途径防止疟疾提供理论基础.; 刘琼姜亮陈平高中洪徐辉碧; 关键词：硒蛋白硒代半胱氨酸基因组生物信息学

家蚕硒蛋白组的计算机识别被引量：1: 2006年; 硒是一种生物必需微量元素,主要以硒蛋白形式发挥生物学功能.硒蛋白的生物合成取决于硒代半胱氨酸插入蛋白质的合成过程.TGA码既是终止码,又可翻译成硒代半胱氨酸,这使普通基因注释软件无法正确预测硒蛋白,导致现有数据库中许多物种的硒蛋白被错误注释或丢失.本研究基于已公布的家蚕基因组预测信息、采用PERL语言编程,对家蚕基因组中硒蛋白进行了计算机检索与分析.结果表明,在家蚕数据库18510个已注释基因中,以TGA码终止的基因有6348条,其中含有SECIS结构的基因249条,兼含半胱氨酸同源类似物的基因52条.再经硒代半胱氨酸(Sec)侧翼序列比对,最终检索到完全具备硒蛋白特点的基因5条,其中谷胱甘肽硫转移酶(GST)是一种已知微生物硒蛋白,而其他4种则是新硒蛋白,分别在已有基因表中被注释为CG6024蛋白,CG5195蛋白,ATP-结合盒转运蛋白A型(ABCA)和核VCP相似蛋白.通过对GST,ABCA和VCP主要性质的分析,推测家蚕硒蛋白在氧化调节、硒储存运输和细胞凋亡等过程中起重要作用.; 陈平段军姜亮刘琼赵萍夏庆友徐辉碧; 关键词：硒蛋白硒代半胱氨酸

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国家自然科学基金(30370352)