教育部“新世纪优秀人才支持计划”(NECT-1207-01) 作品数:15 被引量:57 H指数:6 相关作者: 陈庆山 蒋洪蔚 刘春燕 胡国华 辛大伟 更多>> 相关机构: 东北农业大学 黑龙江省农垦科研育种中心 黑龙江省农业科学院 更多>> 发文基金: 教育部“新世纪优秀人才支持计划” 黑龙江省自然科学基金 中国博士后科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
大豆叶绿素含量QTL定位及候选基因预测 被引量:16 2016年 叶绿素是调节光合作用的关键色素,对籽粒形成有着重要作用。本研究以美国半矮秆大豆Charleston为母本,东北地区主栽品种东农594为父本杂交衍生的147个重组自交系群体为材料,基于经SLAF测序获得的大豆高密度遗传图谱,利用复合区间作图法(CIM)、多重区间作图法(MIM)和完备区间作图法(ICIM)对大豆叶绿素含量进行QTL联合定位分析,并结合大豆基因组基因注释信息对QTL区段内的候选基因进行预测。利用CIM算法定位出2个QTL,表型遗传贡献率分别为6%和9.3%。利用MIM算法定位到了1个QTL,表型遗传贡献率为8.1%。利用ICIM算法定位到了1个QTL,表型遗传贡献率为7.76%。其中qchl-G-1被CIM和MIM两种算法同时检测到。在上述3个QTL区段内共含有151个基因,根据大豆基因组基因注释信息,筛选到了3个与叶绿素相关的候选基因,这些结果为叶绿素含量的遗传剖析和标记辅助育种提供理论基础,有利于分子辅助育种的发展。 李伟 潘校成 于洪潇 齐慧冬 毛新瑞 黄仕钰 王新宇 尹振功 倪忠秋 齐照明 陈庆山关键词:大豆 叶绿素含量 QTL定位 东北地区大豆主栽品种油份蛋白含量的关联分析 被引量:11 2014年 为探寻与大豆油份含量、蛋白含量相关的关键位点,本研究选取中国东北地区92份大豆主栽品种及常用种质资源品种群体基于蛋白含量和油份含量的Meta分析,进行基于数学模型的类群划分评价,估测样本群体的结构,应用简单线性模型分析与大豆油份含量、蛋白含量相关的的位点。结果表明,通过多次迭代测试,当K=5时,即该资源群体可以分为5个亚群时,为最稳定的分类结果,并在显著水平下(p<0.05)贡献率大于1%的标记中,得到与大豆油份含量相关标记有Sat_412,Sat_195,Satt317,Sat_187,Sat_195,Satt255,Satt713,Satt468,Satt267,Satt686,Sat_294和AZ302047,对油分含量的总贡献率为39.54%。蛋白质含量相关标记有Satt683,Sat_311,Satt578,Satt181,Satt317,Satt700,Satt713,Satt255,Sat_242和Satt720对蛋白质含量总贡献率为48.39%。这些重要的标记位点为大豆油份含量和蛋白含量的分子辅助育种提供重要基础。 齐照明 侯萌 韩雪 齐慧冬 蒋洪蔚 辛大伟 朱荣胜 胡振邦 刘春燕 胡国华 陈庆山关键词:大豆 蛋白含量 大豆赖氨酸合成关键酶基因的克隆与定位分析 2018年 为了从大豆中克隆DAPD、DAPE和DHDPR 3个大豆赖氨酸合成关键酶基因,并完成其电子定位和结构分析,借助已构建的本地化表达序列标签(expressed sequence tag,简称EST)数据库,与不同物种的对应基因序列进行比对、拼接,同时利用已构建的大豆整合图谱,完成这3个关键酶基因的电子克隆及电子定位。结果表明,RT-PCR克隆、序列分析的结果与预测序列基本一致。通过电子定位,得到这3个基因分别在J、L和N 3个连锁群上。通过对基因的结构分析,得到DAPD、DAPE、DHDPR 3个基因的c DNA长度分别为1 467、1 080、1 035 bp,g DNA长度分别为4 662、3 728、3 158 bp,外显子数量分别为8、9、8个,内含子数量分别为7、8、7个。研究结果为其他氨基酸合成关键酶基因的克隆提供了参考依据,也为后续基因功能研究以及分子辅助育种打下了良好基础。 于妍 姜威 陈庆山 邱红梅 管宇 蒋洪蔚 李灿东 唐敬仙关键词:大豆 赖氨酸 合成酶基因 电子克隆 用高世代回交群体定位大豆荚粒性状的QTL及上位性分析 被引量:6 2014年 为进一步利用野生大豆资源,挖掘大豆荚粒性状关键基因,以黑龙江省大面积种植推广的绥农14为轮回亲本,野生种ZYD00006为供体亲本进行多代回交和自交,得到157株BC3F3株系,对其单株荚数、单株粒数、分枝数、单株粒重和百粒重进行相关性分析,并利用基于混合线性模型的QTL network 2.0软件和遗传搭车原理的卡方测验两种方法进行QTL定位,同时采用QTL network进行了上位性分析。结果表明:单株荚数和单株粒数都与单株粒重、分枝数极显著正相关,与百粒重极显著负相关。用两种方法共检测到4个单株荚数QTL,分别定位在B2,D1a,G和N连锁群上;5个单株粒数QTL,分别定位在F,J,D2和K连锁群上,其中定位在F连锁群上的Satt425~Satt663用两种方法都可以检测到。单株荚数和单株粒数上位性分析均检测到3对互作位点。 毛彦芝 蒋洪蔚 刘春燕 辛大伟 车京玉 胡国华 陈庆山关键词:单株荚数 单株粒数 QTL定位 大豆粒长、粒宽性状多年的遗传分析与互作位点定位 被引量:1 2016年 大豆的粒形性状主要包括子粒的粒长、粒宽、粒厚和体现形态学的长宽比、长厚比和宽厚比。本研究以Charleston为母本,东农594为父本杂交构建的RIL群体为材料。从2006年种植在东北农业大学农场试验田,采用SEA-DH软件的主基因+多基因混合遗传模型进行了大豆粒长、粒宽性状的遗传分析和基因互作分析。此外,利用自主研发的Gene interaction软件完成了大豆连锁群的互作位点的分子标记分析,利用Circos绘制互作位点连锁群信息。结果表明粒长和粒宽性状主要以2对主基因+多基因的方式遗传,粒长的两对主基因间存在互补作用,粒宽性状的两对主基因间存在互补作用、重叠作用和抑制作用。利用互作软件,2008年粒长中符合率≥85%的互作位点共有261对,代表性的互作对包括Satt202(134.1)/Satt009(0)、Satt202(134.1)/Satt584(107.5)、Satt202(134.1)/Satt440(25.4)。2009年粒宽中符合率≥85%的互作位点共有37对,代表性的互作对包括Satt289(142.1)/Satt009(0)、Satt009(0)/Sat_076(93.3)、Satt200(72.5)/Satt009(0)。 谷月 徐明月 张清秀 金会会 蒋洪蔚 辛大伟 齐照明 刘春燕 胡振帮 陈庆山关键词:大豆 基因互作 利用野生大豆染色体片段代换系定位单株粒重QTL 被引量:4 2016年 以野生大豆ZYD00006为供体亲本,黑龙江省主栽品种绥农14为轮回亲本,连续多年回交并自交,构建了高世代染色体片段代换系BC3F3代161个株行。该群体经多代回交的遗传背景相对一致,大大提高了QTL定位的准确度。结合单因素方差分析法和独立样本T检验法对群体进行QTL定位,共获得9个单株粒重的QTL,分布于7个连锁群。两种方法中均被检测到的有3个QTL,分别为QSW-J-1、QSW-J-2和QSW-G-1;QSW-G-1和QSW-G-2与已有研究结果相吻合;其余7个QTL为新发现QTL,可能是本材料特有位点;其中QSW-J-1的导入片段长度是7.0 c M,且加性效应值为-2.7 g,可作为继续研究的首选位点。 魏思明 陈庆山 蒋洪蔚 尹燕斌 王丹华 胡国华 武小霞 潘校成关键词:大豆 单株粒重 染色体片段代换系 QTL定位 根瘤菌HH103 Ⅲ型效应因子编码基因的突变方法改进 2015年 突变基因的编码序列是研究基因功能的一个有效途径。三亲杂交是利用细菌结合的特性使外源DNA进入受体细胞,通过外源DNA与基因组目标序列发生同源重组,进而实现突变目标基因的有效方法。本研究通过分析同源臂的长度和混合菌比例,明确其对三亲杂交效率的影响。以根瘤菌HH103的芋型效应因子编码基因nop B、nop C、nop L为例,对混合菌(根瘤菌,帮助菌株,供体菌株)的比例和同源臂的长度设置了不同的梯度组合,探讨根瘤菌Ⅲ型效应因子突变的高效方法。结果显示,左右同源臂的长度为521 bp、861 bp时和三种菌混合的比例为2:1:1的因素组合,是突变目标基因最高效的组合方法。本研究所改进方法可为根瘤菌及其它革兰氏阴性菌的基因高效突变研究提供参考。 付营 辛大伟 刘洋 王锦辉 李长育 刘丽敏 于仁敬 尹燕斌 谷月 邱海阳 王雅楠 刘春燕 陈庆山利用野生大豆染色体片段代换系定位百粒重QTL 被引量:10 2014年 利用野生大豆ZYD00006(供体亲本)与黑龙江省主栽品种绥农14(轮回亲本)所构建的高世代(BC3)染色体片段代换系130个株行进行QTL定位。采用基于单标记的方差分析方法检测到25个百粒重相关的SSR位点,为避免由于标记位点共分离而产生的假阳性结果,对方差分析得到的相邻位点进行代换作图分析,最终获得分布于大豆10条连锁群上的19个百粒重相关位点。其中有7个位点与已有研究结果完全一致;2个位点与已有研究结果位置相距0.9和4.6 cM;其余10个位点首次发现,推测是本套材料的特有位点;其中位点QSW-D1a-2加性效应3.6,QSW-H-2加性效应-2.1,片段长度均小于10 cM,可作为继续研究的首选位点。 陈庆山 蒋洪蔚 孙殿君 刘春燕 辛大伟 曾庆力 马占洲 胡国华关键词:大豆 染色体片段代换系 百粒重 QTL定位 基于野生大豆导入系的大豆粒长和粒宽的QTL分析 被引量:1 2015年 以野生大豆ZYD00006(父本)和绥农14(母本)为亲本构建的导入系为定位群体,群体含有102个株系,遗传图谱使用了329个SSR标记位点,针对粒长和粒宽2个籽粒性状进行定位分析。结果表明:有18个位点存在不同性状间被同时检测到的情况,其中与QTL连锁的位点Sat_227、Satt338和Satt568被2个性状同时检测到。通过比较分析也发现3个位点也同时影响着百粒重的大小,进一步通过加性效应分析表明,定位区段对粒长的影响为-10%~15.4%,定位区段对粒宽的影响为-26.72%~2.76%。明确导入位点对粒长和粒宽的影响,可以作为进一步大豆粒长和粒宽相关基因挖掘。 胡振帮 刘航 辛大伟 蒋洪蔚 朱荣胜 陈庆山 齐照明 刘春燕关键词:大豆 粒长 粒宽 野生大豆染色体片段代换系百粒重的选择牵连效应及响应分析 被引量:1 2015年 利用野生大豆导入系群体和多位点扫描分析方法研究了针对百粒重性状的选择牵连效应,找到与百粒重性状相关联的位点,并分析了这些位点在选择条件的响应。随机群体28.10%的位点出现偏分离(P〈0.05),经百粒重选择后等位基因偏分离比例减少,偏分离程度加大。标记异常偏分离率缩小到4.13%和23.14%,卡方值变幅缩小至0~166.67和0.01~81.30。对随机群体和选择群体的供体片段导入频率,在P〈0.05水平下进行卡方分析,定位到与百粒重相关的的12个位点。 王久镇 王丹华 马占洲 谷月 曾庆力 刘春燕 蒋洪蔚 陈庆山关键词:大豆 染色体片段代换系