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荷斯坦奶牛瘤胃微生物元基因组Fosmid文库的构建与分析被引量：10: 2009年; 采用包埋法提取荷斯坦奶牛瘤胃微生物大片段总DNA,纯化后脉冲场电泳回收大小为36-48 kb,与pcc2FOS vector连接,转染至大肠埃希菌EPI 300宿主细胞,构建瘤胃微生物Fosmid基因组文库。对文库进行鉴定,该文库平均插入片段大小约35 kb,共保存30 000个克隆,空载体率小于2%,库容达1050 Mb。; 李旦王加启卜登攀刘开朗李发弟; 关键词：瘤胃微生物 FOSMID文库

2008-2009年反刍动物营养研究进展 Ⅰ.瘤胃微生物多样性与功能被引量：27: 2010年; 作者综述了2008-2009年间在ADSA-ASAS年会和CNKI、PubMed等数据库中与瘤胃微生物分子多态性和元基因组学相关的42篇文献。在瘤胃微生物多样性方面,研究方法不断优化及研究者将研究对象扩大到小品种反刍动物瘤胃微生物,不仅大大丰富了瘤胃微生物多样性数据库,而且表明瘤胃微生物群落组成受到宿主遗传背景、生长发育阶段和健康状态的影响,并且随日粮、季节等环境条件的变化呈现动态变化的特点。在瘤胃微生物的功能方面,主要围绕瘤胃中复杂碳水化合物降解、甲烷代谢及不饱和脂肪酸氢化3个主题,从微生物生理学、基因组学和元基因组学的角度阐述了2009年度的主要进展。尽管瘤胃微生物多样性和功能的相关研究积累了大量研究数据,但瘤胃微生物群落中影响宿主代谢和生产性能的关键功能菌的鉴定、分离、作用模式及其利用等问题仍然悬而未决。综合利用分子生态学、元基因组学和代谢组学等方法,研究瘤胃微生物群落与反刍动物的交互作用,可能成为揭示瘤胃微生物群落与反刍动物生产性能的关系、充分利用瘤胃微生物群落资源的新突破口。; 刘开朗王加启卜登攀; 关键词：瘤胃微生物纤维降解甲烷氢化

瘤胃古菌的多样性研究进展被引量：1: 2010年; 反刍动物瘤胃内由古菌驱动的甲烷生成不仅消耗了6%～10%的日粮能量摄入,而且生成甲烷气体是重要的温室效应气体。在全球气候变化的背景下,瘤胃古菌甲烷代谢调控成为关系畜牧业可持续性发展的重要课题。全面认识瘤胃中古菌多样性是寻找广谱、长效的瘤胃产甲烷调控方法的基础。通过对公共数据库中收录的3 112条瘤胃古菌16S rRNA基因序列进行分类和多样性预测分析,发现现有的古菌特异性引物与一些古菌种属的16S rRNA基因序列之间存在许多错配。瘤胃古菌群落在种属水平上的多样性较低,甲烷短杆菌（Methanobrevibacter）占到总数的70.1%,嗜酸球菌（Picrophilus）和甲烷球形菌（Methanosphaera）分别占13.5%和5.8%。瘤胃产甲烷古菌群落的组成也因受到宿主类型、日粮和环境等多重因素的影响而表现出较大的差异。这些结果拟为寻找一种高效、广谱的瘤胃古菌产甲烷活性的调控方法提供依据。; 刘开朗王加启卜登攀李旦; 关键词：反刍动物 RRNA 多样性甲烷生成

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国家自然科学基金(30972117)