广东省粤港关键领域重点突破项目(2009A03090101)
- 作品数：2 被引量：5H指数：1
- 相关作者：欧阳蒲月曾少华莫小路王瑛沈笑飞更多>>
- 相关机构：广东食品药品职业学院中国科学院中国科学院华南植物园更多>>
- 发文基金：广东省粤港关键领域重点突破项目广州市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 广藿香八氢番茄红素合成酶PcPSY1基因克隆和序列分析被引量：1
- 2013年
- 根据已获得的广藿香转录组数据中的PSY转录本序列,利用Primer 3在线设计基因全长扩增引物,采用RT-PCR方法获得广藿香的八氢番茄红素合成酶(phytoene synthase,PSY)基因。并利用在线分析平台和生物软件对该其因进行生物信息学分析。获得的广藿香PSY1基因长1550bp,编码439个氨基酸,命名为PcPSY1,GenBank登录号为KC862310;预测了PcPSY1编码蛋白的结构与功能,且基于PSY基因利用NJ法构建了与21个不同物种间的进化树,进化树表明广藿香PcPSY1基因与桂花的PSY序列亲缘关系最近。成功克隆并分析广藿香PcPSY1基因的全长序列,为进一步阐明广藿香萜类代谢途径奠定基础。
- 欧阳蒲月刘永亮梁永枢曾少华莫小路
- 关键词：广藿香八氢番茄红素合成酶基因克隆生物信息学分析
- 广藿香八氢番茄红素脱氢酶PcPDS1基因克隆和序列分析被引量：4
- 2013年
- 目的为阐明广藿香类胡萝卜素代谢途径,克隆了广藿香Pogostemon cablin八氢番茄红素脱氢酶(phytoene desaturase,PDS)基因,并对其进行相关生物信息学分析。方法搜索本课题组建立的广藿香转录组数据库,获得PDS基因全长序列,并设计全长引物进行PCR验证;利用生物信息学软件对PDS基因进行生物信息学分析。结果本研究获得的广藿香PDS基因命名为PcPDS1(GenBank登录号为KC854409),该基因全长1 960个碱基,编码569个氨基酸。基于生物信息软件分析了PcPDS1基因编码蛋白的理化特性。系统进化树分析结果表明,PcPDS1基因与黄龙胆Gentiana lutea的PDS序列同源性最高,与烟草Nicotiana tabacum、番薯Ipomoea batatas次之,与自然进化关系保持一致。结论成功克隆、分析了广藿香PcPDS1基因。
- 欧阳蒲月沈笑飞曾少华王瑛莫小路
- 关键词：广藿香八氢番茄红素脱氢酶基因克隆生物信息学分析
